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Éric Bapteste, Céline Brochier, Yan Boucher, "古菌的高级分类:产甲烷和产甲烷生物的演化",古生菌, 卷。1, 文章的ID859728, 11 页面, 2005. https://doi.org/10.1155/2005/859728
古菌的高级分类:产甲烷和产甲烷生物的演化
摘要
我们采用系统发育的方法分析了产甲烷生物和产甲烷生物的进化。我们发现23个垂直传递的核糖体蛋白不支持产甲烷菌的单系性,并提出存在两个远亲类群的现存古菌产生甲烷,我们将其命名为I类和II类。基于这一发现,我们随后通过研究产甲烷酶和合成其特定辅酶的蛋白质来研究产甲烷起源的独特性。我们认为,在进化过程中,氢营养产甲烷只发生过一次。参与甲烷化还原二氧化碳(CO .)的七个中心步骤的基因2)在产甲烷菌中普遍存在,并且有着共同的历史。这表明,尽管现存的产甲烷菌从各种底物(CO2如甲酸、醋酸、甲基化C-1化合物),这些古生菌的核心是保守的酶,这些酶几乎没有经历过进化变化。此外,这种产甲烷酶的核心似乎(作为一个整体)起源于所有产甲烷生物的最后祖先,而似乎没有横向传播给其他生物体或在I类和II类成员之间传播。对一种独特的原始甲烷生成形式的观察表明,它被保存在两个独立的谱系中,有些实例具有特化或增加了代谢灵活性。它很可能在盐细菌目、热浆目和古舌生物中消失了。鉴于产甲烷的化石证据可追溯到28亿年前,这一过程的独特起源使产甲烷古菌成为一个非常古老的分类单元。
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