朗吴、刘魏、优雅y,黄养心
纵向和生存分析数据:联合建模、推理方法和问题
朗吴,
1部门统计,不列颠哥伦比亚大学,温哥华BC,加拿大
2数学和统计,约克大学,多伦多,加拿大
3部门统计和精算,滑铁卢大学,滑铁卢,加拿大
4流行病学和生物统计学、公共卫生学院,南佛罗里达大学,坦帕,高度层33612,美国
文摘
在过去的二十年里,联合模型的纵向和生存数据文献中得到太多的关注。这些模型往往是可取的下列情形:(i)生存模型与测量错误或缺失的数据时间,(2)纵向模型用有用的辍学者,和(3)生存的过程和一个纵向的过程通过潜变量相关联。在这些情况下,单独的推论基于纵向模型和生存模型可能导致偏见或效率低下的结果。在这篇文章中,我们提供一个简要的概述纵向和生存数据的联合模型和常用的方法,包括方法和可能性两阶段方法。
1。介绍
纵向数据和生存在实践中经常出现在一起。例如,在许多医学研究,我们经常收集病人的信息(例如,血压)不断随着时间的推移,我们也感兴趣的恢复时间或复发的疾病。纵向数据和生存数据往往<我>相关的我>在某些方面。时间事件可能与纵向轨迹有关。<我>单独的我>分析纵向数据和生存数据可能导致效率低下或有偏见的结果。纵向和生存数据的联合模型,另一方面,同时将所有信息,并提供有效的和有效的推论。
gydF4y2Ba图
(一)
(b)

(一)

(b)
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SE:标准误差;疯牛病:引导标准误差。的 |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
的参数
在本节中,我们进行仿真对比研究联合模型法和两阶段法/引导标准误差修正。我们从时间产生500数据集协变量CD4过程(
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
在表
gydF4y2Ba从上面的结果,我们看到联合似然方法产生偏见的估计和更可靠的标准误差小于两阶段方法。这些结果具有重要意义。例如,如果一个使用Wald-type测试模型选择,可能方法将提供更多可靠的结果。然而,两阶段方法通常更简单和更快计算输出比似然方法估计。我们也可以比较这两种方法和贝叶斯方法。注意,然而,贝叶斯方法是等价的可能性方法当noninformative先知先觉。我们预计,贝叶斯方法有类似的可能性方法的性能。
我们提供了一个简短回顾共同联合模型和推理方法。在实践中,当我们需要考虑一个纵向的过程和事件过程和怀疑,这两个进程可能是相关的,如生存协变量模型与时间或纵向模型用有用的辍学生,重要的是使用联合模型推理方法,以避免偏见的结果。模型选择的文献联合模型是相当有限的。在实践中,可以选择最好的纵向模型基于观察到的纵向数据,可以选择最好的生存模型基于生存数据,使用这些模型的标准模型选择过程。然后,我们指定合理的两个模型之间的联系,比如共享随机效应。选择推理方法,联合似然方法通常会产生最可靠的结果<我>如果我>假定的模型和分布是正确的。另一方面,两阶段方法可以计算简单,许多现有的模型和方法对纵向数据可以很容易地适应和生存数据。然而,两阶段方法可能不会完全消除偏见的参数估计在某些情况下。
gydF4y2Ba当纵向协变量过程终止事件的时候,也就是说,当事件后的纵向值不可用,如死亡或辍学,反是;有时被称为<我>协变量内部时间我>。有时,然而,纵向协变量信息和事件后可用。例如,CD4测量可能仍然可用后患者被诊断出患有艾滋病。这些有时被称为反是<我>外部协变量我>。在联合模型中,重要的是要区分内部和外部的协变量时间。特别是,对于内部时间,联合模型更可取,因为单独分析在这种情况下可能会导致更严重的偏见。
gydF4y2Ba协变量生存模型与测量误差时间联合模型文献中得到太多的关注。另一个常见的情况是纵向模型用有用的辍学生,生存模型可用于模型的辍学的过程。这两种情况下都专注于描述纵向和生存之间的关系的过程。一些作者也认为联合模型的重点是更高效的推理生存模型,使用纵向数据作为辅助信息(
gydF4y2Ba也可以扩展到联合模型<我>多变量情况下我>,不止一个纵向流程和多个事件流程可同时进行设计。扩展通常概念简单,但是计算和实现可以比单变量情况下更乏味。看到亨德森et al。
gydF4y2Ba曾和蔡
gydF4y2Ba虽然在关节模型已经被广泛的研究在过去的二十年,联合模型的重要性已经越来越认可,联合模型还没有广泛应用于实践。主要原因可能是缺乏软件。最近,Dimitris Rizopoulos开发了一个名为R包<我>JM可以用来配合联合模型与普通纵向反应和事件时间下最大似然方法。各种选项的生存模型和优化/集成算法提供,如生存Cox模型和尾模型数据和Gauss-Hermite集成方法和拉普拉斯近似。
作者感谢编辑和两个裁判帮助和建设性的意见。支持的研究部分加拿大自然科学和工程研究理事会(NSERC)发现赠款l .吴w·刘,g . y .易和NIAID / NIH AI080338和MSP /国家安全局格兰特h98230黄- 09 - 1 - 0053 y。
引用
- a . a . Tsiatis和m . Davidian“纵向联合建模的概述和比较数据,”<我>Statistica中央研究院我>,14卷,第818 - 793页,2004年。
视图:谷歌学术搜索
- 诉De Gruttola和x m .涂”造型的CD4-lymphocyte计数和生存时间的关系,“<我>生物识别技术我>,50卷,不。4、1003 - 1014年,1994页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- m . s . Wulfsohn和A . A . Tsiatis”联合模型为生存和纵向数据测量错误,”<我>生物识别技术我>,53卷,不。1,第339 - 330页,1997。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- r·亨德森和a·多布森,p·迪格”联合纵向测量造型和事件时间数据,”<我>生物统计学我>1卷,第480 - 465页,2000年。
视图:谷歌学术搜索
- 王y和j·m·g·泰勒,“联合建模时间纵向和事件数据与应用程序,获得性免疫缺陷综合征”<我>美国统计协会杂志》上我>,卷96,不。455年,第905 - 895页,2001年。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- j·丁和J.-L。王”,与非参数建模纵向数据乘法与生存数据,共同随机效应”<我>生物识别技术我>,卷64,不。2、546 - 556年,2008页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- f·s·Nathoo和c·b·迪恩”空间多态过渡模型纵向事件数据,”<我>生物识别技术我>,卷64,不。1,p . 271 - 279、326、2008。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- w .你们、林x和j·m·g·泰勒,“半参数模型的纵向测量和比较一致两阶段回归标定方法,”<我>生物识别技术我>,卷64,不。4、1238 - 1246年,2008页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- 艾伯特p s和j·h·施”,在估计纵向测量和比较数据之间的关系用一个简单的两阶段过程中,“<我>生物识别技术我>,卷66,不。3、983 - 987年,2010页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- h . Jacqmin-Gadda c . Proust-Lima j·m·g·泰勒,和d . Commenges”分数测试纵向结果和时间之间条件独立事件联合潜类模型中的类,“<我>生物识别技术我>,卷66,不。1,11-19,2010页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- d . Rizopoulos韦贝克g . e . Lesaffre,“完全指数拉普拉斯近似联合建模的生存和纵向数据,”<我>皇家统计学会杂志》系列B我>,卷71,不。3、637 - 654年,2009页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- l .吴w·刘,x j .胡”联合推理HIV病毒动力学和免疫抑制测量误差的存在,”<我>生物识别技术我>,卷66,不。2、327 - 335年,2010页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- y黄、g . Dagne和l .吴“贝叶斯推理联合艾滋病毒动力学模型比较和纵向数据和偏态和协变量测量错误,”<我>医学统计我>,30卷,不。24日,第2946 - 2930页,2011年。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- 问:潘g . y .易,“边际治疗效果的评估方法相关的纵向和生存结果,“<我>统计和推理我>。在出版社。
视图:谷歌学术搜索
- 徐和s . l . Zeger“联合组成的纵向数据的分析措施和次重复的事件,“<我>英国皇家统计学会杂志》上的C系列我>,50卷,不。3、375 - 387年,2001页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- j·g·易卜拉欣·m·陈,d . Sinha“贝叶斯方法联合建模的纵向和生存数据与应用程序癌症疫苗试验,”<我>Statistica中央研究院我>,14卷,不。3、863 - 883年,2004页。
视图:谷歌学术搜索 | Zentralblatt数学
- r . j . a, d·b·鲁宾<我>缺失的数据统计分析我>在概率论与数理统计,威利系列,Wiley-Interscience,纽约,纽约,美国,第二版,2002年版。
- 美国自我和y Pawitan”建模疾病进展的一个标志和疾病的发作,”<我>艾滋病流行病学:方法论的问题我>:p .朱厄尔、k·迪茨和v . t .告别。,Birkhaauser,波士顿,质量,美国,1992年。
视图:谷歌学术搜索
- 答:a . Tsiatis诉DeGruttola, m . s . Wulfsohn”建模生存纵向数据测量与误差的关系:应用程序生存和艾滋病患者的CD4计数,“<我>美国统计协会杂志》上我>卷。90年,27-37,1995页。
视图:谷歌学术搜索
- p . Bycott和j·泰勒,“比较平滑技术CD4数据测量与误差时间Cox比例风险模型,”<我>医学统计我>,17卷,不。18日,第2077 - 2061页,1998年。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- g . Dafni和a . a . Tsiatis”评估临床结果指标测量误差时,“<我>生物识别技术我>,54卷,不。4、1445 - 1462年,1998页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- r·l·普伦蒂斯”协变量测量错误和失败时间回归模型参数估计,“<我>生物统计学我>,卷69,不。2、331 - 342年,1982页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- y . k .曾、f .谢长廷和j·l·王”联合建模的加速时间和纵向数据失败,”<我>生物统计学我>,卷92,不。3、587 - 603年,2005页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- f .谢长廷Y.-K。曾和J.-L。王”,联合建模的生存和纵向数据:可能性方法重新审视,“<我>生物识别技术我>,卷62,不。4、1037 - 1043年,2006页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- A . A . Tsiatis和m . Davidian“半参数估计量的协变量比例风险模型与纵向测量错误,”<我>生物统计学我>,卷88,不。2、447 - 458年,2001页。
视图:谷歌学术搜索
- x的歌,m . Davidian和A . A . Tsiatis”可能性半参数的纵向联合建模方法和比较数据,”<我>生物识别技术我>,卷。58岁的没有。4、742 - 753年,2002页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索|Zentralblatt数学
- x的歌声,c . y .王”半参数方法的联合建模与时变系数,纵向和生存数据”<我>生物识别技术我>,卷64,不。2、557 - 566年,2008页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- j . a . y . Lee Nelder, y Pawitan,<我>广义线性模型与随机效应:通过H-likelihood统一分析我>卷,106<我>专著的统计数据和应用概率我>查普曼&大厅/ CRC,伦敦,英国,2006年。
视图:出版商的网站
- c . l . Faucett和特区托马斯”,同时造型审查生存数据和协变量重复测量:吉布斯抽样方法,”<我>医学统计我>,15卷,不。15日,第1685 - 1663页,1996年。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- n . j .法律,j·m·g·泰勒,和h . m .桑德勒,“纵向疾病进展的联合建模标记和故障时间过程的治疗,”<我>生物统计学我>,3卷,第563 - 547页,2002年。
视图:谷歌学术搜索
- d . j . Lunn a托马斯:最好的,和斯皮格尔霍尔特d,“WinBUGS-a贝叶斯建模框架:概念、结构和可扩展性,”<我>统计和计算我>,10卷,不。4、325 - 337年,2000页。
视图:谷歌学术搜索
- l .吴x j·胡,h . Wu”非线性mixed-effects联合推理模型和事件在缺失数据的存在,”<我>生物统计学我>,9卷,不。2、308 - 320年,2008页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
- c . l . Faucett n .辛克物流和j·m·g·泰勒,“生存分析使用辅助变量通过多个归罪,艾滋病临床试验数据与应用程序,”<我>生物识别技术我>,卷。58岁的没有。1,37-47,2002页。
视图:谷歌学术搜索
- j·w·霍根和n . m . Laird,“基于模型的方法来分析不完整的纵向和故障时间数据,”<我>医学统计我>,16卷,不。1 - 3、259 - 272年,1997页。
视图:谷歌学术搜索
- 徐和s . l . Zeger”多个替代终点的评价。”<我>生物识别技术我>卷,57号1,第87 - 81页,2001。
视图:谷歌学术搜索
- d .曾庆红和j . Cai”联合最大似然估计的渐近结果分析重复测量和生存时间,“<我>统计年鉴我>,33卷,不。5,2132 - 2163年,2005页。
视图:出版商的网站 | 谷歌学术搜索
版权
版权©2012吴朗等。这是一个开放分布式下文章
更多相关文章对本文没有相关内容可用。
文章奖:2020年杰出的研究贡献,选择由我们的首席编辑。