预防医学的进步

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体积 2019年 |文章的ID 4380309 | 10 页面 | https://doi.org/10.1155/2019/4380309

细菌感染和抗生素耐药性模式在埃塞俄比亚:系统回顾

学术编辑器:杰勒德·e·吉兰分担
收到了 2019年3月07
修改后的 2019年7月3日
接受 2019年7月10
发表 05年8月2019年

文摘

背景。抗生素耐药性是一个全球公共卫生领域的挑战,也是一个重大的挑战在埃塞俄比亚。真的很难报告在埃塞俄比亚细菌抗生素耐药模式由于没有进行全面的审查。本系统综述的目的是提供一个概览的文学作品的特定细菌的抗生素耐药模式分离,可以获得不同的临床样本在埃塞俄比亚。材料和方法。网络搜索使用PubMed、谷歌学术搜索网络计划”(Hinari)科学中心,斯高帕斯和开放获取期刊的目录进行了从4月到2018年5月发表的研究没有限制的出版物。文学作品可能被识别的相关研究布尔搜索技术使用不同的关键词:细菌感染,抗生素耐药性抗生素耐药性,药物耐药性,药物敏感性,抗菌阻力,埃塞俄比亚。研究执行敏感性测试使用< 10隔离从动物或健康的来源和方法以外的其他潜在横断面被排除在外。结果。交付的数据库搜索3459的研究。修正案后重复纳入和排除标准,39被发现适合系统综述的文章。所有研究都是潜在的横断面。审查包括12 15革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的耐药模式大约12抗生素。它涵盖了大部分的地区产于埃塞俄比亚。分离株的耐药模式从0%到100%不等。的总阻力结核分枝杆菌对公开药物从0%到32.6%不等。阻力增加的百分比在以前治疗结核病例。淋病奈瑟氏菌属,美国沙门氏菌感染,s Virchow, A组链球菌(气),B组链球菌(GBS)非常敏感的抗生素进行测试。耐甲氧西林金黄色葡萄球菌高度耐大多数抗生素稍微对庆大霉素的易感性增加。结论。总细菌隔离从不同的来源获得的样本和地理区域是28日,包括结核分枝杆菌。大多数细菌分离株对常用抗生素有耐药性。连续监测和研究耐多药细菌隔离措施很重要。

1。介绍

人类一直生活不友好的微生物,可以感染和疾病的一个潜在原因。在细菌感染的情况下,由于引入青霉素治疗在1940年代早期,有一个改善(1]。大多数自然派生从放线菌产生抗生素2,3]。在这一天,虽然仍在努力打败细菌病原体,细菌是通过展现不同形式的发展更加聪明的电阻(4]。

当前抗菌剖面的研究已经证明,细菌可引起医院以及社区获得性感染成为不同群体的锅耐抗生素。因此,这种情况下变成了临床对人类的威胁5- - - - - -13]。大部分的细菌抗生素耐药性机制获得通过改变目标基因或收购的抗性基因质粒编码。这些编码基因可能导致生产裂解酶、膜透性的变化,流出的行动,和隐藏从抗生素的作用14]。

疾病控制和预防中心(CDC)表示,抗生素耐药性负责约200万感染,超过二万人死亡,在美国每年花费550亿美元(15]。国家全球抗生素消费药品销售数据(2000 - 2010)显示,抗生素消费总量增长了超过30%。抗生素使用数量增加最多的记录在低收入和中等收入国家(LMIC) [16]。

只要埃塞俄比亚是中低收入国家的要求之一,抗生素耐药性是一个主要的挑战。然而,没有抗生素管理有助于建立监视系统跟踪当前抗生素的使用及其阻力在埃塞俄比亚。因此,它确实是很难报告细菌抗生素耐药性模式在埃塞俄比亚。所以,本系统综述的目的强调特定的细菌的抗生素耐药模式分离,可以获得不同的临床样本在埃塞俄比亚的上下文。

2。材料和方法

2.1。合格标准

所有可用的研究和数据整合基于预定义的合格标准如下:(1)应该发布和用英语写的,(2)描述了微生物分离、鉴定和抗菌药物敏感性试验方法根据标准的临床实验室标准协会(CLSI)和抗菌素耐药性定义范围按照CLSI手册,(3)研究使用人类感染样本(孤立从患病的个人),(4)必须报告的数量测试隔离(> 10)和耐隔离或敏感的数量吗,(5)应该是一个未来的横断面研究。

2.2。研究选择过程和搜索

的搜索和选择合格的研究是图所示1。更仔细的;网络搜索使用PubMed、谷歌学术搜索网络计划”(Hinari)科学中心,斯高帕斯,开放获取期刊的目录(开放存取)从4月到2018年5月进行的文学潜在的相关研究中被确认。使用各种执行搜索关键词:细菌感染,抗生素耐药性抗生素耐药性,药物耐药性,药物敏感性,抗菌阻力,埃塞俄比亚。这些关键词是用于各种组合使用布尔搜索技术。搜索并不局限于今年出版。

相关搜索结果分别从上述网站下载并确定研究的参考书目中被用来审查确定额外的文章。

2.3。数据提取

基本数据提取符合条件的研究使用Excel电子表格格式准备这个目的和任何不符点被作者解决。数据提取符合条件的研究包括地区的名字,研究区域/城市,作者的名字(s)的研究中,研究设计,类型的标本数量的患者/研究参与者的数量抗性分离,分离株的耐药模式,和引用。

3所示。结果

3.1。文献检索结果

谷歌学术搜索,搜索PubMed Hinari,科学中心,斯高帕斯,开放存取交付3459的研究。修正案副本后,901了。780年这些研究都是被丢弃的,因为,回顾他们的标题和摘要后,他们不符合标准。剩下的121年研究的全文详细综述了。其中,85年研究后被丢弃的全文回顾了适当的学习方法,样本来源,隔离,细菌学的测试标准。最后,39的研究包括在审查(图1)。

3.2。对革兰氏阳性细菌抗生素耐药性

审查试图涵盖12个革兰氏阳性细菌和大约12种抗生素的耐药模式。它涵盖了大部分的地区产于埃塞俄比亚。分离株的耐药模式从0%到100%不等。气体和GBS是高度敏感的测试抗生素,但他们有一个相对增加耐四环素。与这些相比,耐甲氧西林金黄色葡萄球菌抗生素高度耐药的稍微对庆大霉素的易感性增加。其余细菌分离为不同的抗生素有不同的耐药模式也不同样本变量模式(表1)。革兰氏阳性细菌的耐药模式平均显示累计抗生素耐药性的细菌隔离模式从不同的临床情况下,地理位置,类似的样本来源的抗生素。不过,革兰氏阳性细菌的平均阻力范围与详细的耐药模式(图相似2)。


微生物 类型的样本 研究区域 没有隔离的 抗生素和抗(%) 参考
AMP SXT AMC 福克斯 阿霉素 阴极射线示波器 CAF CIP E CN TTC

肺炎链球菌 鼻拭子 GUH 96年 10 22 - - - - - - 0 - - - - - - 0 14 2 - - - - - - 32 - - - - - - 32 (20.]
结膜拭子 西方Gojjam 25 - - - - - - 44 - - - - - - 4 32 4 8 8 (21]
眼拭子 JUSH 20. 65年 5 15 0 5 10 85年 20. (22]
眼拭子 20. 20. 45 0 0 10 10 5 70年 30. (23]

链球菌spp 结膜拭子 西方Gojjam 40 32.5 15 80年 0 40 55 (21]

金黄色葡萄球菌 尿液 Bahir Dar 10 One hundred. 87.5 33.3 50 60 (24]
Mekelle 54 66.7 13 53.7 57.4 38.9 44.4 33.3 (25]
鼻拭子 Adigrat,乌科洛 29日 48.3 51.7 48.3 17.2 37.9 17.2 62.1 37.9 55.2 (26]
眼拭子 JUSH 42 21.4 19.1 23.8 57.1 4.8 35.7 4.8 21.4 (22]
尿液 GUH 28 One hundred. One hundred. One hundred. 50 One hundred. 50 0 (27]
伤口 JUSH 73年 94.5 60.3 28.8 82.2 20.5 69.9 13.7 85年 79.4 16.5 (28]
耳朵放电 HUCSH 48.5 18.2 (29日]
伤口 JUSH 47 95.7 6 27.6 14.9 14.9 4 14.9 4 51 (30.]
热交换器 15 80年 26.7 26.7 20. 0 40 20. 20. 20. 26.7 0 13.3 (31日]
GUH 17 47 58.3 35.3 23.5 29.4 58.8 29.4 35 (32]
眼睛放电 GUH 13 76.9 69.2 53.8 23.1 30.8 15.4 46.2 46.2 61.6 (33]
伤口 Mekelle 40 90年 50 90年 22.5 22.2 90年 (34]
眼拭子 30. 70年 23.3 10 6.7 6.7 6.7 16.7 6.7 60 (23]
眼标本 QOH 40 42.5 27.5 27.5 12.5 22.5 20. 12.5 45 (35]
眼标本 GUH 96年 92.7 7所示。3 17.7 20.8 11.5 7所示。3 7所示。3 28.1 28.1 27.1 (36]
结膜拭子 西方Gojjam 120年 66年 38 30. 80年 13 16.6 21 (21]
标本 YHMC 194年 96.4 53.1 18.5 17.5 18.6 31.4 11.9 53.1 13.4 (37]

耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 标本 YHMC 34 One hundred. One hundred. One hundred. One hundred. 47 82.5 53 One hundred. 38.2 (37]

MSSA 标本 YHMC 160年 95.6 43.1 1。3 3所示。8 12.5 20.6 3所示。1 43.1 8.1 (37]

美国saprophyticus 尿液 量大增; 18 55.6 27.8 88.9 94.4 16.7 72.2 (38]

缺点 GUH 30. 40 53.3 36.6 40 23.3 30. 30. 73.3 (32]
眼拭子 JUSH 15 46.6 6.7 26.7 73.4 0 26.7 53.3 33.3 (22]
眼睛放电 GUH 17 76.5 70.6 64.7 23.5 52.9 23.5 64.7 58.8 64.7 (33]
Mekelle 44 81.8 11.4 61.4 50 25 40.9 18.1 (25]
眼标本 GUH 64年 89.1 23.4 17.2 17.2 15.6 10.9 4.7 42.2 26.6 32.8 (36]
伤口 Mekelle 18 77.8 77.8 72.3 50 50 77.8 (34]
眼拭子 26 30.8 38.5 3所示。8 26.7 26.9 18.2 11.5 23.1 65.4 (23]
结膜拭子 西方Gojjam 110年 80年 41.8 40 81年 (21]
眼标本 QOH 31日 67.7 22.6 29日 9.7 38.7 29日 6.5 58.1 (35]

气体 咽喉拭子 亚的斯亚贝巴 52 0 0 0 0 0 34.6 (39]
尔达瓦 16 0 0 0 0 0 75年 (39]
贡德尔 22 0 0 0 0 0 59.1 (39]

Enterococci spp 结膜拭子 西方Gojjam 25 One hundred. 25 8 72年 (21]
尿,伤口,血 GUH 24 66.7 68年 70.8 70.8 64年 68年 (40]

粪大肠 尿液 量大增; 14 7所示。1 73.5 7所示。1 7所示。1 85.8 0 78.6 (38]
凳子上,直肠拭子 Jimma 34 14.7 73.5 61.8 73.5 26.5 94.1 (41]

大肠都有效 凳子上,直肠拭子 Jimma 40 87.5 27.5 87.5 97.5 75年 92.5 (41]

GBS 阴道拭子 Mekelle 19 0 5。3 0 0 (42]

标本 :鼻拭子,从伤口脓,耳朵放电、血、咽喉拭子,眼拭子,阴道分泌物,尿道分泌物,尿液、粪便、痰液、脑脊液、和体液;脓 :收集从麻风病溃疡;AMP:氨苄青霉素;SXT:功效;AMC: Amoxicillin-Clavulanic酸;阿霉素:强力霉素;阴极射线示波器:头孢曲松钠;CAF:氯霉素;CIP:环丙沙星;大卫·爱登堡:克林霉素;艾凡:红霉素; CN: Gentamicin; TTC: Tetracycline; FOX: Cefoxitin; GUH: Gonder University Hospital; JUSH: Jimma University Specialized Hospital; CONS: Coagulase-negative Staphylococcus; HUH: Hawassa University Hospital; GAS: Group A Streptococcus; GBS: Group B Streptococcus YHMC: Yekatit 12 Hospital Medical College; QOH: Quiha Ophthalmic Hospital; AAML: Arsho Advanced Medical laboratory; HUCSH: Hawassa University Comprehensive Specialized Hospital MRSA: Methicillin-Resistant金黄色葡萄球菌;MSSA: Methicillin-Sensitive金黄色葡萄球菌
3.3。抗生素耐药性革兰氏阴性细菌

15革兰氏阴性细菌从各种标本中恢复过来。像革兰氏阳性细菌,耐药模式从0%到100%不等。几乎所有的细菌分离株高度耐氨苄青霉素。相对,隔离从结膜拭子很容易获得不同的抗生素。淋病奈瑟菌,沙门氏菌感染,美国Virchow许多抗生素敏感。莫拉克斯氏菌属种虫害和美国Virchow不同抗生素的耐药模式相似,即使两者之间的隔离不同(表的数量2)。革兰氏阴性细菌的耐药模式平均显示累计抗生素耐药性的细菌隔离模式从不同的临床情况下,地理位置,类似的样本来源的抗生素。不过,革兰氏阴性细菌的平均阻力范围与详细的耐药模式(图相似3)。


微生物 类型的样本 研究区域 没有隔离的 抗生素和抗(%) 参考
AMP SXT AMC 福克斯 阿霉素 阴极射线示波器 CAF CIP E CN TTC

k .肺炎 痰、尿、脓 哈勒尔 57 65年 40 70年 61年 (43]
尿液 Bahir Dar 17 One hundred. 50 84.6 21 40 27.8 (24]
尿液 量大增; 18 One hundred. 66.7 5。6 44.4 16.7 22.2 44.4 (38]
尿液 GUH 28 One hundred. One hundred. 0 One hundred. 0 One hundred. One hundred. (27]
伤口 JUSH 14 One hundred. 85.7 42.9 71年 85.7 35.7 64年 57 (30.]

h .流感 眼拭子 JUSH 92.3 7所示。7 15.3 23 7所示。7 15.4 0 15.4 (22]

克雷伯氏菌spp 伤口 Mekelle 29日 89.7 65.5 86.2 37.9 44.8 27.8 (34]
结膜拭子 西方Gojjam 20. 28 20. 55 0 0 0 (21]
尿液 AAHFH 14 0 14.3 28.6 78.6 50 (44]

大肠杆菌 尿液 Bahir Dar 64年 89.1 64.5 78.6 64.4 27.6 66.1 (24]
Mekelle 16 6.7 6.7 40 60 6.7 13.3 (25]
尿液 GUH 28 66.7 66.7 50 16.7 50 66.7 One hundred. (27]
阴道拭子 FRH 15 73.3 60 20. 26.7 73.3 (45]
伤口 JUSH 30. 76.7 20. 23.3 66.7 13.3 3所示。3 0 (28]
伤口 JUSH 29日 One hundred. 55 44.8 62年 65.5 34 51.7 79年 (30.]
尿液 量大增; 135年 77.8 70.4 45.2 22.9 34.8 50.4 28.1 69.6 (38]
尿液 GUH 19 One hundred. 26.3 36.8 0 0 0 5。3 52.6 (18]
尿液 StHMC 53 79.2 22.6 71.7 45.3 30.2 54.7 22.6 83年 (46]
结膜拭子 西方Gojjam 20. 15 0 35 0 20. 25 (21]
热交换器 17 70.6 58.8 5。9 11.8 29.4 5。9 35.3 29.4 41.2 11.8 41.2 (31日]
尿液 AAHFH 65年 21.6 24.6 32.2 56.9 53.8 (44]

铜绿假单胞菌 尿液 Bahir Dar 8 One hundred. 71.4 75年 0 0 40 (24]
伤口 JUSH 74年 97.3 87.9 83.3 9.5 74.3 5。4 10.8 (28]
眼拭子 JUSH 31日 74.2 45.1 19.4 38.7 6.4 0 71年 (22]
伤口 JUSH 11 One hundred. 73年 One hundred. 63.6 82年 0 18 82年 (30.]
尿液 JUSH 36 0 0 (47]
伤口 Mekelle 11 One hundred. One hundred. One hundred. 81.8 36.4 0 (34]

假单胞菌spp 结膜拭子 西方Gojjam 20. 50 15 50 0 0 20. (21]

p .奇异君子兰 尿液 Bahir Dar 7 85.7 71.4 80年 66.7 57.1 57.1 (24]
尿液 GUH 28 One hundred. One hundred. One hundred. 0 One hundred. One hundred. One hundred. (27]

变形杆菌spp 伤口 JUSH 23 91年 39 43 65年 30. 17 26 74年 (30.]
伤口 Mekelle 15 86.7 46.7 73.3 46.7 20. (34]
热交换器 25 68年 56 20. 12 28 8 36 32 48 32 96年 (31日]
结膜拭子 西方Gojjam 25 28 0 76年 0 8 56 (21]
尿液 AAHFH 31日 19.4 19.4 41.9 45.9 61.3 (44]

p .寻常的 尿液 Bahir Dar 3 One hundred. 66.7 50 33.3 One hundred. One hundred. (24]

肠杆菌属spp 尿液 Bahir Dar 3 One hundred. One hundred. One hundred. 66.7 50 66.7 (24]
结膜拭子 西方Gojjam 20. 30. 5 40 0 20. 25 (21]

枸橼酸杆菌属spp 尿液 GUH 28 69.2 38.5 46.2 76.9 53.8 61.5 61.5 (27]
伤口 JUSH 18 One hundred. One hundred. 88.9 16.7 One hundred. 11.1 33.3 (28]
结膜拭子 西方Gojjam 20. 50 0 50 0 0 10 (21]

淋病奈瑟氏菌属 尿道分泌物 贡德尔健康中心 142年 80.3 92.3 4.2 1。4 3所示。5 14.1 29.6 (48]
尿道或endo-cervical拭子 Gambella医院 21 One hundred. 0 28.6 One hundred. (49]

美国沙门氏菌感染 凳子 亚的斯亚贝巴 27 22.2 3所示。7 14.8 0 3所示。7 0 0 0 11.1 (50]

美国菲尔绍 凳子 亚的斯亚贝巴 21 4.8 0 4.8 0 0 4.8 0 4.8 14.3 (50]

莫拉克斯氏菌属spp 结膜拭子 西方Gojjam 15 80年 40 53.3 40 40 40 (21]

GUH:冈大学医院;StHMC:圣保罗医院年医学院;AAHFH:亚的斯亚贝巴哈姆林瘘医院;FRH: Felegehiwot转诊医院;热交换器:洋总医院脓 =从麻风病溃疡
3.4。耐药的结核分枝杆菌

的总阻力结核分枝杆菌对公开药物从0%到32.6%不等。阻力增加的百分比在以前治疗结核病例。新的肺结核和肺外公开情况下相对降低了阻力的药物(表3)。


类型的结核病情况 类型的样本 研究区域 没有隔离的 抗生素和抗(%) 参考
H R 年代 E P

新案子 BLUH 103年 8.7 1。9 7所示。8 0.9 - - - - - - (51]
以前治疗 BLUH 18 5。6 5。6 5。6 5。6 - - - - - - (51]
新案子 JUSH 136年 13.2 2。2 8.1 5。2 - - - - - - (52]
新案子 Amhara地区 93年 3所示。2 0 20.4 0 - - - - - - (53]
新案子 Amhara地区 214年 9.8 3所示。7 6.5 5。6 3所示。7 (54]
以前治疗 Amhara地区 46 32.6 15.2 26.1 15.2 8.7 (54]
EPTB 胸膜、腹膜和滑液液体 亚的斯亚贝巴 58 8 21.6 5。4 2。7 - - - - - - (56]

H:异烟肼;R:利福平;S:链霉素;艾凡:乙胺丁醇;P:吡嗪酰胺;EPTB:额外的肺结核;JUSH: Jimma大学专业医院;BLUH:黑色狮子大学医院

4所示。讨论

我们的研究结果表明,抗生素耐药性革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌不同的模式研究综述,从0%到100%不等。发现这种变化取决于类型的隔离,样品的来源,类型的感染,类型的抗生素,用于每项研究和地理差异。

尽管很难讨论平均革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的耐药模式单一研究各种抗生素,尼日利亚的一项研究显示,革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌耐药模式为19.8% -87%,-92.3%和10%分别(17]。西北埃塞俄比亚、贡德尔的一项研究,显示,20% -58.8% -100%和23.5%为革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌,分别为(18]。如果我们看看上面的整体耐药模式研究,范围从10%到100%。这是相对与当前的审查结果。

系统回顾对抗菌素耐药性在撒哈拉以南的非洲(1990 - 2013)据报道,革兰氏阳性致病菌的耐药率高显示氯霉素、甲氧苄氨嘧啶/磺胺甲恶唑、四环素和革兰氏阴性细菌特别是肠杆菌科组显示抗氯霉素,发热性疾病患者隔绝,介于31.0%和94.2%之间,而第三代头孢菌素耐药性介于0.0%和46.5%之间(13]。

当前的审查显示,大部分细菌分离株对常用抗生素在埃塞俄比亚(19- - - - - -54]。可能的原因可能与科学理由如下:许多抗菌药物,有效之前,今天不再使用,因为在细菌基因组中抗性基因的崛起(55]。抗性基因的出现可以在环境中通过自然选择在很长一段时间或自发突变细菌的DNA。抗生素耐药模式已经被几乎所有的报道,开发(19]。

5。研究的局限性

大多数研究在埃塞俄比亚不记录抗菌谱;由于我们无法审查和提取数据与多药耐药性有关。

6。结论

本研究的主要结果是获取国际有效参考了解抗生素耐药性模式在埃塞俄比亚。审查包括12个革兰氏阳性细菌和大约12种抗生素的耐药模式。它涵盖了大部分的地区产于埃塞俄比亚。分离株的耐药模式从0%到100%不等。15革兰氏阴性细菌从各种标本中恢复过来。像革兰氏阳性细菌,耐药模式从0%到100%不等。几乎所有的细菌分离株高度耐氨苄青霉素。相对,隔离从结膜拭子很容易获得不同的抗生素。淋病奈瑟氏菌属,美国沙门氏菌感染,美国Virchow许多抗生素敏感。的总阻力结核分枝杆菌对公开药物从0%到32.6%不等。鉴于当前研究的局限性,这些发现应该仔细解释但在后续研究需要进一步评估。

7所示。建议

我们的研究提供了证据,大多数细菌分离株对常用抗生素有耐药性。抗生素耐药性应该相当关心埃塞俄比亚以及世界各地的所有国家。为了减轻这些问题,促进抗生素的有效性在埃塞俄比亚,埃塞俄比亚政府以及国际社会应做到以下几点:(我)准备适当的使用抗生素的指导方针在卫生机构。(2)建立抗菌素耐药性管理。(3)增加适当的免疫覆盖率,减少抗生素的使用。(iv)实现一个健康政策(减少抗菌素使用农业实践和动物)。(v)创建社区意识合理使用药物。(vi)让抗生素配制的药物厂商强有力的政策。(七)医院和社区获得性感染的控制。(八)确保政治承诺满足抗生素耐药性的威胁。

的利益冲突

作者宣称没有利益冲突。

作者的贡献

马约Reta进行解释的数据,起草了手稿,修正它至关重要的知识内容,给最终批准出版的版本。Abebaw Bitew Kifilie修订它批判性和搜索文献。Abeba Mengist修订它批判性和搜索文献。阅读和批准所有的作者都最后的手稿。

确认

我们愿意承认德勃雷马科斯大学数字图书馆员工的贡献在文章搜索。

引用

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