限制分析23 s Microheterogenic核糖体重复检测和描述的大肠杆菌和他们的克隆、致病性和Phylogroups
表3
克隆群体基于有三世(GG / CC)使用23 s P2(候选人)的个人资料内的微生物682年。
虚拟消化模式
类型的有三世限制模式中观察到的399年rrn序列大肠杆菌基因组
F
C
I型
II型
类型III
IV型
1.1
785年
减少网站内rrlH的候选人rrn段
1.2
1042年
1984年
1984年
1984年
1984年
1.3
1116年
x
2163年
X
2163年
1.4
1217年
x
X
2205年
2205年
1.5
1361年
2415年
2415年
2415年
2415年
1.6
1445年
减少网站内的扩增子(682个基点)
1.7
1907年
28
28
28
28
1.8
1984年
x
207年
X
207年
1.9
2161年
x
X
249年
249年
1.10
2205年
459年
459年
459年
459年
1.11
2415年
每组获得了碎片
1.12
2839年
28日英国石油公司(bp)、223个基点和431个基点
28日英国石油公司,179个基点、223个基点和252个基点
28日英国石油公司,210个基点、221个基点和223个基点
28日英国石油公司,42岁英国石油公司,179年英国石油公司、210个基点和223个基点
引物设计与大胆的限制性位点侧翼地区。F:数量的碎片;C:削减网站。 23 s P2682年fp (+): 5′CCGACCTGCACGAATGGCGT3′(20元)。 23 s P2682年rp (+): 5′CAGTTCTCCAGCGCCCACGG3′(20元)。 正向和反向引物23 s P2682年位于第四域和产品化的第5和23 s rRNA二级结构,分别。首先减少站点位于第四域而其余位于域V。