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Tineke e . Buffart玛丽安·Tijssen Thijs克鲁格,比阿特丽斯·卡瓦略,谢尔盖·j·史密兹,路德h . Brakenhoff Heike Grabsch, Gerrit a·梅耶尔,亨利·b·萨多夫斯基Bauke Ylstra, ”DNA质量评估为全息阵列等温全基因组扩增”,分析细胞病理学, 卷。29日, 文章的ID709290年, 9 页面, 2007年。 https://doi.org/10.1155/2007/709290
DNA质量评估为全息阵列等温全基因组扩增
文摘
背景数组:数组比较基因组杂交(CGH)正越来越多地应用于DNA来自formalin-fixed石蜡包埋组织(FFPE),但在一个比例的情况下,这种类型的DNA是不合适的。由于全息阵列的实验成本高和不可靠的DNA质量检测方法,更好的预测方法是必要的。本研究的目的是准确地确定FFPE DNA质量的输入,以预测全息阵列结果的质量。材料和方法:由等温扩增DNA质量评估和全息阵列相比质量59 FFPE胃癌样本,一个FFPE结肠癌样本,两个FFPE正常的小舌样品,一个新鲜冷冻和六个FFPE HNSCC样本。胃癌的DNA也质量测试β- - - - - -球蛋白PCR。结果:准确预测使用等温扩增的DNA质量观察结直肠癌,HNSCC和小舌样本。在胃癌样本,等温扩增是一个更精确的方法为选择高质量DNA全息阵列相比,使用PCR产品长度。等温扩增产品被用于全息阵列和成果相比使用non-amplified DNA的四个样品。DNA扩增前后产生了相同的染色体拷贝数分割模式更改为新的DNA样本和FFPE样本。结论:等温DNA扩增的效率是一个全息阵列质量可靠的预测。放大产品本身可用于全息阵列,甚至开始FFPE派生的DNA样本。
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