稻草甲基甲基甲酸的成功纳入日本稻田：PCR-DGGE估算和序列分析

抽象的

采用聚合酶链反应-变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析和16S rDNA测序方法，研究了稻田土壤中与稻草分解相关的产甲烷古菌群落的演替和系统发育特征。在旱季和移栽后的洪水条件下，将装有叶鞘或叶片的尼龙袋埋在日本稻田的犁过层中。另外，在春耕时将旱作时埋在稻田中的稻草样品临时移出，移栽时再将旱作时埋在同一稻田中。通过对稻秆样品DNA中16S rRNA基因的扩增，鉴定了产甲烷古菌的居群。在排水条件下，叶鞘和叶片在埋前和埋后均未产生PCR产物，说明在氧化条件下秸秆分解过程中甲烷菌的数量非常少。水稻秸秆在水淹条件下的分解过程中，叶鞘和叶片样品中有许多共同的谱带。基于DGGE模式的聚类分析将中季排水前后的古甲烷群落分为两组。DGGE谱带的序列分析与常见的DGGE谱带密切相关甲基metrobiales.稻簇I。甲基metrobiales.，米饭聚集我和Methanosarcinales在中期排水前的主要成员，而在中季排水后表现甲状腺古群落的DGGE带密切相关甲基metrobiales.。这些结果表明，中季节引流影响了甲状腺原古社区，而不管他们在稻草（鞘和刀片）上的位置，以及在越野季节期间的分解史。

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