分子识别Enterocytozoon bieneusi隔离来自尼日利亚的孩子

文摘

一项研究进行了检测和识别肠microsporidian物种在43个孩子从欧州,尼日利亚。使用嵌套式聚合酶链反应,9.3%的孩子被确认为阳性Enterocytozoon bieneusi。DNA测序的PCR产品显示三个已知基因型的存在之一(两个分离株的基因型和基因型K)和一个新的基因型。这项研究表明,人类或动物(或两者)可能的感染源的孩子,自确定基因型D和K之前检测到免疫功能不全的和免疫活性的患者和家畜。高多样性的识别还建议强化microsporidiosis在研究地区的传播。

1。介绍

小孢子虫目肠原生动物寄生虫,越来越被认为是重要的病原体对免疫功能受损者和营养不良的儿童。一些物种的生物感染人类已发现在动物和水,从而增加了人畜共患的担忧,食源性和水源性传播(1- - - - - -3]。Enterocytozoon bieneusi是最常见的microsporidian物种在人类感染肠上皮细胞和其他人类的上皮细胞(1]。尽管给予较少的关注,这种寄生虫正在成为腹泻在免疫力低下的一个重要病因和免疫活性的人1]。Enterocytozoon bieneusi引起慢性腹泻和体重在人类免疫缺陷病毒(HIV)感染的患者中,感染是越来越在器官移植受者(4- - - - - -6]。

虽然有很多机会研究生物体隐孢子虫和贾第虫属,microsporidiosis很少研究。这一初步研究确定物种——genotypes-involved microsporidiosis尼日利亚从欧州的儿童。

2。材料和方法

收集粪便样本随机从43 (33 diarrhoeic(76.7%)和10 (23.3%)nondiarrhoeic)孩子们参加一个医院的门诊部在欧州,尼日利亚西南部。这些样本处理土壤对DNA提取FastDNA旋转设备(美国俄亥俄州议员生物制剂,梭伦,)。的检测大肠bieneusi,一个嵌套PCR用于放大~ 400 - bp片段内部转录间隔区(ITS)地区的核糖体rna基因(7]。PCR产品可视化在1%琼脂糖凝胶,溴化乙锭染色(7]。Enterocytozoon bieneusi基因分型的PCR产品的序列分析。

DNA测序的大肠bieneusi其产品是使用ABI棱镜3130基因分析仪和BigDye终结者测序工具包(美国应用生物系统公司,加州福斯特城)。互相与获得的核苷酸序列和参考序列从基因库下载使用ClustalX (http://www.clustal.org/)。大肠bieneusi基因型测定他们的相似性的序列已知的基因型和亚型。中使用的术语是命名的大肠bieneusi基因型(1]。

3所示。结果与讨论

PCR分析其基因的识别大肠bieneusi在四个样品(表1)。DNA测序的PCR产品标识的存在三个基因型。两个基因型是已知的,D(在两个隔离)和K(在一个隔离),和一个有两个核苷酸替换比较基因型K(在一个隔离)。在四个大肠bieneusi艾滋病的孩子,三个有腹泻和一个没有腹泻(表1)。

而在这个试点研究,只有少数孩子们发现阳性大肠bieneusi,这种寄生虫的基因型和亚型多样性高,表明有密集microsporidiosis的传播。的来源大肠bieneusi在研究儿童是未知的。然而,该研究发现的基因型D和K之前检测到免疫功能不全的和免疫活性的患者和家畜。(1),这些基因型可能是动物的起源,一个数据隐孢子虫调查在同一组病人8]表明强烈的这两个anthroponotic传播的可能性大肠bieneusi研究区域的基因型。更系统地收集流行病学数据和抽样的动物,饮用水,新鲜农产品需要澄清的来源大肠bieneusi在尼日利亚的孩子。

地理上孤立的大肠bieneusi基因型/亚型可能是流传在尼日利亚的孩子,甚至是其中的一个大肠bieneusi基因型是一种新的基因型。

总之,我们的研究报告高基因型和亚型的多样性大肠bieneusi同时也表明anthroponotic传输可能microsporidiosis流行病学中扮演重要的角色。需要更多的研究在源和传播microsporidiosis在尼日利亚和其他发展中国家。

确认

这项研究得到了约翰·d·格兰特和凯瑟琳·t麦克阿瑟基金会海外培训大学的伊巴丹(尼日利亚)和疾病控制中心和预防,亚特兰大,乔治亚州,美国。作者感谢特里萨Dearen技术援助。这项研究是一项更大的研究与伊巴丹大学的批准/大学学院医院伦理委员会分配数量:UI / EC / 10/0129。研究结果和结论在本文的作者,不一定代表美国疾病控制和预防中心的观点。这项工作进行了分工食源性,水,和环境的疾病,疾病控制和预防中心,亚特兰大,乔治亚州30333,美国。

引用

1. r . j .十抛,l . Van Lieshout m . b . j . Beadsworth et al .,”特征的基因型Enterocytozoon bieneusi在免疫抑制和免疫活性的患者团体。”真核微生物学杂志卷,56号4、388 - 393年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
2. b . Dengjel m .学院赫尔曼斯w . et al .,“人畜共患的潜力Enterocytozoon bieneusi”,临床微生物学杂志,39卷,不。12日,第4499 - 4495页,2001年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
3. i m . Sulaiman r .律师法,a . a . Lal j . m .鳟鱼,f·w·沙福尔l·肖,”小孢子虫目表明野生哺乳动物的分子表征host-adapted港湾Enterocytozoon种虫害以及人类致病Enterocytozoon bieneusi”,应用与环境微生物学,卷69,不。8,4495 - 4501年,2003页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
4. r·t·布莱恩·d·a·施瓦兹,“流行病学microsporidiosis”小孢子虫目和Microsporidiosis,m . Wittner Ed,页502 - 516,ASM出版社,华盛顿特区,1999年美国。视图:谷歌学术搜索
5. 弗尔涅,o . Liguory诉Garrait et al .,“Microsporidiosis由于Enterocytozoon bieneusi感染是旅行者腹泻的一个可能的原因,“欧洲临床微生物学和传染病》杂志上,17卷,不。10日,743 - 744年,1998页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
6. a . Guerard m . Rabodonirina l·柯特et al .,“肠道microsporidiosis发生在两肾移植受者与霉酚酸酯治疗,”移植,卷68,不。5,699 - 707年,1999页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
7. 诉a . Cama j·皮尔森·l·卡布瑞拉et al .,”的传播Enterocytozoon bieneusi孩子和豚鼠。”临床微生物学杂志,45卷,不。8,2708 - 2710年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
8. a . b . Ayinmode b . o . Fagbemi和l·肖”的分子特征隐孢子虫儿童在欧州,尼日利亚:暗示感染源。”寄生虫学研究。在出版社。视图:谷歌学术搜索

版权

版权©2011 Adekunle Bamidele Ayinmode等。这是一个开放的分布式下文章知识共享归属许可,它允许无限制的使用、分配和复制在任何媒介,提供最初的工作是正确引用。