文摘
在以人群为基础的病例对照研究中,我们探索了42七基因多态性之间的关系在这个区域和非小细胞肺癌(NSCLC)风险在高加索(364例;380控制)和非裔美国人(95例;103控制)的女性。两个叔地区snp, rs2075786 rs2853677,授予开发非小细胞肺癌的风险增加,特别是非洲裔美国女性,叔-rs2735940与非洲裔美国人减少患肺癌的风险。5的20GHR多态性和SEPP1略微-rs6413428被关联到一个白种人之间的非小细胞肺癌的风险增加。随机森林分析钢筋的重要性GHR在白种人和确认AMACR,叔,GHR非洲裔美国人,使用基于基因的风险评分也显著。Smoking-SNP相互作用进行了探讨,单叔和GHR与非小细胞肺癌风险被识别。的角色叔,GHR AMACR和SEPP1基因在肺癌致癌作用值得进一步探索。
1。介绍
作为肺癌诊断是第二个最常见的癌症在美国和癌症相关死亡的主要原因,寻找标记与风险是至关重要的早期检测和发现新型chemopreventive代理(1]。王最近发表的研究et al。(2008)和Rafner et al。(2009)表明,这样一个与肺癌相关基因区域风险是染色体的短臂上5附近CLPTM1L并包括SLC6A19,SLC6A18,叔,SLC6A3(2,3]。基因扩增染色体5便士的在这一地区还发现了通过荧光原位杂交研究肺肿瘤与正常肺组织相比从控制4]。
至少有一个在这个区域的基因,端粒酶逆转录酶(叔),一直在探索与肺部肿瘤发生的关系。叔编码端粒酶催化亚基,添加TTAGGG端粒酶复杂重复,确保染色体稳定性,使细胞避免衰老。独立于端粒的延长,叔表达式也一直与动员和表皮干细胞的增殖和对肿瘤发生的易感性增加小鼠模型(5]。大约有80%的肺癌肿瘤细胞中观察到,表达端粒酶通常并不是在体细胞mitotically活动(6]。虽然细胞不灭不授予转换,它可能是肿瘤发生的一个步骤。大约67% -80%的非小细胞肺癌患者表达叔在肿瘤组织中但不相邻,非肿瘤的肺组织(7- - - - - -9),端粒酶活性呈正相关叔表达式[10]。水平的叔表达与淋巴结转移有关但不是年级NSCLC患者(9]。
另一个基因在这个地区,SLC6A3,多巴胺转运蛋白编码基因。可变数目串联重复序列(VNTR)在这个基因与增强多巴胺转运蛋白的转录,负责多巴胺再摄取,cue-induced吸烟欲望较强以及减少戒烟(11,12]。对吸烟的欲望,除了影响多巴胺被报道在肺肿瘤发生中发挥作用是多巴胺受体表达的肺癌肿瘤细胞系(13]。轻微的等位基因的存在SLC6A3SNP rs6413429与肺癌的风险增加有关的研究吸烟挪威血统的白人(或2.46;(95% CI 1.59 - -3.82)14]。这些多巴胺受体基因型和肺癌之间的联系是否吸烟相关行为或影响细胞增殖在NSCLC仍有待确定。
其他基因5号染色体的短臂上,研究了包括与肺癌风险MTRR,GHR,SEPP1。MTRR编码蛋氨酸合成酶还原酶激活蛋氨酸合成酶,和两个研究发现吸烟和之间的交互MTRR基因型与肺癌风险(15,16]。同样,一个吸烟和之间的相互作用产生的GHRSNP,亲495年刺,这可能与肺癌的风险增加有关,有人建议(17,18]。硒蛋白P编码的作用SEPP1指出了减少的表达吗SEPP1在非小细胞肺癌肿瘤组织相对于正常肺组织(19]。虽然这些基因已经被独立研究,很少有研究调查了整个5 p地区与肺癌风险或在非裔美国人的关系。
我们进行了一项以人群为基础的病例对照研究之间的关系描述单核苷酸多态性(snp)在染色体中的基因5 p地区和非小细胞肺癌(NSCLC)的风险在白人和非洲裔美国女性。
2。材料和方法
2.1。研究人群
研究人口和数据收集方法一直在前面描述的(20.]。参与者被确定通过人口大都市底特律癌症监测系统(mdc)的一个成员国家癌症研究所的监测、流行病学、最终结果(SEER)计划。合格病例女性年龄在18到74年诊断为原发性非小细胞肺癌在底特律市区(麦库姆,韦恩和奥克兰县)从11月1日,2001年到10月31日,2005年。而确定最初专注于腺癌病例,2004年11月1日以后研究资格扩大到包括所有的非小细胞肺癌组织学。因为只有面对面进行了采访,女性死者在确定或第一次接触并不合格。五百年,七十七例(55%)的一次采访中完成。的合格的情况下同意参与,459提供了一个血液标本。
以人群为基础的控制被确定通过随机数字拨号和频率匹配情况下关于种族,居住的县,5年年龄段。完成资格筛选问卷的家庭,575年完成的一次采访中,与209名女性拒绝参与。包含在这些分析483名控制提供了血液样本。
2.2。数据收集
所有当地的机构审查委员会批准了这项研究,从每个主题之前获得知情同意参与研究。面对面的采访进行收集统计信息,健康史、家族史、吸烟史、当前身体质量指数(BMI)和药物使用史。病史包括自我报告的医生诊断肺气肿、慢性支气管炎、慢性阻塞性肺病(COPD),报告一年内肺部疾病诊断的肺癌诊断(的情况下)或面试(控制)被排除在外。慢性支气管炎和肺气肿,慢性阻塞性肺病合并创建一个广泛的慢性阻塞性肺病变量。肺癌家族史的编码是或不是基于一级家族史的详细信息。吸烟史包括年龄开始和停止吸烟,吸烟,平均每天要吸几支香烟,香烟,吸烟和多年的中断。烟是女性戒烟两年多前诊断/面试。一生中从未吸烟者吸烟少于100支。药物的历史包括定期使用阿司匹林,定义为每周至少服用一片药三次或者更多在一生中至少一个月。药片使用收集的信息包括年龄的参与者启动和停止药物使用,每周的药片数量,以及是否婴儿/老年人服用阿司匹林(81毫克)或服用(325毫克)。 To avoid protopathic bias, pill use one year prior to diagnosis/interview was excluded.
2.3。样本收集和基因分型
真空采血管的血液标本收集包含EDTA +管,从全血和DNA分离使用试剂盒AutoPure LS基因组DNA净化系统(Gentra系统、明尼阿波利斯、MN)后,制造商的协议。基因组DNA是提交给韦恩州立大学基因组学技术中心申请基因分型。Illumina公司GoldenGate化验使用癌症SNP面板被利用。面板由引物在408年审查1421个snp基因,包括49个snp在八个基因5 p(染色体上AHRR,SLC6A18,叔,SLC6A3,MTRR,AMACR,GHR,SEPP1)选择从美国国家癌症研究所癌症基因组剖析项目SNP500癌症数据库(http://snp500cancer.nci.nih.gov/home_1.cfm)GoldenGate试验运行根据制造商的指示,和数据分析使用珠工作室软件(Illumina公司)。
2.4。统计分析
评估哈迪温伯格平衡,进行了拟合优度检验每个SNP对非裔美国人与白人分开控制。多态性与小等位基因频率(加)不到5%的白人或黑人控制被排除在后续分析。皮尔森的测试是用于分析等位基因频率分布差异的种族之间的控制;P值被纠正为多个业务比较使用Benjamini和错误发现率(罗斯福)方法(21]。
2.5。单核苷酸多态性与非小细胞肺癌的风险
例相比,控制人口因素为分类变量和测试t测试连续变量。无条件多变量逻辑回归模型都是由种族调整吸烟pack-year历史、诊断年龄/采访中,肺癌家族史,慢性阻塞性肺病的历史,成人服用阿司匹林(从未/),多年的教育和BMI。通过计算模型适应性评估竞赛衡量过度拟合(22]。这个模型验证内部使用引导方法获得bias-corrected萨默斯”等级相关的竞赛。杂合子结合变异纯合子在主导模式测试之间的关系存在稀有等位基因和非小细胞肺癌的风险分别的竞赛。的(P根据未经调整值)计算P值的比赛。每个基因的遗传风险评分计算白种人和非裔美国人分别求和的产品t统计(系数除以标准误差)为每个SNP SNP和主要模型的编码(0 =野生型;1 =杂合子和纯合子的变体)。这个分数是包含在一个无条件的逻辑回归模型协变量调整评估统计学意义的基因作为肺癌的危险因素。5 p多态性之间的关联和非小细胞肺癌的风险评估在隐性种族,基因型,和日志加性遗传模型。评估潜在的相互作用5 p地区SNPs和吸烟史,分析分层在吸烟史(从未/过)在白人女性只有因为非裔美国女性的数量太小,这些分析。
作为一种替代方法来评估单核苷酸多态性与非小细胞肺癌风险之间的关系,分析随机森林也是由竞赛(23];(http://stat-www.berkeley.edu/users/breiman/RandomForests/cc_home.htm)。随机森林是一种分类方法,分析包括引导和装袋算法。简单地说,一个随机样本的数据集是用替代,创建一个包组个人进行验证,和变量是随机取样时不重复种植一棵树,以避免过度拟合。最好的变量分类个人基于病例对照状态用于将数据集。一个决策树是生长在这种方式,直到停止规则。这个过程被重复很多次,和重要措施,包括准确性分数下降意味着,生产。与逻辑回归,当应用于SNP协会数据,这种非线性方法考虑相互作用的其他单核苷酸多态性和风险因素的评估一个多态性的重要性。
所有进行了分析使用SAS v9.1.3 (SAS研究所;卡里,NC)除了物流模型和随机森林的内部验证分析,进行了在R v2.8.1。作为一个质量控制方法,数据在BeadStudio reclustered省略个人10%的基因型数据失踪,再分析。
2.6。连锁不平衡分析
叮铃声v1.05(肖恩·珀塞尔,http://pngu.mgh.harvard.edu/purcell/plink)是用于连锁不平衡分析和单体型建设分别由种族之间的控制和分析之间的联系单和肺癌风险调整模型(24]。Haploview v4.1是利用图像LD地图在认定有关联的基因与非小细胞肺癌风险逻辑回归分析和随机森林白种人的欧洲人在犹他州(CEU)和Yoruban(套)的人口。之间的关联叔和GHR单和非小细胞肺癌的风险评估由非条件logistic回归比赛使用哈普罗协变量调整。ccs包R (25]。
2.7。SNP的功能分析
的排序不能容忍宽容(筛选)计划是利用预测之间的关系产生的单核苷酸多态性分析研究和蛋白质功能(26]。筛分0.10被认为是破坏性使用蛋白质中同系物对齐。中值序列信息内容(IC)值3.0提示有减少的序列多样性和产生假阳性错误的几率会更高。
3所示。结果
3.1。单核苷酸多态性
49个snp基因分型的5 p染色体区域,七小等位基因频率5%:SLC6A18 -rs34156553,叔-rs13167280,SLC6A3 -rs6413429,MTRR -rs2287779,MTRR -rs2287780,AMACR -rs6863657,AMACR -rs3195676,留下42单核苷酸多态性进行分析。五个snp包含在分析哈迪温伯格白种人(之间的不平衡叔-rs2853690,GHR -rs2940930,GHR -rs7735889)或非裔美国人(GHR -rs6180,SEPP1 -rs6413428)控制。
3.2。参与者的特征
大约21%的参与者的非裔美国人(表1)。两种族的情况下更有可能比控制报告是吸烟者,有慢性阻塞性肺病的历史,拥有一级肺癌家族史,稍微少了多年的教育,和较低的身体质量指数(BMI)的采访。虽然吸烟pack-year历史病例高于控制这两个种族,白人女性之间的这种差异只是统计上显著。
3.3。5 p染色体snp,非小细胞肺癌的风险
等位基因频率不同白种人和非裔美国人之间的31个42单核苷酸多态性分析(表2),小这些snp等位基因不同15。因此,所有后续比赛分别进行了分析。小的等位基因叔,rs2075786与三倍增加肺癌的风险相关的非裔美国人(或3.04;95%可信区间1.26 - -7.30)但不是白人女性。叔,rs2853677 G等位基因与非小细胞肺癌的风险增加有关白人和非洲裔美国女性。G等位基因的叔-rs2735940与降低肺癌风险的非洲裔美国人(或0.38;95%可信区间0.17 - -0.85)但不是白种人(或0.99;95%可信区间0.66 - -1.49)。六个GHR多态性与非小细胞肺癌的风险增加约50%有关在白种人中,但不是非洲裔美国女性。一个SEPP1SNP, rs6413428,白人女性肺癌的风险增加,但在HWD非裔美国人控制。没有一个单核苷酸多态性AHRR、SLC6A3 MTRR,或AMACR与非小细胞肺癌的风险有关白人或黑人女性SNP分析。(P价值)是由染色体的位置绘制单一的单核苷酸多态性与肺癌风险之间的关联(图中白种人1(一)(图)和非裔美国人1 (b))使用P值调整为多个比较。在whole-gene协会分析,AMACR,GHR,叔明显与非小细胞肺癌的风险在非裔美国妇女即使调整多个比较(P值= .02点。03年,。02年,职责)。之间的关联叔,GHR,SEPP1与肺癌风险调整后找到意义在白种人多个比较(所有三个P值= 0。06)。分析5 p染色体snp和非小细胞肺癌的风险之间的关系由种族隐性,基因型和日志添加剂模型也表明之间的关联SLC6A3 -rs6347和GHR-rs2972395 SNPs和非洲裔美国妇女在非小细胞肺癌的风险减少隐性模型(见补充资料在网上http://dx.doi.org/10.1155/2009/242151)。单核苷酸多态性与肺癌风险之间的关联没有差别,当参与者10%的基因型数据缺失被排除和数据reclustered(数据没有显示)。
(一)
(b)
3.4。随机森林的分析
不足为奇的是,吸烟pack-year历史和肺癌家族史是最重要的变量两个种族(表3)。的重要性GHR多态性在白人女性和叔snp非洲裔美国妇女通过随机钢筋森林分析结果。非洲裔美国人、其他重要的肺癌病例对照状态包括分类器AMACR -rs840409、成人服用阿司匹林和3GHR多态性(rs1858136 rs2972780, rs7712701)。袋的估计误差率分别为24%和28%为白种人和非洲裔美国人,分别。
3.5。5 p染色体snp,吸烟和非小细胞肺癌的风险
多态性之间的关联叔(rs2853677),GHR(rs6897530 rs6873545 rs6179和rs2972780),SEPP1(rs6413428)和肺癌风险观察有史以来白人女性吸烟者但不是从不吸烟者(表中4)。
3.6。5 p染色体snp,肺腺癌的风险
当分析局限于分析对肺腺癌的风险,在逻辑回归分析结果并没有改变方向或大小白种人或非裔美国人。
3.7。连锁不平衡,单和非小细胞肺癌的风险
为叔区域的基因,只有一双snp价值0.30,rs2853677和rs2735940白人控制。没有发现在非裔美国人控制连锁不平衡。叮铃声确定了叔单体型rs2853690-rs2075786-rs2853677-rs2735940。在白种人中,A-G-A-G(或0.59;95%可信区间0.37 - -0.94)和G-G-A-A(或0.41;95%可信区间0.19 - -0.88)单体型与肺癌有关逻辑回归分析;然而,这些协会纠正后未达到统计上的显著水平(每个多重比较P值= 0.14)。
3.8。LD GHR snp模式也不同种族之间的控制
在白人控制,在这个基因单核苷酸多态性比在非洲裔美国人明显更紧密联系的大小价值观和SNP对的数量值0.30。毫不奇怪,一个严格的LD在控制领域包括多态性在该地区,都与非小细胞肺癌的风险在高加索但不是非洲裔美国女性在逻辑回归分析。没有一个GHRrs6873545-rs4451056-rs6878512-rs6897530-rs6179-rs2972780单体型与非小细胞肺癌相关风险白种人或非裔美国人。
3.9。筛选结果
五项产生的单核苷酸多态性在这项研究中,分析了筛分数四(rs10380 -返回MTRRrs34677 -AMACRrs2278008 -AMACR,rs2287939AMACR)。两个多态性,rs10380 rs34677,被认为是导致破坏氨基酸替换根据我们的标准(预测分数(中值序列IC值):0.02(1.85)和0.09(2.02),职责)。
4所示。讨论
叔地区单核苷酸多态性、rs2075786 rs2853677 rs273940,非洲裔美国人与非小细胞肺癌的风险有关,而只有rs2853677 -叔与白种人中肺癌的风险。一个地区的六个GHR多态性在LD白种人在白种人中与肺癌风险但不是非洲裔美国人。随机森林的关联分析钢筋叔和GHR单核苷酸多态性与肺癌的非洲裔美国人,白种人。SEPP1 -rs6413428略在白人女性只有与非小细胞肺癌相关的风险。一个AMACR多态性,rs840409,基于随机森林分析中被确定为非洲裔美国人与肺癌有关。全基因关联分析,叔,GHR,AMACR非洲裔美国妇女与非小细胞肺癌。
4.1。叔
之间的联系叔多态性与肺癌已观察到在高加索人群(至少两个其他的研究2,3]。这两个全基因组关联研究确定rs401681附近CRR9(即,CLPTM1L)与肺癌相关基因作为风险。王et al。(2008)也确定了叔SNP rs4975616 [2]。无论是rs401681还是rs4975616与rs1801075 LD CEU (和0.23,分别地。)或套(和0.06,分别地。)人群,这不是我们的研究与NSCLC的白人或黑人女性。在我们的研究中发现的关联叔本地区的snp进一步上游(数据1(一)和1 (b))。之间的关系叔多态性与疾病易感性之前报道了乳腺癌的家族史的人(27)对特发性肺纤维化(28),这表明这个基因可能感兴趣的肺病和固体肿瘤的发展。此外,整个基因关联分析结果强调任何修改的重要性叔基因尤其是非洲裔美国人。
4.2。GHR
之间的联系GHR最近才和癌症风险的探讨(17,18,29日]。两项研究检查职业之间的关系495年用力推SNP (rs6183)和肺癌的风险在中国和英国高加索人群(17,18]。风险增加观察与鳞状细胞或小细胞肺癌而不是肺腺癌。陆克文et al。18]报道增加肺癌的风险占主导地位的模式下18]。然而,这个轨迹的微小等位基因频率仅为0.001,95%可信区间的上限是无穷,限制相关风险的大小有效的结论。曹et al。17)观察吸烟者肺癌的风险增加和癌症家族史的人(17]。这种多态性在于连锁不平衡CEU人口与单核苷酸多态性与非小细胞肺癌的风险增加约50%在白种人在我们的研究中(例:rs6873545 rs4451056, rs6878512)。结合前两个研究,这些研究结果表明这种疾病标记是在该地区的地方GHR。无论是疾病标记rs6183,筛选对蛋白质功能预测有破坏性的影响,或另一个标记在该地区仍有待确定。进一步的研究在非小细胞肺癌发展GHR的作用是十分必要的。
4.3。SEPP1
SEPP1代码的selonoprotein结合40%到60%的循环血浆硒和功能作为细胞内的运输蛋白和作为主持人绑定的硒元素。硒治疗已被证明是相关的显著减少肺癌的发病率较低的人群中基线硒浓度(HR 0.42;(95% CI 0.18 - -0.96)30.]。rs6413428,苏格兰民族党确认在我们的研究中还没有相关的癌症风险在先前的研究中,SEPP1snp在其他地区的基因与先进的远端结肠直肠癌和前列腺癌(腺瘤风险31日,32]。先前研究SNP是与苏格兰民族党连锁不平衡确定在我们的研究中;因此,rs6413428可能代表一个SEPP1地区独特的肺癌风险的关系。
4.4。AMACR
AMACR编码α-methylacyl-CoA消旋酶(AMACR)中扮演重要角色的支链脂肪酸和胆汁酸的中间代谢。表示在大约14%到56%的肺癌根据肿瘤组织学;然而,没有研究AMACR表达式在肺肿瘤和nontumor组织相比33- - - - - -35]。大量的研究调查AMACR变异和患癌症的风险集中在前列腺癌(36- - - - - -38]。除了两个八个snp包含在这些研究还分析了在我们的研究中,发现一个AMACRSNP rs840409作为非洲裔美国妇女与非小细胞肺癌随机森林分析和全基因关联分析。这个SNP与rs34677强大的连锁不平衡(CEU和套人口和1.00,分别地),已与保护作用与前列腺癌相关nonHispanic白人占主导地位的人口。rs34677编码histadine氨基酸替换的谷氨酰胺,这是不能容忍根据筛选分析(预测得分0.09;中值序列IC (2.02)36]。是否rs840409 rs34677与家族性肺癌,观察到在前列腺癌(38),还有待确定。
4.5。5 p染色体snp,吸烟,和非小细胞肺癌的风险
至少一个研究检验了在染色体snp 5 p基因之间的相互作用和吸烟与肺癌风险(17]。当曹et al。(2008)分析吸烟和之间的相互作用GHR用力推495年箴多态性通过多因素降维(MDR),他们发现鳞状细胞癌之间的关系,但不是adenocarcionma,吸烟者的肺和断定GHR信号与吸烟有关的新陈代谢。而我们的示例包括主要是腺癌(74%),我们仍然观察肺癌和之间的联系GHR多态性只在吸烟者。也确定为有一个微分与非小细胞肺癌风险吸烟史的基础上,SEPP1可能有作用,抗氧化硒的吸收,目前正在测试其有效性在预防肺癌复发通过选择试验(硒和维生素E癌症预防试验)。多态性影响硒GHR活动或增加或减少运输可能提高吸烟者肺癌的组织学的风险。
令人惊讶的是,与吸烟成瘾和相关的基因的影响吸烟与肺癌风险在我们的研究中。多巴胺转运体基因,SLC6A3与吸烟成瘾有关,以前的研究。至少有一项研究由坎et al .(2007)报道,多巴胺转运体基因多态性SLC6A3rs6413429,赋予降低多巴胺生物利用度与非小细胞肺癌发病风险增加甚至在控制了吸烟史表明这个基因在肺癌风险的作用可能涉及其他分子信号机制(14]。在我们的研究中,这个SNP与非小细胞肺癌的风险无关白人女性作为一个整体,白种人从不吸烟者,或白种人曾经吸烟者(数据未显示)。这些协会不分析了非洲裔美国人在我们的研究中,因为小等位基因频率在非裔美国人控制5%。
另一个基因与应对吸烟相关化合物,芳基碳氢化合物受体抑制因子基因(AHRR)不与非小细胞肺癌相关风险在我们的研究中。AHRR函数作为一个肿瘤抑制肺癌细胞系和芳基碳氢化合物的压制活动受体(AHR),一个转录因子调节烟污染物诱导的影响CYP1A1表达式[39,40]。至少有两个以前的研究在日本和法国的人口没有发现之间的关联AHRR多态性与肺癌风险(41,42]。缺乏这些吸烟相关基因单核苷酸多态性与肺癌风险表明修改在多个吸烟和吸烟响应基因,而不是任何单一基因,可能一致的行动来影响肺癌的风险。
4.6。逻辑回归分析和随机森林
逻辑回归分析和随机森林被用于这项研究检查危险因素和疾病之间的联系。而逻辑回归提供了容易解释疾病的概率的估计,单核苷酸多态性在SNP模式被认为是一次。随机森林赞美logistic回归分析评估单个SNP的重要性考虑其他单核苷酸多态性和风险因素。此外,这两种方法的区别在于逻辑回归是线性的,随机森林装袋算法是非线性的。因此,这两种方法可以识别不同的关联。
4.7。限制
因为没有代理进行了采访,女人必须很好地完成一个面对面的面试。稍晚,之前报道,不参加的情况下更容易被诊断出在一个遥远的阶段,和比参与的情况下生存时间短得多20.]。此外,大多数情况下肺腺癌;所以这一研究获得的结果可能不是对所有肺癌可概括的。此外,对于一些单核苷酸多态性,受试者的数量变异纯合子基因型可能是用于测试协会在隐性太少,基因型,或log-additive模型。显性遗传模型的假设在我们分析可能不是最合适的。结果后不再显著P值调整为多个比较,有些可能是假阳性结果。然而,修正了多个测试通过罗斯福的方法,不考虑测试的依赖之间的相同基因的snp根据连锁不平衡,一个重点考虑到连锁不平衡。从不吸烟者的数量发展非小细胞肺癌和非裔美国人包括在这项研究太小COPD吸烟史和历史的分析。从不吸烟者的小数量提出了一个问题:是否5 p地区之间缺乏关联单核苷酸多态性与非小细胞肺癌从不吸烟者是电力不足的结果,特别是对于rs2853677 -叔。此外,所有非裔美国人被合并成一个组无论基因决定的祖先。最后,这些分析需要重复研究中涉及更大的样本量,特别是非洲裔美国人,是否这些发现可以被复制。
5。结论
因为在染色体等位基因频率和连锁不平衡模式5 p基因通过自我报告的种族不同,分析的遗传关联与癌症风险应该考虑比赛。微分之间的联系单核苷酸多态性和单在这个区域和非小细胞肺癌风险的种族还表明,潜在的机制对肺肿瘤发生的易感性可能因种族而异。此外,我们的研究结果表明,潜在chemopreventive目标在高加索吸烟者包括叔,GHR,SEPP1。有必要进行进一步的研究与大量的非裔美国人确定这三个基因之间的关联与肺癌风险也可能是广义非裔美国吸烟者。
确认
作者要感谢以下这个研究项目的贡献者:杰夫•Prysak艾米大厅,吉娜Claeys,阿曼达·阿提斯动物园,凯莉蒙哥马利,伊冯·布什,琳达福布斯,维尔玛白色,和帕特平原的数据和样本收集工作;底特律大都会癌症监测系统的员工;研究参与者。这项研究是由国立卫生研究院资助R01-CA87895和合同N01-PC35145 P30CA22453。
补充材料
补充表1:基因型和日志添加剂分析钢筋之间的关联叔多态性和非小细胞肺癌之间的非洲裔美国女性和风险GHR和SEPP1单核苷酸多态性与肺癌风险在白人女性。