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全球代谢组学已经成为一个强大的工具来审问细胞生物化学在系统层面上通过跟踪改变小分子的水平。一种方法来定义细胞动力学对小分子的失调已经考虑代谢通量作为时间的函数。虽然通量测量已被证明有效的生物模型,获得多个时间点在适当的时间间隔对许多样本类型(例如,临床标本)是具有挑战性的。作为替代,荟萃分析提供了另一种策略描述代谢因果扰动。没有针对性的结合,从多个成对比较使代谢组学数据协会的具体变化小分子具有独特的表型变化。我们最近开发了代谢组学软件叫做metaXCMS自动化这些类型的高阶的比较。这里我们讨论的潜力metaXCMS分析蛋白质组学数据集和突出的生物价值结合meta-results代谢组学和蛋白质组学分析。合并后的荟萃分析有可能促进功能基因组学和代谢中断的识别与疾病发病机理有关。