生物合成的ribose-5-phosphate和erythrose-4-phosphate古生菌:古细菌基因组的系统发育分析

文摘

系统发育分析磷酸戊糖途径中的基因编码酶(PPP)的一磷酸核酮糖(残余)通路,和chorismate芳香族氨基酸生物合成途径,采用的数据来自13个完整的古细菌的基因组,提供了一个潜在的解释神秘的系统发育的PPP模式基因古生菌。基因和生化证据表明三个热点(Methanocaldococcus jannaschii,热原体属acidophilum和热原体属volcanium)生产ribose-5-phosphate通过nonoxidative PPP (NOPPP),而九种显然缺乏NOPPP但可能采用反向臀部为戊糖的合成途径。一个物种(Halobacteriumsp。NRC-1)缺乏NOPPP和残余途径但可能拥有修改氧化PPP (OPPP),不清楚的细节。转酮醇酶的存在在几个热点,错过了其他两个NOPPP基因的存在可以解释不同要求erythrose-4-phosphate (E4P)古生菌包括:六个物种利用转酮醇酶E4P芳香族氨基酸的前兆,六种显然有另一种生物合成途径和可能不需要让E4P的能力,和一个物种(海床horikoshii)可能不合成芳香族氨基酸。

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