文摘
氯霉素(背影)和neuroglobin之间的交互(Ngb)调查通过使用荧光,同步荧光、紫外可见和圆二色性(CD)光谱。人们已经发现,背影分子的固有荧光熄灭Ngb在动态猝灭机制的一种方式,通过紫外可见光谱数据的支持。他们的有效猝灭常数( 氯霉素(排名2 2-dichloro-N - ((1 r, 2 r) - 1, 3-dihydroxy-1——(4-nitrophenyl) propan-2-yl)乙酰胺,化学结构如图<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig1/" target="_blank">1一个>)是一个广泛的抑菌抗菌;它表现出抗菌活性对革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌,以及其他微生物组(<一个href="#B1">1一个>, Neuroglobin (Ngb),球蛋白家族的新成员,是最近发现的Burmester等人在人类和小鼠(unfpa<一个href="#B10">10一个>, 值得注意的是Ngb主要表达在中枢神经系统中,与此同时我们注意到这一事实的背影可以穿透血脑屏障及其在脑组织浓度等于甚至超过那些在等离子体。考虑所有这些因素,有必要研究之间的交互的背影和Ngb更好地理解他们的分子间相互作用机理和可能的有害副作用的背影,以及Ngb的生理作用。本文的背影和之间的交互Ngb在不同的温度下研究了荧光,紫外-和CD谱,旨在更好地理解的毒理学效应的背影,在分子水平上探讨其绑定机制。
氯霉素是购自Sangon(上海,中国)。pET3a质粒DNA包含人类Ngb的基因就送给教授Burmester, unfpa德国古腾堡大学的美因茨。 AKTA净化器100快速蛋白液相色谱(Amersham生物科学、瑞典),HP8453A二极管阵列分光光度计(美国),LS-55荧光光谱仪(美国珀金埃尔默)和Jasco j - 810分光偏振计(日本)。
pET3a质粒的转化为人类Ngb基因 稀释Ngb的股票在20更易·L 荧光光谱被记录在LS-55荧光光谱仪(美国珀金埃尔默)在不同温度(298 K, 303 K, 308 K),与10/5 nm激发/发射通道的带宽。激发波长为280 nm,发射是在290 - 420海里。适当的空格缓冲区被减去对应正确的背景荧光。
同步荧光光谱收集同时扫描激发和发射单色仪的波长250 - 600纳米,常数时间间隔( 在室温下吸收光谱被记录在8453年惠普二极管阵列谱仪(美国惠普公司(hewlett - packard)。
圆二色性光谱测量与Jasco j - 810分光偏振计(Jasco、日本)氮以恒定流量5 L / min。技术参数设置是250 - 190 nm波长范围,扫描速率100海里/分钟,通路长度试管0.1厘米,分辨率0.1 nm,时间常数0.1 s和扫描的数量2。
芳香族氨基酸的固有荧光蛋白质长期以来一直作为一种有效的方法来研究蛋白质局部构象。色氨酸残基的荧光敏感蛋白质结构的扰动,而量子收益率低苯丙氨酸和酪氨酸渲染这些探针对此类研究不太有用。三个色氨酸和酪氨酸残基四个位于Ngb的不同领域<一个href="#B19">19一个>]。为了研究绑定Ngb的背影,Ngb的荧光发射光谱的背影在不同浓度的记录在激发280海里;数据在三个温度298 K, 303 K, 308 K收集,分别。图<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig2/" target="_blank">2一个>显示了Ngb的荧光发射光谱的背影在不同浓度的303 K。从图可以看出<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig2/" target="_blank">2一个>Ngb的荧光强度降低而不改变发射波长和峰值形状的背影浓度的增加,建议的背影可以与Ngb及其内在荧光猝灭。
荧光猝灭过程可以发生在不同的机制,通常划分为动态猝灭和静态猝灭。这可能是杰出的变量依赖于温度和粘度(<一个href="#B20">20.一个>]。自从在更高的温度下分子的扩散系数为动态猝灭更大了,预计猝灭常数随着温度的增加而增加。相比之下,一个更高的温度会降低其稳定性的复杂,导致较低的淬火为静态猝灭常数(<一个href="#B2">2一个>]。分析了荧光猝灭通常使用Stern-Volmer方程[<一个href="#B21">21一个>] 在这个方程, 药物和生物分子之间的相互作用力量,包括疏水力、氢键、范德华力和静电相互作用[<一个href="#B23">23一个>]。可以阐明CHL-Ngb交互的绑定模式相互作用的热力学参数。热力学参数的值等 罗斯和萨勃拉曼尼亚(<一个href="#B24">24一个>)特征相关的热力学参数的符号和大小各种单独的类型的相互作用可能发生在蛋白质协会过程如下: 从表可以看出<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/tab1/" target="_blank">1一个>自由能变化为负( 当小分子绑定独立一组等效高分子网站,结合常数 同步荧光光谱是一个非常有用的方法来研究氨基酸残基的微环境(<一个href="#B26">26一个>]。通过选择不同的波长间隔,色氨酸和酪氨酸残基的特征荧光峰重叠的常规荧光光谱可以孤立<一个href="#B27">27一个>]。如图<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig6/" target="_blank">6一个>,当 紫外可见光谱研究是一个非常简单的方法来探索一种蛋白质样品的结构变化。图<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig8/" target="_blank">8一个>显示的背影Ngb的紫外可见光谱的影响。Ngb的铁形式显示大的振幅 圆二色性光谱是一种独特的光学技术研究蛋白质的二级结构的变化。为了研究Ngb的背影对二级结构的影响,CD谱了。图<一个href="//www.newsama.com/journals/jspec/2012/192591/fig9/" target="_blank">9一个>显示的CD光谱Ngb在缺乏,在不同浓度的背影。Ngb的CD光谱表现出两个负面乐队在208和222海里远紫外区域,导致了 的背影与Ngb的相互作用已经被不同的光谱方法研究包括荧光光谱、同步荧光光谱、紫外可见吸收光谱,CD光谱。荧光光谱结果表明,排名可以通过动态猝灭Ngb的固有荧光猝灭机制,由紫外可见光谱的结果,还支持和相互作用的热力学参数表明,疏水的力量在这个过程中扮演着重要的角色。此外,同步荧光光谱表明,色氨酸和酪氨酸残基的微环境改变,和酪氨酸残基的荧光猝灭效率排名更明显比Ngb的色氨酸残基。此外,CD光谱表明,排名可以诱导形成的 作者感谢教授t Burmester提供人类的基因unfpa neuroglobin友好。这项工作得到了国家自然科学基金(21142003,21142003),中国山东省自然科学基金(没有。ZR2011BL002),山东省泰山学者研究基金。
1。介绍
2。实验
2.1。材料和工具
2.2。制备Neuroglobin
2.3。光谱测量
3所示。结果与讨论
3.1。荧光光谱
3.2。类型的背影和Ngb之间的相互作用力
3.3。绑定平衡分析
3.4。同步荧光光谱
3.5。紫外可见光谱
3.6。圆二色性谱
4所示。结论
确认
引用
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