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Paola Cruz-Tapias,奥斯卡·m·Perez-Fernandez阿德里亚娜Rojas-Villarraga, Alberto Rodriguez-Rodriguez胡安•曼努埃尔•玛丽娅•阿朗戈阿纳, ”共享HLA II级六个拉美自身免疫性疾病:一个荟萃分析”,自身免疫性疾病, 卷。2012年, 文章的ID569728年, 10 页面, 2012年。 https://doi.org/10.1155/2012/569728
共享HLA II级六个拉美自身免疫性疾病:一个荟萃分析
文摘
自身免疫性疾病的患病率和遗传易感性(广告)可能取决于纬向梯度和种族。本研究的目的是确定共同的人类白细胞抗原(HLA)二类造成易感性的等位基因在拉丁美洲人六个广告通过荟萃分析和评估额外的临床免疫学,这些广告分享HLA等位基因的遗传特征。DRB1∗03:01 (OR: 4.04;95%置信区间:1.41—-11.53)被发现的危险因素系统性红斑狼疮(SLE),干燥综合征(SS)和1型糖尿病(近年来)。DRB1∗04:05 (OR: 4.64;95%置信区间:2.14—-10.05)影响自身免疫性肝炎(AIH),类风湿性关节炎(RA)、内转;DRB1∗04:01 (OR: 3.86;95%置信区间:2.32—-6.42)是一个RA和近年来的敏感性因素。相反的关联被发现之间的多发性硬化症(MS)和近年来。DQB1∗06:02和DRB1∗15个等位基因女士的风险因素,但近年来的保护性因素。同样,DQB1∗06:03 AIH的等位基因是一个风险因素,而是保护近年来。几种常见自身抗体和临床协会以及其他共享基因在这些广告,已报告的审核。这些结果表明,在拉丁美洲人广告份额主要位点和免疫特性。
1。介绍
自身免疫性疾病(广告)是慢性疾病由自体抗原免疫耐受的损失。他们是一个异质群体的疾病影响特定靶器官或多个器官系统(1]。几乎所有的广告会不同程度地影响到中年妇女和在这组患者死亡的主要原因2]。广告的病因尚不清楚,但这些复杂疾病已知功能基因和环境因素在他们的发展1,3]。尽管他们表现出截然不同的流行病学特征和临床表现,有证据表明广告相似免疫遗传的机制(4]。
三个相关证据支持广告的共同起源。首先,临床证据强调了个体(即内共存的独特的广告。polyautoimmunity)和核心家庭的成员(即内。家族性自身免疫)。第二,physiopathologic证据表明广告之间的病理机制可能是类似的。第三,遗传证据表明,自体免疫表型可能代表多向性的特异性的疾病基因之间的相互作用的结果(5]。
HLA的研究,主要的遗传易感性影响广告,将使我们能够了解其共同的或特定的对这些疾病的影响,识别标记基因预测。大而多样的拉丁美洲人口(LA)是一个强大的资源为阐明复杂性状的遗传基础由于其掺合料(6]。现代拉了遇到的欧洲人1492年美洲原住民,紧随其后的是一波又一波的移民来自欧洲和非洲。因此,今天的拉丁美洲人的基因组结构是由建立种群的遗传结构和移民从这些不同人群的数量7]。分析多个拉丁裔人口基因关联研究也可以加强潜在关联为研究基因-环境提供的机会和基因基因相互作用[8]。
本文的目的是评估的共同效果HLA二类广告在洛杉矶人口通过荟萃分析和评估(即额外的特征。其他基因,基因相关广告的自身抗体和临床特点)在拉丁美洲。
2。材料和方法
2.1。研究选择
五项荟萃分析HLA二类多态性在洛杉矶患者从2007年到2010年发布的广告我们组包括(9- - - - - -13]。广告包括类风湿性关节炎(RA),系统性红斑狼疮(SLE),自身免疫性肝炎(AIH),多发性硬化症(MS), 1型糖尿病(近年来)。此外,唯一的结果研究干燥综合征(SS)报道洛杉矶人口包括(14]。短暂,策略搜索、选择和分析以下提到的用于每一个荟萃分析的研究。
在所有的情况下,系统回顾的电子数据库(MEDLINE, PubMed、收录古代船、EMBASE,科克伦,和紫丁香)是由两位专家独立完成的。搜索只包括出版物HLA-Class II等位基因和对广告在洛杉矶发表在这些三种语言:西班牙语、英语、葡萄牙语。所有的搜索策略包括网格术语:“HLA DR / DQ抗原”和“重大Histocompatibily复杂”。然而,其他主要话题是根据特定的广告:“关节炎、类风湿”,“红斑狼疮,系统性”,“肝炎、自身免疫性肝炎、慢性,“多发性硬化症”,“1型糖尿病”,或“自身免疫性糖尿病”。
入选标准如下:(1)广告RA诊断建立使用国际验证标准(15),对系统性红斑狼疮(16为AIH [],17,18(女士),19,20.),近年来(21,22];(2)病例对照研究设计;(3)公布足够的信息来计算优势比(ORs);(4)专注于定义良好的洛杉矶人口;(5)利用分子技术来确定HLA多态性(即。,一个llele-specific oligonucleotides—ASO, polymerase chain reaction with sequence-specific primers—PCR/SSP, restriction fragment length polymorphism—RFLP, specific oligonucleotide probes—SOP, or sequence-specific oligonucleotide probes—SSOP); and (6) manuscript’s publication in a peer-reviewed journal as a full paper. Summaries or abstracts were not accepted.
数据分析使用综合分析版本2项目(生物抑制剂,恩格尔伍德,新泽西,2004)。每个多态性组,效果总结优势比(或)和95%可信区间(CI)得到的随机效应模型。棱镜后的系统回顾和荟萃分析是指导方针和相应的检查表完成(23]。
2.2。荟萃分析
计算每个HLA-DR和hla dq基因进行了使用低或基于信息在每一个荟萃分析的高分辨率。最后集中或者是由重个人或其方差的倒数。对于每个等位基因,最终效果或和95%可信区间是通过获得一个随机模型。使用这个模型,因为假设有一个真正的效应大小的分布,而不是一个真正的影响,分配每个研究更为平衡的重量。也是因为所有使用功能研究被认为是不平等的。值小于1.0建议的保护作用,而值大于1.0建议每个广告的风险。科克伦的异质性计算通过和希金斯()测试。的测试测量的程度不一致的研究通过计算全变差的百分比在研究由于非均质性,而不是机会,是表示为一个比例范围为0%至100%。低的定性分类,温和,和高被分配到值的25%,50%,和75%,分别。一个重要的统计()表示在研究异质性。发表偏倚是决定使用漏斗图,食叶蛾的回归不对称测试和敏感性分析。数据分析通过使用综合分析程序版本2。
2.3。文献综述
一个更新的棱镜后进行系统性文献指南(23自身抗体在类风湿性关节炎的患病率,系统性红斑狼疮,AIH,近年来,SS,女士(图1)。出版物被确定通过一个系统的搜索在Pubmed完成。入选标准如下:(1)研究人类,(2)限制标题,(3)文章发表在过去的20年里,(4)样本量必须高于100例系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎研究和高于50个病人党卫军,AIH,近年来,和女士的研究,(5)足够的数据来计算抗体在每个广告的流行。所有的搜索策略包括网格术语:“1型糖尿病,”,“红斑狼疮,系统性”,“关节炎、类风湿”、“干燥综合征”、“自身免疫性肝炎”,“多发性硬化症”。此外,关键字搜索20抗体被用于包括轶事:抗核抗体(ANAs) antidouble链DNA抗体(Anti-dsDNA) antiribonucleoprotein抗体(Anti-RNP) anti-Smith抗体(Anti-Sm) Anti-Ro, Anti-La, lupic抗凝(LAC)、免疫球蛋白anticardiolipins, IgM anticardiolipins, anti-beta-2-glicoprotein我(Anti -β2 gpi)、类风湿因子(RF), anti-cyclic citrullinated肽(Anti-CCP)抗体,antiglutamic酸脱羧酶(Anti-GAD)抗体,anti-islet细胞抗体协会(ICAs) anti-insulin抗体(IAAs),抗线粒体抗体(ama) antismooth肌肉抗体(asma) antithyroglobulin (Anti-TG)抗体和抗甲状腺过氧化物酶(Anti-TPO)抗体。表1详细描述完整的搜索在网上补充材料http://dx.doi.org/10.1155/2012/569728。
3所示。结果
3.1。荟萃分析HLA-II等位基因和广告之间的联系
总共五个荟萃分析HLA二类多态性在洛杉矶患者广告(类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮、AIH、女士和近年来党卫军在洛杉矶和独特的报告进行评估(图2)。
总共有3727例病例和8465例对照分析,和不同类型的等位基因之间的联系和广告(表中被发现1)。包括三个风险等位基因的两个或两个以上的广告,对面四个协会(相同的等位基因是一个广告的一个危险因素,但其他广告)的保护性因素,十三风险等位基因为特定的广告,和八个保护特定疾病的等位基因。协会是分组通过网络图3。
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| 一个α= 0.05。 每个或及其CI显示效果和精度对个人的研究和计算出的综合效应的随机模型。 广告:自身免疫性疾病;类风湿性关节炎:类风湿性关节炎;系统性红斑狼疮:系统性红斑狼疮;AIH:自身免疫性肝炎;近年来:1型糖尿病;SS:干燥综合征;女士:多发性硬化症;或:优势比。 |
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有两个风险等位基因与三个广告。第一个是DRB1 * 03:01发现患系统性红斑狼疮,党卫军,和近年来,第二个是DRB1 * 04:05与AIH相关,近年来,RA。同样,有一个风险等位基因与两个广告。它是DRB1 * 04:01传授患风湿性关节炎和近年来被发现。
有趣的是,两种截然相反的关联是女士和近年来发现的。DQB1 * 06:02和DRB1 * 15个等位基因女士的风险因素,但近年来的保护性因素。同样,相反协会AIH之间被发现,近年来,DQB1 * 06:03 AIH的危险因素,但近年来的保护性因素。
此外,十三针对疾病的风险等位基因被发现。那些是七日内转,三个女士,两对RA,,另一个用于AIH,相反,八个保护等位基因特定广告被报道。这些都是五日内转,AIH两个,一个用于系统性红斑狼疮(表1)。
3.2。研究质量
显著的异质性是未见DRB1 * 04:01等位基因;;。温和的观察DRB1 * 04:05等位基因异质性;;。高异质性被荟萃分析发现DRB1 * 03:01等位基因;;。没有任何证据表明发表偏倚在目前的荟萃分析根据漏斗情节和食叶蛾的回归测试(数据没有显示)。
3.3。分享广告的自身抗体
研究结果总结在表2补充。阿拉斯的存在被发现在所有的广告分析。这些自身抗体,正如所料,在系统性红斑狼疮(甚至超过75%)更普遍比其他广告。然而,患病率ANAs超过60%在党卫军,RA和AIH。Anti-dsDNA, Anti-RNP Anti-Sm抗体在系统性红斑狼疮,RA和党卫军。Anti-Ro和Anti-La抗体主要在党卫军超过50%。同时,这两个抗体在系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎和AIH。修订,虫胶只是出现在系统性红斑狼疮患者,但不是在其他广告。免疫球蛋白anticardiolipins被发现在所有广告具有不同数据大相径庭,系统性红斑狼疮是最常见的一个。否则,IgM anticardiolipins提出了广告,但是他们普遍低于免疫球蛋白亚型。反β2 gpi抗体(免疫球蛋白和IgM亚型)观察主要在系统性红斑狼疮,但他们存在于所有疾病,除了在党卫军。射频RA存在于其他广告不同,如系统性红斑狼疮、党卫军,女士,AIH。同样Anti-CCP抗体被发现在所有广告除了女士,尽管发病率低于28%。共享自身抗体在广告也Anti-TPO和Anti-TG(出现在所有广告在AIH除外)。相反,Anti-GAD、ICA和IAA只在近年来,AIH观察。
自身抗体的流行由于实验室技术千差万别,人口类型的研究中,和活动的广告。
4所示。讨论
在这个分析中,分析了遗传共性广告研究的贡献从HLA-II等位基因赋予相关风险或保护六个广告:风湿性关节炎,系统性红斑狼疮,AIH,女士,SS,近年来在洛杉矶的人口(9- - - - - -14]。两种类型的遗传风险因子被发现:那些常见的许多疾病和特定于给定的障碍。此外,相反的两种不同的广告和相同的等位基因之间的联系被发现。
洛杉矶人口是一个男女混合组与血统,包括黑人,白人和印第安人,这反映了一种明显的种族、遗传和文化多样性(8]。然而,我们的研究结果表明,在洛杉矶HLA-class II等位基因对广告的影响类似于报告对其他人群的影响无论纬向梯度和掺合料。例如,DRB1 * 03:01 DRB1 * 04:05, DRB1 * 04:01, DQB1 * 02:01近年来在洛杉矶也带来的风险等位基因易感性在白种人和亚洲人13]。DRB1 * 03:01等位基因已被描述在哥伦比亚人口为党卫军是一个危险因素,也与疾病相关的在全球级别(54]。此外,一些non-HLA基因影响的风险开发广告白种人也有同样的效果在拉丁美洲人(即,C8orf13-BLK和CD226基因)[55]。相比之下,一些non-HLA基因影响发展中广告在一个特定的人口不复制到另一个(例如,PADI4和SLC22A4基因)[56]。
几项研究已经表明,主要组织相容性复合体(MHC)是中央位点导致广告的发展(25,57]。我们的结果表明,三个等位基因中确定先前的分析(9- - - - - -14的一个特定的疾病被发现影响至少两种疾病的风险。DRB1 * 03:01等位基因被发现患系统性红斑狼疮,党卫军,和近年来而DRB1 * 04:05等位基因与AIH密切相关,近年来,RA。此外,DRB1 * 04:01等位基因赋予易感性内转和风湿性关节炎。分析自身免疫反应和炎症相关基因多态进行了。结果表明,PTPN221858 t / C [25),肿瘤坏死因子-α- - - - - -308 g / (31日,58,59)等位基因与系统性红斑狼疮、SS和近年来。同样,CTLA4AIH的基因被报告为一个风险因素,近年来,RA (37,60,61年]。其他non-HLA基因传递风险开发两个或两个以上的广告在洛杉矶人口也已经确定。例如,ITGAM和它的变体(rs1143679 Arg77His)与系统性红斑狼疮,系统性硬化症(SSc) (62年]。另一个例子是rs6822844协会与系统性红斑狼疮IL2-IL21地区,近年来,学生在非欧洲人群(24]。
我们的研究结果表明,既有共同的易感性和保护等位基因广告和单等位基因参与的发展广告(表1)。DRB1 * 04:04等位基因,特别是影响易感性收购RA,被确认。它有一个守恒的主题(L-LE - (Q / R) - (R / K) -R-A-A)组成的残留在第三高变区67 - 74年的博士β1链,称为共享抗原决定基(SE)。这些残基构成一个α螺旋域形成抗原结合位点的一边,一个站点可能影响抗原的演讲(63年]。因此,SE可能选择性地绑定一个工具肽可以自体免疫反应。拉个人携带SE等位基因比非携带者患风湿性关节炎的风险高3.5倍(9]。
尽管我们确定共同的HLA二类造成易感性的等位基因不同的广告,有证据表明两个临床上截然不同的广告有不同的易感性HLA-II等位基因共享其他常见的基因变异。使用一个非常大的样本集,Zhernakova等人相比,RA和腹腔疾病的遗传基础(CD)。他们发现14个位点导致两种疾病包括的风险CD247,UBE2L3,DDX6,UBASH3A,SH2B3,8 q24.2,STAT4,TRAF1-C5。然而,众所周知,RA和CD风险有不同的HLA等位基因(HLA DQ * A1和DQ * B1等位基因在CD和HLA-DRB1“SE”等位基因在RA)。根据作者的假说,HLA-II分子在这两个广告带来的风险优先呈现特异抗原(谷蛋白在CD,最有可能在RA) citrullinated抗原autoreactive T细胞。因此,疾病特异性的产业在很大程度上取决于特定HLA等位基因和特异抗原。特定的基因可能影响下游信号事件常见的两种疾病,可能导致改变t细胞激活和分化64年]。
对相反的关联DQB1 * 06:02和DRB1 * 15等位基因被发现的风险因素但女士在近年的保护性因素。我们的结果类似于其他等MHC基因的研究报道CDSN和HLA-DMB(rs3130981-A和rs151719-G resp)女士的风险因素,但保护的内转(45]。然而,也有证据的逆关系。例如,TAP2(rs10484565-T),VARS2(rs1264303-G),新的高度(rs2071286-A),BTNL2(rs2076530-G),TRIM40(rs757262-T)是近年来发现风险因素但保护性因素[女士45]。尽管这些基因的存在相反的关联,重要的是提到临床证据支持共存女士和近年来报道的65年,66年]。因此,这些多效性的影响的共同作用可以解释不同等位基因的多个基因和环境因素改变的生物背景不同个体和种群的单核苷酸多态性(表2)。
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共享自身抗体在广告也被描述。阿拉斯提出了系统性红斑狼疮等多个广告,党卫军,风湿性关节炎,近年来,AIH,女士这些自身抗体不是特定的一个广告。此外,没有自身抗体,独有一个广告被发现。广告的理论有一个共同的起源和相似的致病机制收到支持这些发现(补充表2)。这些血清学结果加强目前的荟萃分析的遗传研究。此外,还有病理生理机制和临床特征支持我们的研究结果(表2)。有证据表明,一个广告可以诱导或由传染性病原体(例如,viruses or bacteria) via different mechanisms, such as an alteration of expression of some genes involved in immune regulation, the induction of foreign proteins that could trigger the production of autoantibodies in B cells, and molecular mimicry [27]。许多流行病学研究已经证明,人类内源性逆转录病毒(HERVs)、丙型肝炎病毒(HCV) (40],eb病毒(EBV) [43(表)与不同的广告2)。此外,丙肝病毒患病率升高已经在广告和报道表明它发挥了致病作用触发生产言论集,射频,anticardiolipin, Anti-TG抗体(40]。
另一个考虑有关基因的发现是家族聚集性。患者的亲属广告有更高的风险比一般人群相同或其他广告。这些发现在AITD已报告,风湿性关节炎,MS,系统性红斑狼疮,近年来42,47,48]。
关于AIH相反的关系,近年来,有一个研究超过250 AIH患者中只有两例近年来呈现(53]。同时,有一个AIH患者的报告,近年来,坟墓”(即s疾病。,multiple autoimmune syndrome) [52]。最后,一个研究儿童与AIH评估T1D-related自身抗体和易感性的等位基因已被报道。da Silva等人发现高患病率的自身抗体,但尽管有这些发现,风险等位基因的患病率近年来类似于控制和只有一个病人是近年来开发后3年(51]。
总之,我们的研究结果验证的共同起源的广告模式。发现的重大风险和防护等位基因在洛杉矶和他们共享与世界各地的其他人群突出了一些HLA区域的主要作用在遗传易感性广告无论纬向梯度和种族。
确认
这项工作得到了医学和健康科学学院大学罗萨里奥,和Colciencias(373 - 2011),波哥大,哥伦比亚。作者要感谢伊丽莎白·克鲁兹Tapias为她帮助在设计数据。
补充材料
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