古细菌细胞中假定的病毒防御机制

摘要

有规律间隔的直接重复簇，由非保守的间隔序列分隔，在古染色体中普遍存在，并出现在一些质粒中。一些群集约占染色体DNA的1%。在一些细菌染色体中也出现结构相似的簇，一般较小。虽然早期的研究表明这些簇具有分离/分割功能，但最近的证据表明，间隔序列来源于染色体外成分，主要是病毒。这导致了一种提议，即簇提供了对细胞内病毒传播的防御，并且无论是抑制病毒传播的模式还是簇中添加间隔重复单元的机制，都依赖于簇中转录的rna。此外，假定抑制装置(基于pirna)可能在进化上与干扰RNA系统(siRNA和miRNA)有关，这在真核生物中很常见。在此，我们分析了古菌重复簇的所有现有数据，并对其不同的结构、转录特性和结构发育模式提供了一些新的见解。结果与在重复序列中心加工更大的簇转录本一致，并被外切酶进一步修剪，以产生一个占主导地位的细胞内RNA物种，其大小与间隔物大致相同。此外，分析了广泛的集群硫化叶菌solfataricus菌株P1和P2B为邻近簇的侧翼序列的存在提供了支持，这是在侧翼序列和簇之间引入新的间隔重复单元的先决条件。汇总这些数据的古细菌数据库将保存在http://dac.molbio.ku.dk/dbs/SRSR/上。

古生菌

摘要

版权

更多相关文章

相关文章