文摘

背景。帕金森病(PD)是一种与年龄相关的神经退行性疾病受到多个基因和环境因素的影响。我们进行了病例对照研究候选基因检查是否遗传变异LRRK2,SNCA,ITGA8偶发性帕金森氏病相关基因可能是中国汉族人口。方法。五个单核苷酸多态性(SNPs)LRRK2(rs1491942),SNCA(rs2301135 rs2301134 rs356221),ITGA8(rs7077361)之间的选择和基因分型583无关的PD患者和558名健康对照组。结果。Rs1491942的LRRK2基因的基因型频率显著升高( )和等位基因G / C频率( )比控制PD患者。Rs2301135的SNCA基因的基因型频率(也显示出一个明显的差异 )和等位基因G / C频率( )之间的PD患者和控制。单核苷酸多态性rs2301134和rs356221SNCA基因和rs7077361ITGA8基因缺乏重大协会在中国汉族人口与帕金森病的易感性。结论。我们的研究首先rs1491942的表达LRRK2和rs2301135SNCA基因是显著相关的零星的帕金森病在中国汉族人群。

1。介绍

帕金森病(PD),第二个最常见的神经退行性疾病老年痴呆症后,由两个主要的病理特点:多巴胺神经元和路易小体的存在(磅)。PD的经典表现特点是静止震颤、僵直,动作迟缓,姿势反射的障碍。此外,一些非典型的nonmotor特性,如睡眠障碍、情绪障碍、自主神经功能障碍,感觉问题,最近和认知障碍,是高度关注。即使接受有效的治疗方法,PD是进步的,甚至在某种程度上导致残疾或死亡。

越来越多的证据支持复杂的因素很多,帕金森病的易感性,包括遗传和环境因素(1- - - - - -3]。在过去的几十年里,大量的全基因组关联研究(GWAS)候选基因复制研究(CGRS),和随后的荟萃分析研究发现,许多潜在的基因和单核苷酸多态性(snp)与帕金森病有关,包括风险变异和保护的变异4]。此外,前面的候选基因研究提供了确凿的证据显示单核苷酸多态性LRRK2,SNCA,ITGA8基因显著影响帕金森病易感性及疾病特征。

数的变化LRRK2基因被确定为PD的危险因素。例如,rs34778348 (G2385R c.7153G >)和rs33949390 (R1628P c.4883G > C)被认为与PD在亚洲人口5,6]。另一个新颖的SNP在LRRK2rs1491942,发现负责PD在高加索人群(7,8]。然而,这是以前从来没有在中国汉族人口报告。

SNCA作为第一个致病基因发现PD,编码α磅的主要组件-核蛋白,帕金森病的病理特点。从那时起,几单核苷酸多态性SNCA具有高度的遗传风险因素视为零星PD。位于启动子区域SNCA,两个snp等位基因频率高的(rs2301134和rs2301135)在一些研究报道透析相关snp在欧洲和台湾军团(9,10]。一个SNP (rs356221) 3′UTR区域SNCA与偶发性帕金森氏病易感性基因显示协会在日本和台湾的军团10,11]。所有这三个单核苷酸多态性SNCA(rs2301134 rs2301135和rs356221)尚未在中国内地的汉族人口调查。

而ITGA8(i型跨膜蛋白编码整合素α8日)基因首先证明与特发性帕金森病在Simon-Sanchez白人人口的研究(4),这不是特色作为PD相关基因直到莉儿的研究显示其潜在与PD (8]。还需要更多的研究来筛选潜在的致病性变异在这个基因和评估潜在的这些变异在PD发病机制中的作用。

没有研究探讨了协会的三个基因与帕金森病及其单核苷酸多态性在中国汉族人群。这里,我们执行第一个SNP复制研究SNP在以前发表的结果SNCA(rs356221 rs2301134 rs2301135),LRRK2(rs1491942),ITGA8(rs7077361)基因在中国汉族人口探索民族差异和PD的诊断识别预测因素。

2。方法

2.1。主题

本研究新兵1136例第一附属医院神经内科的厦门大学,其中包括583名中国汉族零星的PD患者和553名匹配的健康对照组。PD的诊断同时与英国帕金森症的诊断标准的社会大脑银行(12]。在所有的PD患者,平均年龄是65.10岁 8.90和男女患者的比例是320:263。群控制由健康志愿者的第一附属医院医疗中心的厦门大学,平均年龄是65.37岁 9.03,男性对女性患者的比例是286:267(表1)。所有科目是汉族人口,两组相匹配的年龄,性别,种族,和居住的区域。此外,本研究获得了当地伦理委员会批准,所有患者和控制签署知情同意。

表1
人口特征的帕金森病(PD)病例和控制。
2.2。基因分析

静脉血标本收集直接从所有PD患者和健康对照组与乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝剂。基因组DNA与QIAamp从血液样本中提取DNA迷你包(试剂盒、希尔登,德国)根据制造商的指示和储存在−20°C。五个snp基因分型的多路复用快照技术(应用生物系统公司被生活技术,促进城市,CA,美国)。每个SNP位点的引物设计使用引物5和表中列出2。多重PCR反应放大目标执行区域包含所选单核苷酸多态性。所有产品由ABI分析棱镜3730 DNA序列,序列的分析是由DNA测序分析软件,GeneMapper4.0。确认结果,10%的患者和10%的控制是Sanger测序方法随机选择。复制方法的和合率是100%。

表2
PCR和快照探针引物序列。
2.3。统计分析

与SPSS统计分析处理,版本20.0(美国、IBM、纽约Armonk)。临床数据表示为手段 连续变量的标准偏差(SD)和数字(百分比)定量变量。学生的t年龄以及用于比较变量之间的病人和控制。性别变量卡方检验评估。等位基因频率和基因型差异情况和控制为每个SNP检测通过皮尔逊卡方检验和确切概率法。意义的标准设置 基于双方的所有测试。计算出的统计力量是力量和3.1.2样本量计算版本。哈迪温伯格平衡(HWE)采用公共统计web测试工具(http://ihg.gsf.de/cgi-bin/hw/hwa1.pl)。Haploview程序(13)用于计算连锁不平衡(LD)三个单核苷酸多态性SNCA的。

3所示。结果

每个SNP基因型和等位基因频率的1136例(583名患者和553名健康对照组)如表所示3。PD患者中,131例(22%)有一个早期发病的年龄(< 50年),约77%的患者LOPD(≧50年)。年龄( )、性别( )PD患者和没有统计学差异控制在我们的研究中。所有受试者民族汉斯。

表3
基因型频率和等位基因频率的比较LRRK2,SNCA,ITGA8多态性。

之间的连锁不平衡SNCA单核苷酸多态性rs2301134 rs356221 它是0.235,而对于rs356221和rs2301135 = 0.066和rs2301134 rs2301135 = 0.127。这表明弱相关性在rs2301134 rs2301135, rs356221。

单标记分析显示显著统计协会在我们的研究中。两个单核苷酸多态性SNCA和LRRK2基因显示 值< 0.05校正之前,这两个估计口服补液盐> 1.4。最好的 价值snp两LRRK2和SNCA基因进一步年龄分层分析。

之间的所有PD患者和控制,LRRK2基因表现出显著差异的基因型频率变体rs1491942 ( )和等位基因G / C频率( , ,95%的置信区间:1.55—-2.30)。在的三个单核苷酸多态性SNCA基因变体rs2301135遇到基因型频率的统计标准( )和等位基因G / C频率( ,或 7.857,95%置信区间CI: 4.05 - -15.26)。的ITGA8变体rs7077361未能显示显著差异在这个集团( )。

EOPD子群的病人和对照组(年龄< 50年),差异仍明显变异的基因型频率rs1491942LRRK2基因( )和等位基因G / C频率( ,或 1.924,95%置信区间CI: 1.24 - -2.98)。三个单核苷酸多态性SNCA基因( )和一个SNPITGA8基因( )在这一组没有表现出显著差异。的统计数据LOPD≧50岁的病人和控制也超过了阈值的意义。的变体rs1491942LRRK2基因显示 2.538 e-07基因型频率的值。和等位基因频率有一个G / C 值为2.459 e-08虽然还是1.874,和95%可信区间从1.50到2.34不等。rs2301135变体的区别是显而易见的SNCA基因的基因型频率( )和等位基因G / C频率( 或= 7.846,95%置信区间CI: 4.03 - -15.29)的子群。所有的单核苷酸多态性在我们的研究中遇到了哈迪温伯格平衡的rs2301135除外SNCA基因,表所示3。

4所示。讨论

自第一个全基因组关联研究零星的帕金森病在2005年执行,一个新时代开始获得关注在帕金森病的遗传基础14]。基因分型技术的进步和荟萃分析允许研究人员迅速识别常见变异与PD在不同人群4]。尽管一些前面提名PD的风险基因首先报道在熟悉的帕金森病(如SNCA和LRRK2),他们两个都不相关的零星的PD患者成功地复制(15]。额外的相关研究和随后的荟萃分析作出了很多贡献确定注意变体,也可以驱动PD风险,ITGA8作为一个例子(8]。

LRRK2基因是首先出现在Zimprich透析相关基因的研究与常染色体显性遗传的家庭,晚发性帕金森症(2004年16]。在不同的域的变异LRRK2已确定在家族和零星的PD在不同人群17- - - - - -19]。Rs1494942在LRRK2以前发现与PD在美国和欧洲系列(8,20.]。我们的结果与之前的研究相一致,表明多态性rs1491942LRRK2偶发性帕金森氏病的风险位点,不同航空公司可能共享一个类似pathomechanism不同人群。据报道,LRRK2变体运营商共享类似的临床和病理特征,包括野生的发病年龄,典型的帕金森症表现,对左旋多巴治疗(21]。在我们的PD患者中,rs1491942显示更高频率EOPD和LOPD子组与匹配控制。这些表明rs1491942并不影响发病年龄,但是有助于EOPD的发病机制和LOPD以类似的方式。

SNCA是第一个发现因果基因家族PD (22]。我们的研究结果与先前的报道是一致的协会的多态性SNCAPD的易感性在美国、挪威和意大利研究[23- - - - - -25]。三个单核苷酸多态性的连锁不平衡SNCA表明这些snp基因是独立的。启动子区域附近只有一个SNP (rs2301135)显示PD患者和对照组之间的显著差异在中国汉族人群。发病的年龄、rs2301135更可能与晚发性帕金森病在我们的研究中,而另一项研究在英国的建议SNCAPD的危险等位基因可能与早些时候出现PD (26]。鉴于rs2301135的基因型频率和等位基因频率SNCA基因不遵循哈迪温伯格平衡在我们的研究中,这表明不适当的人口分层和选择的可能性或其他混杂因素在我们的研究中。因此,这些结果应该仔细解释。

ITGA8表达在大脑中转信息交互和调节神经突的感觉和运动神经元(8]。ITGA8基因首先显示与PD在Simon-Sanchez白人人口的研究,但未能复制在其他研究的希腊,爱尔兰和波兰系列(4,19,20.]。ITGA8变体rs7077361显示,没有证据表明与PD的人口。病人和控制,观察到加的SNP rs7077361类似报道1000基因组南方汉族人口(CHS)。然而,没有足够的力量与PD检测rs7077361协会当前样本大小。缺乏协会中国汉族人口可以归因于rs7077361有限的样本大小和罕见的SNP在中国人口的存在。从多中心大样本试验需要更好地理解rs7077361的贡献ITGA8帕金森病易感性。

总之,目前的研究提供了相当多的证据支持遗传变异对PD风险的重大影响。它不复制rs2301134和rs356221的易感性SNCA和rs7077361ITGA8PD但确认单核苷酸多态性rs1491942LRRK2和rs2301135的年代NCA偶发性帕金森氏病基因易受中国汉族人口。某些变异负责这种疾病的发病率,而其他变体可能修改的发病年龄,这表明PD的不同的方面有一个特定的基因结构。还需要进一步的研究来丰富遗传PD的体系结构。

相互竞争的利益

作者宣称没有利益冲突。

作者的贡献

杰方和Kehui易造成同样这项工作作为第一作者。

确认

作者要感谢所有参与本研究的患者和对照组。作者想感谢晶晶阴,老师从新东方英语培训学校(电子邮件:(电子邮件保护)),大量的英语编辑。这项工作是支持的福建(没有医疗技术创新项目。2014 - cxb 33)、厦门(不重要的联合研究项目的主要疾病。3502 z20149028)、厦门(没有科技项目。3502 z20154014),中国国家自然科学基金(没有。81400912)、福建省自然科学基金(没有。2015 j01544)。