文摘

分析丙型肝炎病毒(HCV)基因型在一个特定的区域传播对公共卫生有至关重要的影响。在这项研究中,我们更新信息在丙肝病毒基因型的分布,通过评价一个医院的2153名慢性丙型肝炎患者,收集前瞻性Catanzaro受试者参加大学医院之一,在意大利南部的一个领域。我们评估了HCV基因型的利率(%)连续两个时期,从2001年到2005年,从2006年到2011年,根据年龄和性别。考虑整体观察时间,1 b亚型主要其次是亚型2 a / c基因型3和4。统计评估年龄分层的丙型肝炎患者的基因型,显示轻微但显著增加1 b,年龄中位数2 c / 2和3丙肝病毒genotype-infected主题,2006 - 2011年期间,而基因型4例表现出减少年龄中位数在同一时期的研究。此外基因型4增加在2002年和2003年之间,以及2010年和2011年之间。由于特有的HCV-4诊断/临床治疗的特性,我们的研究结果值得更深入调查,以更好地控制感染等引起的基因型。

1。介绍

丙型肝炎病毒(HCV)是一种急性和慢性肝病的主要原因。在多达85%的情况下,急性丙肝病毒感染慢性肝炎的进展。感染丙肝病毒是一个重要的健康问题,和其传播反映了社会经济标准和良好的卫生法规(1]。丙肝病毒的分布取决于一个复杂的相互作用的社会风险宿主和病毒的分子特征。丙肝病毒的特点是高度的遗传异质性;事实上,它分为三个层次层基于降低程度不同的核苷酸变异:基因型、亚型、准物种。丙肝病毒基因型分布反映了丙型肝炎的流行病学,并且与特定的传播路线。

亚型1 b是观察世界,而基因型1和3的分布在欧洲和北美国家,基因型2在地中海地区,远东地区和非洲西部。基因型4是在中东和非洲中部,流行基因型5在南非,东南亚6基因型(2),和基因型7在患者被发现从刚果民主共和国3]。在欧洲,最常见的子类型是1后面b亚型2 a / c基因型3。在欧洲国家中,丙肝病毒感染的患病率最高在意大利被发现。这样的流行是介于3和26%,随年龄增加已经观察到,特别是在意大利南部地区(4,5]。我们小组研究HCV基因型分布在意大利南部地区最为严重之前低估(6]。因为结合的几个因素,如改善医疗标准,消除transfusion-associated感染,和增强流行地区的移民,可能丙肝病毒基因型分布的变化在过去的十年里可以想象。因此,本研究的目的是为了更新发现丙型肝炎病毒基因型的分布,通过评价一个医院的2153名慢性丙型肝炎患者,收集前瞻性Catanzaro受试者参加大学医院之一,在意大利南部的一个领域。

2。患者和方法

在2001 - 2011年期间,血清样本2153个连续丙肝病毒RNA阳性患者,Catanzaro参加大学医院的收集。参加本研究的所有病人都出生在意大利和居住在卡拉布里亚。在注册科目1148(53.3%)的男性和1005(46.7%)是女性;的平均年龄是 5 8 。 1 ± 1 5 。 2 (范围5 - 93年)。没有病人治疗前样本集合。在研究期间每每年招生分布如表所示1。每年患者加入这项研究报告作为每年的总表的每一列的底部1。这些病人是新的,从来没有被登记在其他年。此外,两个时期被认为是允许我们更仔细地分析可能的变化的速率不同的HCV基因型,在文献中报道,一些修改(9- - - - - -11]。丙肝病毒感染的危险因素的数据,当可用,包括输血、手术、药物成瘾和零星获得感染。为每个病人一个匿名时间表完成,包括年龄和性别。从注册主题或书面知情同意了,参与者的孩子,家长或监护人。这项研究是通过大学的“大希腊”Catanzaro伦理委员会和机构审查委员会。

表1
丙肝病毒基因型分布在2153年评估病人从2001年到2011年。

的Cobas AmpliPrep / Cobas TaqMan丙肝病毒测试(罗氏诊断、米兰、意大利)已经被用于提取和检测丙肝病毒RNA (7]。搜索病毒RNA之前收集的样本中,2006年4月,在Cobas Amplicor丙肝病毒监控测试,版本2.0(罗氏诊断、米兰、意大利)使用(8]。放大的丙肝病毒基因组5′utr遵循生产商的建议。基因分型的PCR产物直接进行分析线性探针测定(熟练的HCV基因型2.0试验(脂肪酶)西门子医疗诊断公司,塔里敦,纽约,美国原拜耳医疗LLC塔里敦,纽约,美国以前Innogenetics,根特,比利时)基于reverse-hybridization,根据制造商的协议。基因型分类是根据西蒙兹et al。2]。Mann-Whitney测试和 2 分析使用,在适当的地方和使用GraphPad棱镜执行Windows版本4.00 (GraphPad软件、圣地亚哥、钙、美国、http://www.graphpad.com/)。差异被认为是重要的 < 0 。 0 5 。

3所示。结果

丙肝病毒基因型的分布在2153年丙肝病毒新的积极参加Catanzaro大学医院和患者按性别分层表所示2。亚型1 b是最常见(49.2%),其次是亚型2 a / c (22.4%)。没有明显( > 0 。 0 5 通过 2 )性别变异亚型的分布1 b和2 c / 2。基因型3是第三个最常见(7.4%),男性患者中更常见(83.1%比16.9%女性, < 0 。 0 5 通过 2 测试)。基因型4显示率为6.2%,没有明显的男性与女性的区别(58.2%男性和41.8%女性, > 0 。 0 5 通过 2 测试)其次是1亚型和基因型1(4.2%)、亚型1 a / b(3.3%)和基因型2 (3.0%)。三个患者感染丙肝病毒基因型5例(0.1%),没有患者基因型6。

表2
丙肝病毒基因型/亚型分布研究人口( = 2 ,153),按性别分层。

丙肝病毒基因型分布的动力学在11年期间研究报道在图1。病人的总数也增加每每年报告在表1每一列的底部。亚型1 b从2001年开始下降(52.1%)和2002(59.5%)到2011(42.0%)、2009年异常率,而亚型2 a / c没有显著变化随时间(24.3%和24.5%)。基因型3显示在2010年12.3%的峰值。此外,基因型4在2002年和2003年之间增加(分别为4.0%和8.2%, = 0 。 0 3 8 通过 2 测试)以及2010年和2011年(4.2%比10.5%, = 0 。 0 4 1 7 通过 2 测试)。基因型2 (unsubtypeable)基因型1 (unsubtypeable)和亚型1显示光和不规则增加值在11年考虑。为了更好地解决我们的发现,我们比较丙肝病毒基因型的分布,考虑数据在不同年龄组1217例男性/ 545女性(672)2001 - 2005年和936年期间观察到病人(476男性/ 460女性)评估期间2006 - 2011。在两个时期之间,性别分布显示有很大的差距,更多的男性只有在第一个。此外,两个时期被认为是允许我们更准确地分析可能的动态的传播丙肝病毒基因型不同,据其他调查人员9- - - - - -11),分裂成两个或两个以上的时间他们的丙肝病毒的病人。


图1
丙肝病毒基因型的动态分布从2001年1月至2011年12月。的Cobas AmpliPrep / Cobas TaqMan丙肝病毒测试(罗氏诊断、米兰、意大利)已经被用于提取和检测丙肝病毒RNA (7]。搜索病毒RNA之前收集的样本中,2006年4月,在Cobas Amplicor丙肝病毒监控测试,版本2.0(罗氏诊断、米兰、意大利)使用(8]。放大的丙肝病毒基因组5′utr遵循生产商的建议。基因分型的PCR产物直接进行分析线性探针测定(熟练的HCV基因型2.0试验(脂肪酶)西门子医疗诊断公司,塔里敦,纽约,美国原拜耳医疗LLC塔里敦,纽约,美国以前Innogenetics,根特,比利时)基于reverse-hybridization,根据制造商的协议。

两个时期的数据检查时,我们观察到在前四个年龄组(< 25-55)类似的趋势总类中基因型的年龄,而老年患者丙肝病毒率呈现明显变化。特别是,一个更高比例的丙肝病毒感染在> 65年龄段观察(33.7%比41.2%)(表3)。丙肝病毒基因型的分布改变根据年龄在这两个时期。患者感染亚型1 b和2 a / c比那些感染3基因型和亚型1 a和1 b / 1(36-45年龄组)。在2001年至2005年之间,1 b亚型的分布是相似的56 - 65和> 65年龄组,而从2006年到2011年,数据显示增加在> 65年龄段分布对56 - 65岁年龄段。丙肝病毒亚型2 a / c是普遍在65名患者和2006 - 2011年期间观察这个年龄段的进一步增加。基因型的速度3中最常见的类型36-45年龄在26 - 35周不等年龄并没有改变在这两个时间段检查,而25岁以下的受感染的病人的数量在2006年和2011年有所下降。有趣的是基因型4的峰值感染病例中观察到病人56 - 65岁在2001 - 2005年期间分裂成两个不同的山峰在2006 - 2011年期间:27.6%在36-45岁和24.1%(表> 65岁的病人3)。

表3
丙肝病毒基因型/亚型患病率在不同年龄组(年)总共2153丙肝病毒RNA-positive病人,分层在两个时期(2001 - 2005;2006 - 2011)。

统计评估年龄分层的丙型肝炎患者的基因型,显示轻微但显著增加Mann-Whitney测试1 b(年龄中位数 = 0 。 0 0 3 5 ),2 a / c ( = 0 。 0 0 8 3 ),3 ( = 0 。 0 0 0 9 )丙肝病毒genotype-infected受试者在2006 - 2011年期间,而基因型4例表现出减少同期年龄中位数(图进行了研究2)。

(一)
(一)
(b)
(b)
(c)
(c)
(d)
(d)
图2
箱线图的HCV基因型1 b (a),基因型2 a / c (b), 3 (c)基因型和基因型4 (d)分布的患者年龄在2001 - 2005和2006 - 2011年的时间。* = 0 。 0 0 3 5 与2001 - 2005年由Mann-Whitney测试。* * = 0 。 0 0 8 3 与2001 - 2005年由Mann-Whitney测试。* * * = 0 。 0 0 0 9 与2001 - 2005年由Mann-Whitney测试。

4所示。讨论

在目前的研究中,主要的人口特征,以及基因型分布及其动态2153年新丙肝病毒RNA阳性患者生活在卡拉布里亚,意大利南部,在11年期间确定。

丙肝病毒感染的流行在欧洲通常是变化和流行病学等参数患病率和基因型分布在过去十年经历了变化。根除transfusion-associated感染和改善医疗标准影响的一些基因型传播,这是显示一个下降的趋势(12]。另一方面,永久的静脉注射毒品使用者(IDU) [13,14),更广泛的不安全的性实践和移民从流行地区大幅增强9)可能有助于增加不同寻常的流行基因型和/或可能会占一些类型的引入,以前从来没有被观察到。

丙肝病毒基因型的分布确定在本研究几乎是类似于以前观察到(6),1 b亚型的优势,其次是亚型2 a / c和基因型3,但是需要解决的一些有趣的发现。传统上,时至今日,在我们地区b亚型1代表最常见的丙肝病毒类型,发现主要在老年病人(超过65)和相关的风险因素是血液和血液衍生品输血和外科手术。我们的数据显示,其患病率下降在过去的十一年,这一发现,根据欧洲的报道,主要是由于改进卫生标准,减少了传输(15]。

而亚型2 c / 2(第二最常见),以及基因型3没有显著变化随着时间的推移,有趣的是基因型4是迄今为止第四流行基因型在我们的区域。在先前的研究中,HCV基因型4感染的比例,与1517名患者中观察到的时间间隔五年(1997年1月- 2001年2月),表现出大幅增加(6),4.7%报告在2000年1月- 2001年2月期间。

尽管HCV-1b率减少,我们的数据突显出,基因型的进一步提高4 6.2%,在整个研究期间听起来作为流行病学家的挑战,传染病专家,微生物学家。另一方面,增加的速度HCV-4没有连续11年的研究;然而,观察统计上显著的增加从2002年到2003年,以及2010年和2011年期间。

最近的一项研究对3577名患者来自19个不同区域显示,意大利是欧洲的丙肝病毒感染率最高的国家,与1 b亚型为主流,并均匀分布在意大利地区,其次是亚型2 c基因型3和4 (4]。流行的数据和年龄分布表示两个丙肝病毒感染传播模式;第一,相关亚型1 b和2 c,主要发现在超过60岁的成年人,据报道由于过去不安全的医疗行为,而第二个,年轻人的特点,与基因型3和4,由于吸毒和移民(4]。

因为我们的研究是在意大利常驻人口,观察到HCV-4增加可能与通过性传播或静脉暴露。HCV-4报道IDU的感染有关,更频繁的传播模式在西方国家(16];一直相当比例(数据未显示)的HCV-4感染患者IDU科目。

如果我们考虑整体观察时间,数据显示,中年组显示更高的感染基因型4比年轻或年长组,但是当我们考虑我们研究的两个时期,我们注意到,患病率最高的基因型4转向年轻的年龄组(36-45)2006 - 2011。可能这一趋势可能与性风险行为。即使这样的年龄分布的变化可以部分解释为移民,大部分是非法的,来自中东和北非自二十年前导致HCV-4循环的患者在本研究报告。此外,商务或休闲旅行HCV-4流行地区一直在增加在过去的20年里许多人从西方国家(包括意大利和卡拉布里亚)访问北非。

基因型5,主要报道在南非,偶尔出现在不同的欧洲国家在老年患者观察到。感染源是未知的,但肠外医源性传播途径感染了(17]。

最近改变了丙型肝炎病毒感染的流行病学资料在欧洲,以及在意大利被观察到;丙肝病毒基因型的转变似乎主要是由于修改的风险因素和不同基因型对抗病毒药物(18]。观察到的趋势以来第一个流行病学调查,在卡拉布里亚(4]本文中讨论的数据之前,主要显示了HCV基因型的总体发病率增加4。

HCV-4的特殊诊断/临床治疗特点,其显著增加率在2002 - 2003和2010 - 2011年期间和减少HCV-4患者的平均年龄在2006 - 2011年重大关切,值得更深入调查,以更好地控制这样的基因型。