《光谱学

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《光谱学/2008/文章

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体积 22 |文章的ID 494869 | https://doi.org/10.3233/SPE-2008-0363

克里斯蒂娜·蒙泰安,Ioan Bratu 拉曼光谱研究在降低pH值和Mn存在下牛胸腺DNA的亚皮秒动力学2+离子",《光谱学 卷。22 文章的ID494869 15 页面 2008 https://doi.org/10.3233/SPE-2008-0363

拉曼光谱研究在降低pH值和Mn存在下牛胸腺DNA的亚皮秒动力学2+离子

摘要

本文测定了牛胸腺DNA振动的拉曼总半频随pH值(3.45 ~ 6.4)的变化2+分别离子。报道了DNA分子亚基结构和pH值对半带宽和全局弛豫时间的依赖关系。结果表明,利用拉曼光谱可以监测牛胸腺DNA分子亚皮秒动力学的变化。特别是728 cm振动的拉曼波段参数1(dA), 787厘米1(直流),1093厘米1(PO2- - - - - -), 1376厘米1(dA, dG, dT, dC), 1489 cm1(dG, dA)和1578厘米1(dG, dA)的MnDNA配合物,还原和低pH值,提出。在我们的研究中,牛胸腺DNA条带的半最大全宽(FWHM)通常在11 ~ 27 cm的波数范围内1.可以观察到,本文研究的分子弛豫过程的全局弛豫时间小于0.965 ps,大于0.393 ps,其极限值分别为dA和dC残基(振动在728和787 cm)的特征1).低ph值诱导的小牛胸腺DNA双螺旋结构的熔融,在Mn的存在2+离子,结果在更小的全局弛豫时间和更大的带宽,分别由于增加的碱基团与溶剂分子的相互作用。这种行为在787 cm波段最为明显1在1578厘米下,pH值为3.81高达pH 3.45,并部分确认为DNA主干PO2- - - - - -1093厘米对称拉伸振动1腺嘌呤带在728 cm处获得了最快的分子动力学1pH值为3.45 ~ 3.8(全局弛缓时间为0.885 ps),胞嘧啶环呼吸模式接近787 cm1在pH值3.8左右(全局弛豫时间0.393 ps),谱带为1093 cm1在pH区间3.8-4.4(全局弛豫时间0.518 ps)和振动在1578 cm附近1pH值为3.45(全局弛豫时间0.544 ps)。比较了不同时间尺度的振动能量传递过程,并对质子化MnDNA结构亚群进行了表征。研究发现,金属离子的类型和浓度是DNA分子亚基的(亚)皮秒动力学的调节剂。

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