分析SARS-CoV-2 PCR和胸部CT发现在东京的一个设施(町田市医院)

文摘

介绍。SARS-CoV-2逆转录聚合酶链反应(rt - pcr)检测对诊断COVID-19很有用,和rt - pcr阳性率是一个重要的指标评估感染的发生率和数量。COVID-19肺炎也与胸部CT特征发现,可帮助诊断。方法。我们回顾性评估病人背景特征、数量的情况下,积极的速率,和胸部CT发现672年的积极的和消极的情况下病人因涉嫌COVID-19 rt - pcr在我们医院的4月3日至8月28日,2020年。此外,我们积极的趋势对比利率每隔大约每周与新感染的人数趋势町田市东京。结果。这项研究包括323名男性和349名女性,平均年龄为46岁(范围:1月- 100年)。rt - pcr结果阳性的37例,阳性率为5.51%。积极率趋势在我们医院和新的COVID-19病例的数量在城市类似的在研究期间。患者积极的结果,15(40.5%)没有胸部CT表现和14举行了双边齐次GGOs。患者负面结果,190年胸部CT发现考试的时候,和150年被诊断为细菌性肺炎或支气管炎,合并组成的主要发现和小叶中心的透明。这些患者中仅有11国同构GGOs展出。结论。两国均质GGOs COVID-19肺炎的特点,可能帮助COVID-19的诊断。

1。介绍

2019年12月,冠状病毒疾病2019 (COVID-19)引起的严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)从武汉开始蔓延,中国,世界各国,包括日本。2020年8月,COVID-19病例数超过2500万,超过850000人死亡(1]。在日本,进入紧急状态的传播COVID-19宣布从4月7日到5月25日,2020年。尽管COVID-19感染人数减少后解除紧急状态,病例数在6月下旬再次增加,8月初达到高峰,之后逐渐减少。

虽然SARS-CoV-2逆转录酶聚合酶链反应(rt - pcr)检测是一个非常具体的测试和用于明确诊断,它不适合作为筛选试验由于长时间获得所需的结果,它的成本高,灵敏度不足。虽然在日本医疗机构最初发送rt - pcr检测对公共卫生中心进行分析,他们现在可以请求从私人实验室测试结果。事实上,我们医院要求4月3日以来的rt - pcr从私人实验室。

一般来说,积极的测试得到的利率执行诊断某些疾病作为一个指标来估计病人发病率。在极其特殊的情况下测试中,发病率计算基于积极的速度和灵敏度的测试:假设敏感性是一个常数,发病率可以来源于积极的速度。因为这也适用于rt - pcr检测COVID-19, rt - pcr阳性率是一个重要的指标估计发病率和感染的数量的变化。我们的机构是一个公立医院町田市东京,和大多数病人是当地居民。因此,我们可以认为积极的测试速度一个医院准确地反映COVID-19情况。

COVID-19也经常与肺炎,胸部电脑断层(CT)可以帮助诊断。特征发现COVID-19肺炎用于诊断包括双边、nonregional磨砂玻璃的透明(GGOs)和胸部CT(焦整合2- - - - - -13]。然而,目前尚不清楚是否有差异在胸部CT发现患者积极的和消极的rt - pcr结果那些怀疑COVID-19在社区医院接受治疗。

因此,在本研究中,我们计算阳性病例的数量和积极的利率COVID-19执行rt - pcr测试在我们的医院和患者胸部CT结果之间的比较积极的和消极的结果。

2。材料和方法

我们分析数据与性别、年龄、是否存在异常的发现对胸片672病人rt - pcr (LightMix®模块化冠(COVID19) apoe基因或Cobas®SARS-CoV-2,罗氏诊断K.K)在我们医院疑似COVID-19从4月3日到8月28日,2020年。除了整体rt - pcr阳性的速度,我们将每隔大约每周积极趋势率与新感染的人数趋势町田市东京。町田市新感染的人数是基于町田市政府网站上公布的数据(14]。此外,与积极发现病例胸部CT,我们比较背景因素(年龄、性别、吸烟史、严重程度,CT发现,结果,和并发症)之间RT-PCR-positive和RT-PCR-negative病例。相比我们还发现RT-PCR-positive病例的特点,研究这些发现是否可以RT-PCR-negative确诊病例。EZR软件(版本。1.42)是用于统计分析15]。本研究机构伦理委员会批准的医院。这项研究是进行符合赫尔辛基宣言和涉及人体受试者的医疗卫生研究中的伦理指南。

3所示。结果

的背景特征672名患者(323名男性,349名女性;年龄中位数:46年(100年)范围:1个月-)接受rt - pcr如表所示1。阳性病例的数量是37岁,正率为5.5%。趋势在我们医院的rt - pcr积极性和新病例的数量COVID-19町田市见图1。图中显示,这两个趋势几乎是相同的。

在205例胸部CT发现被观察到。患者积极的rt - pcr结果,15展出一些胸部CT发现,他们的背景特征如表所示2。疾病严重程度是轻微的6例(不需要氧疗法),温和的6例(氧疗法需要),和严重的三个案例(需要通气治疗呼吸衰竭)。COVID-19病人死于严重的并发症之一。两国均质GGOs(图2)在胸部CT观察14例(93%)。比较初始CT发现轻度到中度至严重的病例(包括死亡病例)显示,重症病例比轻度到中度与更广泛的GGOs和整合相关用例(轻度至中度:6 (50%);严重:3 [100%])。

表3显示诊断RT-PCR-negative病例:150 190例细菌性肺炎或支气管炎,27例心力衰竭,20例间质性肺病(ILD)。只有11 RT-PCR-negative病例双边均匀GGOs RT-PCR-positive病例中更常见(确切概率法, )。

患者细菌性肺炎、支气管炎、心脏衰竭,ILD,双边均匀GGOs被发现在一个,两个,分别和7例。更多的双边均匀GGOs观察患者ILD比与细菌性肺炎/细支气管炎和心脏衰竭(确切概率法, 。然而,COVID-19与双边同质GGOs明显多于ILD(确切概率法, 。

4所示。讨论

在这项研究中,我们比较的趋势rt - pcr阳性率与COVID-19新发感染人数在町田市(例如,我们医院所属行政区域)。我们的研究结果表明,这两种趋势几乎是相同的。在我们医院,rt - pcr在COVID-19疑似病例进行执行,和我们没有执行rt - pcr对随机选择的居民的患病率COVID-19在社区里,按照考试政策在日本。因为没有在我们医院院内感染或爆发在邻近地区,也被称为“集群”,我们推测,rt - pcr的结果在我们的医院和町田市新病例的数量没有显著差异。

另外,一半的患者积极的rt - pcr结果发现胸部CT,其中大多数是双边齐次GGOs。一些先前的研究报道,早期COVID-19与双边GGOs胸部CT (10- - - - - -12]。根据两个荟萃分析,其他典型的影像学表现包括小叶间隔增厚、相邻胸膜增厚,网状,(空气支气管征2,13]。双边均匀GGOs观察到在我们的患者中发现类似的早期阶段COVID-19在一项研究12]。这些发现很少观察到患者细菌性肺炎和支气管炎诊断同时可能是重要的区分COVID-19从其他形式的肺炎。不过,鉴于ILDs-especially药物引起的肺炎、不明原因引起的肺炎、组织和嗜酸性肺炎——正在发现相对类似于结合双边均匀GGOs合并(16- - - - - -18),临床医生应该仔细进行医学访谈和检查其他实验室发现ILD有别于COVID-19。

町田市位于西南部的一只名叫阿玉的东京地区,有大约430000人口。町田市医院是唯一公立医院町田市,是一个区域医疗中心,包括急性护理。因为许多急诊病人去医院,是非常重要的识别COVID-19其中,但鉴别诊断常常是困难的。在这项研究中,新的COVID-19病例的数量在町田市,积极PCR测试在我们医院一般协议。PCR积极性率可以用来预测COVID-19在该地区的流行,和系统治疗COVID-19可以调整根据其患病率。此外,由于两国同构GGOs COVID-19特点,他们可能帮助COVID-19有别于其他形式的肺炎。因此,我们的研究结果COVID-19治疗和地区医学具有重要意义。

我们的研究有一些局限性。首先,很难评估日常积极率的少数情况下,和一个单独的机构研究,不一定反映的情况町田市等更广泛的领域。此外,因为这个研究是回顾性的,需要进一步的前瞻性研究来评估的有效性双边均匀GGOs COVID-19的诊断。然而,通过将测试期间和新病例分成间隔约1周,我们可以评估趋势正利率和町田市新病例的数量。我们的研究可能有助于许多机构,必须平衡COVID-19保健和传统的医疗实践。

5。结论

我们的分析表明,rt - pcr阳性率在我们医院和新的COVID-19病例町田市的数量往往是相似的。鉴于两国同构GGOs COVID-19肺炎的特点,这些CT发现可能帮助COVID-19的诊断。

数据可用性

所有案例的背景和特征数据用于支持本研究的发现可以从相应的作者。町田市新感染的人数是基于町田市政府网站上公布的数据(https://www.city.machida.tokyo.jp/iryo/hokenjo/health_crisis_management/number_of_infected.html)。

的利益冲突

明仁天皇Taisuke Kazuyori佐藤,Yasuhiro森本晃司,Kazuyoshi Kuwano声明没有利益冲突有关的出版。

资金

本研究经费是由作者提供。

确认

我们要感谢Editage (http://www.editage.com/)的英语编辑。

引用

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