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Magdalena M. Michalska,Dariusz Samulak,Hanna Romanowicz,Maciej Sobkowski,Beata Smolarz, "Lys751Gln的单核苷酸多态性之间的关联ERCC2波兰妇女的基因癌和卵巢癌",医学进展, 卷。2015, 文章的ID109593, 6 页面, 2015. https://doi.org/10.1155/2015/109593
Lys751Gln的单核苷酸多态性之间的关联ERCC2波兰妇女的基因癌和卵巢癌
抽象的
目的。本研究的目的是评估LYS751GLN的作用(RS13181)ERCC2基因多态性在临床参数和卵巢癌的发展风险。材料与方法。研究对象为430例卵巢癌患者(平均年龄53.2±10.11)和430例健康受试者(平均年龄50.31±18.21)。采用基于pcr的限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析基因多态性。计算各基因型和等位基因的优势比(ORs)和95%可信区间(CIs)。结果。获得的结果表明,基因型Gln/Gln与卵巢癌风险增加有关(OR 5.01;95%可信区间3.37 - -7.43;).与组织学分级的Lys751GlN多态性的关联显示出现增加ERCC2gln / gln(或= 6.96; 95%ci 3.41-14.21;)分级1的基因型以及Gln等级夸张(或= 4.98; 95%CI 3.37-7.40;)在G1卵巢患者中。最后,随着评估的临床FIGO分期,增加ERCC2观察I期Gln/Gln纯合子频率和SI期Gln等位基因频率。结论。根据这些结果,我们得出结论ERCC2基因多态性Lys751Gln可能与卵巢癌风险增加有关。
1.介绍
DNA修复系统参与维持在外源和内源性因素下经历变化的基因组完整性。鉴定出超过130个DNA修复基因,其中发现了一系列单一核苷酸多态性(SNP)[1].为了明确这些变异在调节癌症形成风险方面可能发挥的作用,有必要明确它们的功能意义。DNA修复基因的可变性对于评估特定类型癌症的发生风险及其预防和治疗具有重要的临床意义。
修复过程通常包括两个阶段:切除病变和修复合成。这就是修复系统如何通过碱基切除修复(BER),核苷酸切除修复(NER)和不匹配修复(MMR)起作用。完全逆转是通过直接病变逆转修复系统活动,其中仅具有单阶段的方法,其维持DNA磷酸二酯链的完整性和重组修复系统(HR)。
ner系统去除含有受损基础的短DNA寡核苷酸[2].ner识别由UV暴露引起的致癌化合物和相邻嘧啶之间的共价键引起的笨重病变。ner是多步骤过程,涉及多种蛋白质,如ercc1,ercc2,ercc3,ercc4,pcna,rpa,xpa和p53。因为Ner参与除去大量的DNA损伤,这可以有助于基因组不稳定性,所以检查编码肾类产品的基因的可变性是否可能与卵巢癌有关。
着色性干皮病补体D组(XPD),也称切除修复交叉免费组2(ERCC2),是最重要的低渗透基因之一,位于染色体19q13.3,参与核苷酸切除修复(NER)途径,并去除某些DNA交联、紫外线光损伤和体积较大的化学加合物。
ERCC2基因是高度多态的。一个多态性ERCC2外显子23的密码子751导致与DNA损伤修复表型相关的氨基酸取代(LYS751GLN,RS13181)。
许多流行病学研究的目的是确定ERCC2已经完成了各种癌症风险的多态性,并且Lys751Gln多态性与肺癌风险之间的不同关联[3.- - - - - -5],胶质瘤[6],结肠直肠癌[7,乳癌[8,9]及食道鳞状细胞癌[10] 已经被报告了。
在报道的研究中,作者的兴趣集中在对Lys751Gln多态性的研究ERCC2一组卵巢癌患者和一组健康人的基因Lys751Gln多态性ERCC2基因是在文献资料的基础上选择的,高度提示其与卵巢癌的相关性[11- - - - - -13].在卵巢癌患者中,Wu等人和Kang等人评估,Lys751Gln多态性与癌症发展相关[11,12].在卵巢癌受试者中,由Vella等人描述,多态性ERCC2基因(LYS751GLN和ASP312ASN)积极地影响与卡铂/紫杉醇治疗的反应[13].因此,需要更多的研究来更好地了解可能的发展生物学机制,以及Lys751Gln多态性在这一罕见的肿瘤转化过程中的作用。
本研究的目的是分析LYS751GLN的等位基因和基因型(RS13181)的频率ERCC2试图确定这种多态性对卵巢癌发挥的影响。
2.材料和方法
2.1。耐心
福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤组织标本取自妇女(),曾于2000年至2012年在波兰母亲纪念医院研究所妇科外科和妇科肿瘤科接受治疗。我们只招收出生和生活在波兰中部(Łódź地区)的女性。研究对象的社会人口学特征分布情况见表1.对研究对象进行问卷调查,包括社会人口统计资料、病史、健康相关信息、饮酒、吸烟状况、月经和生育史以及激素替代疗法(HRT)使用情况。所有被研究的个体都是白种人,构成了来自相同种族和地理来源的同质人口。体重指数(BMI)是根据当前体重(公斤)除以身高(米)的平方计算得出的。饮酒习惯按照从不/很少饮酒者、以前饮酒者或每周饮酒1 - 8.9 U(轻度饮酒者)、9-17.9 U(中度饮酒者)或每周饮酒18 U(重度饮酒者)进行分类,其中1u = 22 g乙醇。参与者被分为四组:不吸烟者(从不吸烟者)、每天抽10支烟连续10年(曾经吸烟者)、每天抽20支烟连续20年(中度吸烟者)和每天抽20支烟连续30年(重度吸烟者)。卵巢癌家族史阳性定义为一个或多个一级亲属有卵巢癌报告。招募的患者均未接受术前化疗或放疗。患者年龄38 ~ 81岁(平均年龄)).所有确诊的肿瘤均按照国际妇产科联合会(FIGO)的标准进行分级。正常卵巢组织的DNA ()为对照组(年龄39-83岁,平均年龄).它们是从未被诊断出患有卵巢肿瘤,其他肿瘤或慢性疾病的非相关妇女,并且随机选择和频率与年龄的案件匹配。当地的道德委员会批准了该研究,每位患者都有书面同意参加该研究。
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2.2。DNA孤立
根据制造商说明,使用QIAamp DNA FFPE组织试剂盒(Qiagen GmbH, Hilden, Germany)制备基因组DNA。
2.3。基因型决定
pcr -限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法用于检测Lys751Gln多态性的基因型,如前所述[14].
引物(前进:5'-CTGCTCAGCCTGGAGCAGC-3',反向:5'- TAGAATCAGAGAGAGGAGAGCGCTG-3')评估SNP LYS751GLN(RS13181)。这25 μ.L PCR混合物含有约100 ng DNA,每条引物12.5 pmol, dNTPs 0.2 mmol/L, MgCl 2 mmol/L2, 1 U的Taq DNA聚合酶(TaKaRa,日本)。PCR产物在2%琼脂糖凝胶中电泳,溴化乙啶染色显示。所有PCR均在DNA Thermal Cycler PTC-100 TM (MJ Research, Inc., Waltham, MA, USA)中进行。在95°C初始变性5 min后,进行95°C变性30 s、62°C退火30 s、72°C延伸30 s扩增35个循环,然后在72°C延伸7 min。PCR产物经1 U太平洋标准时间我(Fermentas,Vilnius,立陶宛)在37°C。裂解太平洋标准时间我产生了与Lys / Lys,Lys / Gln和Gln / Gln基因型对应的161,161 / 120/41和120/41 BP的片段ERCC2基因,分别。
2.4。统计分析
观察到的每个数字ERCC2基因型与哈迪-温伯格平衡群体的预期基因型比较,使用卡方() 测试。通过案例和对照组基因型和等位基因频率进行了比较测试。使用Logistic回归分析计算与Lys751Gln SNP以及Lys751Gln SNP和其他分析因素组合相关的优势比(OR)和相关的95%置信区间(95% CI),见表1降低患卵巢癌的风险值<0.05被认为是显着的。使用Statistica 6.0软件(Statsoft,Tulsa,Oklahoma,USA)进行所有统计分析。
3.结果
基因型分布和等位基因频率ERCC2表中呈现在患者和对照中的基因2.协会(或5.01; 95%CI 3.37-7.43;)在Lys751gln多态性的Gln / Gln基因型之间发现ERCC2基因与卵巢癌的发生。变种751Gln等位基因ERCC2增加癌症风险(或3.61; 95%CI 2.92-4.45;).
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原始赔率比(或);95% CI: 95%的置信区间;Chi广场。 |
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观察到的基因型频率ERCC2控制中的Lys751GLN SNP与Hardy-Weinberg均衡有关(),但观察到的基因型频率ERCC2患者Lys751Gln SNP与Hardy-Weinberg平衡不一致().它是由所检查的抛光群中的Lys / Lys基因型非常低的丰度引起的。
组织学分级与ERCC2多态性。评估所有病例的组织学分级().2年级和3年级算用于统计分析(见表3.).观察到Gln/Gln纯合子频率增加(OR 6.96;95%可信区间3.41 - -14.21;)根据FIOPO标准,在1年级患者中。此外,G1中的卵巢癌患者对GLN等位基因(或4.98; 95%CI 3.37-7.40有夸张;).
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;根据FIGO标准;粗优势比(OR);95% CI: 95%的置信区间;Chi广场。 |
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临床FIGO分期也与之相关ERCC2lys751gln多态性(表4).关于GLN / GLN HOMOZYGOTES频率(或9.96; 95%CI 4.40-22.60;)在I阶段,根据FioGo分类。用Gln等位基因的发生(或6.59; 95%CI 4.27-10.19,观察到卵巢癌进展风险增加的趋势;)ERCC2多态性。
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;粗优势比(OR);95% CI: 95%的置信区间;Chi广场。 |
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我们的数据没有显示任何统计上显著的相关性ERCC2多态性和卵巢癌的危险因素,如BMI(身体质量指数)、吸烟状况、饮酒、癌症家族史、怀孕、腹水、激素替代疗法、肿瘤大小、初潮和卵巢癌女性(“数据未显示”)。
4。讨论
本研究尝试确定DNA修复途径中的单核苷酸多态性(ERCC2-Lys751gln)与波兰女性卵巢癌的风险有关。DNA经常受到内源性和外源性异常诱变的损坏。参与DNA修复和维持基因组完整性的基因在提供可能导致癌症的突变中发挥至关重要作用[15- - - - - -19].DNA修复通路在防止致癌引起的基因突变方面起着至关重要的作用,其中核苷酸切除修复(NER)通路是重要的DNA修复系统之一。核苷酸切除修复系统去除短DNA,受损的含碱基的寡核苷酸[2].NER是一个多步骤的过程,涉及许多蛋白质,并被分为基因组整体修复(GG-NER)和转录偶联修复(TCR),前者发生在基因组中,后者消除活性基因转录链上的损伤。的ERCC1基因在修复DNA损伤和基因组不稳定性方面具有重要作用,并参与核苷酸切除修复途径。单核苷酸多态性Lys751Gln (rs13181)是研究最广泛的遗传标记之一ERCC2它在各种癌症发展中的作用是显而易见的[20.].交换751 leys for glnERCC2基因可导致编码蛋白在TFIIH复合物内ERCC2及其解旋酶激活物p44相互作用域的构象变化[21.].GLN / GLN基因型已与肺癌的风险增加有关[5并与乳腺癌、膀胱癌和皮肤癌的高风险相关[8,9,22.,23.].单核苷酸多态性作为重要的遗传生物标志物,已被报道与改变基因表达和蛋白质活性有关。ERCC2Lys751Gln SNP与亚最佳DNA修复能力相关[24.,25.].从目前的观点来看,分析专注于ERCC2 LYS751GLN多态性在卵巢癌中的影响的研究似乎更为重要。一些研究表明低ERCC2表达与化疗敏感性增加相关,因此被认为是接受吉西他滨和顺铂联合化疗的卵巢癌患者的预测标志物[13].研究人员还发现了两者之间的联系ERCC2Lys751Gln多态性和降低DNA修复能力。胚胎癌进展的时间在吉西他滨/顺铂治疗的患者中显着高于Lys751Gln基因型的患者,而不是Lys751Lys基因型的患者[13].Vella等。报道称ERCC1和ERCC2基因型与卵巢癌的风险有关[13].中国研究人员还发现了卵巢癌与ERCC2Lys751Gln多态性(11].然而,为了我们的知识,没有报告评估这种遗传改变对波兰人群卵巢癌风险的影响。
我们的结果表明lys751gln多态性ERCC2基因应该特别注意。在研究来自卵巢癌患者的一系列430个DNA样本中,源自血管均匀群体,我们发现研究了与子宫内膜癌发生的多态性的关系。我们证明751GlN等位基因与肿瘤的风险有关。的ERCC2-Gln/Gln基因型使卵巢癌形成风险增加5倍。此外,还提出了与卵巢癌分级(G1)和分期(SI)的一些重要联系。我们的研究是在一个种族同质的人群中进行的,这可能会提高我们的知识,关于基因型-表型关系变异在多大程度上是与群体相关的。
我们的结果与其他报告的数据一致,引入了一个重要的作用ERCC2Lys751Gln在卵巢癌发生中的多态性。类似于我们的观察,最近的报告表明了这一点ERCC2lys751gln基因型似乎与卵巢癌症风险升高有关[11].
总之,我们的结果表明了ERCC2Lys751Gln SNP可能参与了波兰人群中卵巢癌的易感性。SNP在卵巢癌中的作用需要进一步研究才能获得更确切的结果。
利益冲突
作者声明没有利益冲突。
参考文献
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