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Michael Hoppert, Martin Krüger, Joachim Reitner, Charles Cockell, "古生菌过去和现在的地球生物化学过程和元素循环",古生菌, 卷。2013, 文章的ID930493, 2 页面, 2013. https://doi.org/10.1155/2013/930493
古生菌过去和现在的地球生物化学过程和元素循环
长期以来,古菌被认为是由局限于狭窄生态位的专家组成的古老的原核生物群。这一观点可能得到了第一批经过充分调查的分离菌的特征的支持,这些分离菌严格厌氧(产甲烷菌)、嗜盐(盐古菌)或嗜热(不同的类群)。然而,这只是冰山一角。古生菌在所有的生态系统中都很丰富。整个领域的代表涵盖了从嗜冷到嗜热的最广泛的生态适应范围。它们能承受最广泛的pH值和盐浓度,并使用所有类型的基质,包括各种有机分子和还原的无机化合物。
如今,有大量的实验工具可供研究人员研究古菌和其他微生物在环境过程中的重要作用。最重要的是,环境DNA和RNA分析为评估特定栖息地的多样性开辟了一条直接途径。Carl R. Woese通过核糖体RNA序列分析和比较评估微生物分类学的开创性发现,以及最近发展的强大的扩增和测序技术,为检测迄今为止未知的新古菌群打开了大门。特别是Crenarchaeota门和Thaumarchaeota门及其在环境循环中的重要意义。其他工具对环境过程的评估也变得更加重要。随着注释基因组的日益可用,宏基因组和元蛋白质组的分析成为可能,现在帮助我们理解微生物群落的代谢过程和网络。脂质的鉴定允许在最近的栖息地甚至化石环境中对特定的原核生物群进行批量定量。最后,显微技术和功能分析帮助我们在结构水平上理解某些环境过程,例如在微生物席中。
《古生菌》杂志的这期特刊从广泛的研究领域探讨了古生菌的代谢、结构和生态多样性的几个方面。
B. weemheuer等的贡献指出了堪察加半岛温泉细菌和古菌的多样性,揭示了变形菌门(Proteobacteria)、热菌门(Thermotogae)和古菌门(Thaumarchaeota)的优势。在第二篇论文中,B. weemheuer等人以盐古菌(盐细菌)为主要的古菌群阐述了海洋栖息地的多样性。甲烷生成是沉积物的关键过程之一。Torres-Alvarado等人在他们的研究中显示了热带河口沉积物中产甲烷菌的丰度和活动在干旱和雨季的变化。L. A. Fernández-Güelfo等人的贡献解决了适用于废水处理的厌氧反应器中甲烷生成的直接过程。a . Siggins等人在以三氯乙烯为底物的厌氧反应器中评估了不同温度下的整个厌氧食物链。x.l.h. Lim等人利用饱和缺氧水土壤中的脂质古菌作为产甲烷菌生物量的生物标志物。C. Wrede等人对产甲烷菌的另一个标记物微生物生物膜进行了评估。甲基辅酶M还原酶由各自的抗体进行原位检测,发现甲基辅酶M还原酶是催化甲烷生成和反路径厌氧氧化甲烷(AOM)的合适指标。C. Wrede等人的另一篇研究文章探讨了AOM过程中的铁生物矿化。 Finally, a review article on Archaea in symbiosis briefly summarizes the diverse symbiotic interactions of Archaea with organisms of all other domains.
我们希望这个问题将支持之前强调的声明:古生菌,作为多样性的细菌,对所有重要的全球元素循环作出贡献。
迈克尔Hoppert
马丁•克鲁格
约阿希姆Reitner
查尔斯Cockell
版权
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