抗菌素耐药性的肠沙门氏菌在中非共和国首都班吉

文摘

介绍。的数量沙门氏菌从临床分离样品的耐多种抗生素增加了全球。本研究的目的是确定耐药的患病率沙门氏菌血清隔离在班吉。方法。所有肠沙门氏菌菌株分离患者在2008年被确定和血清型,和抗性的表型是由使用磁盘扩散法。九resistance-associated基因,bla_TEM,bla_OXA,bla_SHV,tetA,aadA1,catA1,dhfrA1,南我,南二世在七寻求通过基因扩增年代。e。培养的菌株。结果。94株孤立是47岁东南部。沙门氏菌感染(50%)、21东南部。基桑加尼)(22%)、18东南部。肠炎(19%)、4东南部。都柏林(4%)、4东南部。哈达尔发现(4%),和1东南部。Papuana (1%)。抗多种抗菌素的25例(28%),包括20的沙门氏菌感染型(80%)。发现两个主要表型的阻力:四个抗生素(56%)和五个抗生素(40%)。一个东南部。沙门氏菌感染隔离了extended-spectrumβ内酰胺酶(ESBL)。只有7个菌株东南部。沙门氏菌感染可以放大genically。只有表型耐四环素和aminosides被发现。结论。年代。沙门氏菌感染是主要的肠型美国血清最广泛耐药。寻找抗性基因显示流行株的异质性。

1。介绍

沙门氏菌病是一种常见的疾病。的菌株沙门氏菌血清不负责伤寒,但主要用于肠道感染;然而,沙门氏菌感染最常见型,可能引起系统性感染,特别是在免疫功能低下的患者和儿童营养不良,严重贫血,和疟疾1,2]。菌株的沙门氏菌耐多种抗生素被孤立的越来越频繁。因此,常用的抗生素已经成为低效(3),有,取而代之的是更多的昂贵的药物4]。中非共和国的最新调查(汽车)显示高患病率的抗氨苄青霉素、复方磺胺甲恶唑(5),它是随时间增加。确认这个进化,我们确定了抗生素耐药性的菌株美国血清在2008年独立。此外,我们研究了抗多种抗菌素的菌株年代。基因扩增的九沙门氏菌感染的最常见的基因和抗生素耐药性有关。

2。方法

临床细菌学的研究是在单位和巴斯德研究所的Antibioresistance de班吉在2008年7月和12月之间。九十四株的沙门氏菌是孤立的,主要来自粪便(56%)和血液(36%);两株从尿液和脑脊液。沙门氏菌确定了生化特征的基础上(API 20吗^E条,bioMerieux Craponne、法国),根据Kauffmann-White确定型计划。抗菌素药敏是由使用磁盘扩散法(Bio-Rad、Marnes-la-Coquette、法国)Mueller-Hinton琼脂(尼古拉斯)的建议和解释根据拉西de l 'Antibiogramme de la法国法国Microbiologie (CA-SFM) (http://www.sfm-microbiologie.org/)。所有隔离测试他们对抗菌药物的敏感性经常用于临床实践沙门氏菌感染的车。抗生素包括氨苄西林(25μg),阿莫西林(20μg),克拉维酸(10μ羟基噻吩青霉素(75克)μg)、头孢噻吩(30μg)、头孢噻肟(30μ10 g)、链霉素(UI)、庆大霉素(15μ萘啶酸(30克)μg)、环丙沙星(5μ氯霉素(30克)μ磺胺类药(200克)μ30 g),四环素(UI)。如果expanded-spectrumβ内酰胺酶(ESBL)被发现,附加的抗生素进行测试(β-lactams和氨基糖甙类)。菌株被储存在脑心汤−80°C (Bio-Rad)和20%的甘油。

九resistance-associated基因寻求通过PCR技术(表发表1随机选择6株)和ESBL-producing压力。在亚文化Mueller-Hinton琼脂(Bio-Rad), DNA提取的细菌悬浮液热解在100°C水浴5分钟,随后快速冷却20°C。离心后(8855 g×10分钟),上层清液用于DNA扩增。PCR基因Amp PCR系统上运行9700 Thermocycler(应用生物系统公司、Saint-Aubin、法国)如前所述[6,7,16]。扩增子的大小确定,从分子质量阶梯(SmartLadder科幻,EuroGentec、激怒、法国)凝胶电泳在2%溴化乙锭(Eurobio, Les乌里,法国)含有琼脂糖(表达载体、- pontoise、法国)Tris-acetate缓冲区在pH值8和运行在100 V, 200毫安1 h。结果读下紫外线。一个负面的(无菌蒸馏水)和三个积极的(年代。康科德07 - 670,年代。沙门氏菌感染02 - 8213,痢疾1汽车10)控制包括在内。

3所示。结果

的94株沙门氏菌包括47东南部。沙门氏菌感染(50%)、21东南部。基桑加尼)(22%)、18东南部。肠炎(19%)、4东南部。都柏林(4%),3东南部。哈达尔发现(4%),和1东南部。Papuana (1%)。25株(28%)抗多种抗菌素的:20王新宏。沙门氏菌感染(80%),3东南部。肠炎,1东南部。Papuana, 1东南部。基桑加尼)。其中,25隔离(28%)等东南部。沙门氏菌感染(),东南部。肠炎(),东南部。Papuana (),东南部。基桑加尼)()抗多种抗菌素的抗生素。研究患者由14个妇女和11人。他们1个月到40岁,平均年龄为11年。隔离是孤立的从凳子上()、血()、脑脊液()和尿液()。从血液中分离出菌株就用东南部。沙门氏菌感染。大多数菌株对阿莫西林,羟基噻吩青霉素、链霉素、磺胺类药、复方磺胺甲恶唑和少经常头孢噻吩(4%)、环丙沙星(2%)、庆大霉素(3%)和萘啶酸(4%)。除了一个人之外,所有菌株ESBL-producing年代。沙门氏菌感染菌株对头孢西丁(S1027072)敏感。ESBL-producing应变是对阿米卡星、妥布霉素netilmicin、卡那霉素、磷霉素、头孢他啶,头孢吡肟,aztreonam, nitroxoline;它只是imipenem仍敏感。否则,两个常见的电阻资料观察:14 (34%)(12年代。沙门氏菌感染和2年代。肠炎)对四种药物(氨苄西林、氯霉素、链霉素、磺胺类药)和10 (24%)(7年代。沙门氏菌感染,1年代。肠炎,年代。哈达尔发现,一年代。Papuana)五药物有耐药性(氨苄西林、氯霉素、链霉素、磺胺类药物和四环素)(表2)。

所有菌株进行catA1抗性基因,六个包含bla_TEM,dhfrA1,南二世,5包含我。的基因bla_OXA,tetA,aadA1只发现一次。的基因bla_SHV不存在,即使在ESBL-producing应变(表吗3)。

4所示。讨论

三型东南部。沙门氏菌感染(),东南部。基桑加尼)(21),东南部肠炎()构成分离菌株的96%。东南部。沙门氏菌感染和东南部。肠炎,肠沙门氏菌孤立的最频繁(8,9]。惊人的高患病率年代。基桑加尼班吉可能代表一个本地毒株。血液分离得到主要来自艾滋病患者(10- - - - - -13]。

东南部。培养的是沙门氏菌型是最耐抗生素。今天证实,其耐多药菌株出现在撒哈拉以南非洲地区(17]。在马拉维,入侵nontyphoidal耐多药的流行病沙门氏菌(定义为耐氨苄西林、氯霉素、复方磺胺甲恶唑)记录(17]。不断增加的电阻(14)将限制治疗可能性越来越多,出现一个例证的ESBL-producing应变(S1027072)。

沙门氏菌对药物发现4点至5点在非洲广泛。尽管班吉的患病率很高(58%),82%的沙门氏菌隔离已报告是耐药(14,15,18]。此外,抗氯霉素的患病率,阿莫西林、复方磺胺甲恶唑高(72%),发表在洛美(多哥)[15),但在台湾甚至更高(95%)(19]。这三个廉价抗生素用于一线治疗沙门氏菌病,但不能再被使用。第三代头孢菌素和氟喹诺酮类原料药的大多数菌株保持活跃沙门氏菌班吉;然而在亚洲,54%的菌株对这两种抗生素(20.,21]。环丙沙星(诺氟沙星)作为一线治疗,除了孩子,头孢曲松钠是首选(22]。系统的使用和自我药疗与这些抗生素,可以自由购买,提高担心可能会有阻力迅速增加(14,21]。

生长促进剂的使用四环素和青霉素畜牧业是一个因素在日益流行的电阻(23- - - - - -25),但没有这方面的信息可以在汽车。

我们只搜索部分解释表型的基因抵抗力。有许多抗性基因,一种体外抗可能有几种机制。例如,aminoside抵抗可能与三个基因有关:aphA(氨基糖苷类磷酸转移酶),协会的(氨基糖苷类乙酰转移酶)和aadA和aadB(两个变体的氨基糖苷类adenyltransferases) [24),所有这些都plasmid-encoded [25]。抗生素耐药性也可能与其他机制,如染色体突变(核糖体结构的修改,修改的细胞壁的通透性,和射流泵)的存在,不能被基因的扩增。然而,五个基因型在六个循环的存在东南部。沙门氏菌感染菌株耐宽四和五个药物表明异质性。

七resistance-associated ESBL菌株的基因不同于其他六;这是进口或在本地获得了质粒。的基因CTX-M-15被描述为最常见的车,被发现在吗大肠杆菌和肺炎克雷伯菌压力(6]。没有出现在抗多种抗菌素的东南部。培养的菌株,它的起源是未知的。很难确定哪些EBSL在场,没有其他隔离怀有这种酶,230 ESBLs描述到目前为止(26]。隔离的抗多种抗菌素的ESBL-producing应变在班吉是令人担忧的,就像它的传播使病人护理的有限访问在中国这样的压力敏感的抗生素(4,20.,26]。孤立的系统研究东南部。沙门氏菌感染菌株需要确定是否存在这一毒株。目前,这似乎不太可能,因为没有其他的隔离。

我们研究的主要局限是病人的数据特征(年龄、性别、感染艾滋病毒、疟疾的地位,和营养不良状况)没有收集。事实上,这将是至关重要的结果来评估这些特征的影响。

5。结论

这个初步研究演示了一个耐药性的流行率很高年代。沙门氏菌感染和不同相关的基因在班吉。进一步的研究将阐明抗生素耐药性的流行病学和能够描述基因和质粒携带它们。在缺乏合理使用抗生素,连续传播耐药菌株是可能的。系统应该执行抗菌谱分离的菌株为所有遵循进化的阻力,从而确保有效治疗感染、免疫功能低下的患者的特别关注。

利益冲突

作者宣称他们没有利益冲突有关的出版。

作者的贡献

基督教金刚石Mossoro-Kpinde Alain Le Faou,蒂埃里弗兰克参与研究设计,数据采集、分析和解释的结果,和起草。Jean-Robert Mbecko和Pembe也陆陆续续进行实验室分析。亚历山大Manirakiza参与数据分析,解释结果,和写作。所有作者批准了最终版本。

承认

这项研究是由巴黎巴斯德研究所(ACIP格兰特)。

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