PHOTOPROBER®Biotin:一种用于比较基因组杂交标记存档DNA的替代方法

摘要

比较基因组杂交(CGH)是筛选实体肿瘤全基因组染色体不平衡的一种强有力的方法。特别是它能够对存档的、福尔马林固定的、石蜡包埋的(FFPE)组织进行分子细胞遗传学分析。然而，一个众所周知的难题是，这种片段小于1000 bp的材料的DNA质量很差。Nick翻译，CGH中常规使用的酶DNA标记方法，会导致更短的片段，往往低于成功分析的临界限度。在这项研究中，我们报道了在原位杂交和荧光检测之前，用非酶的PHOTOPROBE生物素标记半抗原到DNA的共轭的替代应用。我们采用两种标记方法分析51例主要来自上呼吸道的FFPE肿瘤样本。在19个案例中，两种方法都成功了。杂交中期的比较显示，PHOTOPROBE®样品具有明显更高的荧光信号，有时具有离散的细胞质背景，但这并不影响检测到的染色体失衡的特异性和敏感性。对于另外32例平均DNA片段小于1000 bp的病例，PHOTOPROBE®生物素是唯一成功的标记技术，从而为档案材料中高度降解DNA的CGH分析提供了新的选择。

分析细胞病理学

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