文摘
背景。高级糖化结束产品的受体(蒸机)是一种multiligand受体与多种配体相互作用。以前的研究已经表明蒸机异常表达与免疫浸润和肿瘤发生密切相关。然而,蒸机DNA甲基化在LUAD预后和浸润免疫细胞之间的关系和LUSC尚不清楚。方法。pan-cancer熟化器表达式是通过使用UALCAN数据库。kaplan meier绘图机显示的相关性蒸机信使rna表达水平和临床病理的参数。蛋白表达水平熟化器来自人类的蛋白质图谱数据库分析。体细胞突变,拷贝数和DNA甲基化的蒸机面对UCSC齐娜数据库。计时器平台和TISIDB网站被用来显示之间的关系蒸机表达和肿瘤免疫细胞渗透水平。结果。的表达水平蒸机在肺腺癌显著降低(LUAD)和肺鳞状细胞癌(LUSC)。低表达的蒸机与组织学显著相关,舞台,淋巴结转移,肿瘤蛋白质53 TP53突变和可以作为一个潜在的预后不良的指标LUAD LUSC。此外,蒸机表达呈正相关,浸润免疫细胞。进一步分析表明,拷贝数变异(CNV)的突变,和DNA甲基化参与。差别熟化器对这些此外,我们还发现,hypermethylated蒸机与肿瘤浸润淋巴细胞显著相关。结论。蒸机可能预后的生物标志物的候选人LUAD和LUSC相关肿瘤免疫微环境。
1。介绍
癌症作为一种重大公共卫生问题,全世界发病率和死亡率急剧上升,公共卫生系统放置一个沉重的负担。91年的172个国家,癌症是第一个70岁之前或之后的第二大死亡原因1- - - - - -3]。由于典型的早期临床症状不明显,诊断方法的局限性,绝大多数肺癌患者在后期诊断(4]。在过去的几十年里,由于临床和科研人员的努力,突破了在肺癌的诊断和治疗5,6]。因此,诊断为肺癌患者的5年生存率是不满意的,只有惊人的15%,而先进个人患有疾病的预后是更糟糕的7]。因此,肺癌筛查潜在的基因治疗目标和预后标记尤为重要。
高级糖化终端产品(年龄)是指一组异构大分子是由翻译修饰的蛋白质通过非酶的糖化,脂质,老化,核酸8]。提供细胞内和细胞外的损害之间的桥梁-先进的糖化结束产品的受体(蒸机),也称为晚期糖化的受体终端产品(愤怒)。蒸机蛋白质multiligand受体,与多种配体相互作用,包括年龄、β单纤维,S100蛋白(S100B、S100P S100A4, S100A6、S100A8/9,和S100A11-13),高机动性家族蛋白1,朊病毒(9,10]。蒸机表达在神经退化起着核心作用,视网膜微血管功能障碍,并通过toll样受体胸腺增生4和年龄/蒸机信号通路(10]。然而,熟化器表达式可以诱导在某些病理条件下(包括高葡萄糖、活性氧、缺氧,促炎介质,或蒸机本身)(8,10]。
肿瘤微环境(时间)由复杂的非恶性的细胞环境包括血管血管,成纤维细胞,细胞外基质,和免疫浸润,与肿瘤细胞相互作用并影响肿瘤的生长和转移11]。肿瘤微环境中免疫渗滤过程中扮演着重要的角色,尤其是肿瘤浸润淋巴细胞(12]。以前的研究已经表明蒸机异常表达与免疫炎症反应和肿瘤发生密切相关13]。其他相关研究还表明,蒸机表达和突变发挥重要作用在大脑疾病,食管癌、乳腺癌、胃癌、前列腺癌、黑色素瘤、子宫内膜癌(14- - - - - -24]。一些报道也对熟化器在非小细胞肺癌(NSCLC)。优秀的研究表明,低表达的熟化器显著降低LUAD患者的中位生存时间(25,26]。澄清在NSCLC熟化器之间的作用机理,杨et al。27)验证蒸机的功能调节肿瘤微环境通过mir - 182 - 5 - p / NF -κB轴调节非小细胞肺癌的恶性表型。在肺癌的发生和转移,蒸机发展的重要性已经证明,血管生成和免疫细胞渗透由lysophosphatidic酸(28]。尽管蒸机有众多功能在肿瘤微环境中,无数的机制仍不清楚,特别是DNA甲基化之间的潜在机制和淋巴细胞浸润在LUAD和LUSC。
在我们的工作中,肿瘤免疫评估资源(定时器),基因表达分析交互式分析(GEPIA) UALCAN,用于演示kaplan - meier绘图仪数据库蒸机表达水平及其与预后的相关性。此外,我们使用了定时器网络资源关联的解释蒸机和肿瘤微环境的重要组成部分(肿瘤浸润免疫细胞)。我们还解释了肿瘤浸润免疫细胞和预后之间的相关性。此外,我们进一步的潜在的分子机制进行了探讨蒸机不平衡包括CNV,体细胞突变,DNA甲基化。此外,我们澄清的高度蒸机浸润淋巴细胞DNA甲基化很明显相关。因此,我们提出一个可能的调节机制蒸机DNA甲基化与肿瘤浸润淋巴细胞影响预测LUAD LUSC在某种程度上。
2。材料和方法
2.1。肿瘤免疫评估资源(计时器)数据库分析
计时器数据库是一个功能丰富的资源。定时器算法系统地分析基因表达之间的关系不同的癌症和肿瘤浸润免疫细胞。丰富的六个肿瘤浸润细胞评估(29日]。计时器网站是用来说明微分表达式蒸机在正常和肿瘤组织的多样化的恶性肿瘤。此外,我们分析之间的关系蒸机和6种肿瘤浸润免疫细胞在“基因”模块。我们也用这个网站来研究基因表达水平之间的关系和immune-infiltrating细胞LUAD LUSC。
2.2。基因表达分析交互式分析(GEPIA)
GEPIA是一个新开发的数据库,提供了可定制的功能与RNA序列表达数据形式9736肿瘤和8587正常样本。它是一个有用的网络资源的可视化基因表达基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据(30.]。我们显示的不同表达水平蒸机在正常和肿瘤组织在不同的肿瘤。LUAD LUSC,正常和肿瘤组织的表达水平检测蒸机。此外,生存模块有助于澄清之间的关系蒸机表达式和预后。
2.3。人类蛋白质图谱数据库分析
人类的蛋白质图谱是一个高效、开放数据库,允许免费获取学术研究人员和为探索人类蛋白质组提供了一个参考31日,32]。我们专注于病理学图谱,表明蛋白质含量的影响癌症患者的生存。我们在LUAD筛选蛋白表达,通过免疫组织化学LUSC病理学模块。
2.4。UALCAN数据库分析
UALCAN是一个全功能的、友好的和互动的网络资源,主要用于分析癌症组学数据。通过连接多个数据库、基因的表达分析,蛋白质,和表观遗传学可以很快意识到。这些资源使研究人员能够有效地锁定有趣的目标和有价值的信息33]。我们使用了UALCAN web资源之间的验证结果蒸机和各种临床病理参数包括病理学、癌症阶段、淋巴结的转移状况,和TP53突变状态的肺癌和计算价值。
2.5。kaplan meier绘图仪数据库分析
recurrence-free, kaplan meier绘图仪下载基因表达数据和整体生存地理信息通过链接,TCGA EGA,然后meta-analyzes特定基因的预后价值。其数据库能够评估的影响超过50000个基因(mRNA, microrna和蛋白质)21个癌症的存活率和生物信息学分析是一种常用的工具34]。用于验证kaplan - meier绘图仪web资源之间的相关性不同的临床结果和的表达蒸机在LUAD和LUSC。我们显示的预后分析蒸机表达不同的免疫细胞与此web子集。
2.6。PrognoScan数据库分析
PrognoScan数据库是一个公开的与临床癌症微阵列数据集注释功能,可以作为在线分析工具来评估生物基因表达与预后之间的关系。系统分析可以进行多个数据集。它是一个功能强大的平台来评估潜在的肿瘤标志物和治疗目标。它的存在无疑会促进癌症研究[35]。这个数据库是用来说明异常的影响蒸机表达式在肺癌预后,LUAD, LUSC。
2.7。TISIDB数据库分析
TISIDB是一个开放、自由、和有用的数据库。它集成了数据从多个公共数据库包括UniProt基因本体论(去),DrugBank, TCGA PubMed和。它旨在阐明肿瘤和免疫细胞之间的交互和癌症免疫学研究和治疗是一种宝贵的资源(36]。说明之间的潜在关系蒸机和肿瘤浸润淋巴细胞(尖),28尖被用来分析联系蒸机在不同的肿瘤在TISIDB数据库的网站。此外,我们也证明了蒸机DNA甲基化与肿瘤浸润淋巴细胞之间的相关性通过这个平台。
2.8。UCSC齐娜数据库分析
UCSC齐娜数据库提供了交互式在线种子癌症基因组数据集的可视化,可以支持在线分析各种各样的基因组学,蛋白质组学,表型和临床数据注释。它包括超过50个癌症相关数据,是一个用户友好的数据库37]。在这项研究中,基因表达,拷贝数,体细胞突变,提出了DNA甲基化在这个数据库。详细的调查人群检测蒸机DNA甲基化和甲基化水平也显示出来。
2.9。统计分析
计时器,kaplan meier绘图仪、PrognoScan GEPIA, UALCAN网络资源被用于蒸机验证表达式。生存曲线提出了基于kaplan meier绘图仪和GEPIA使用人事或从生存率较值。SPSS 25.0 (SPSS, Inc .,芝加哥,IL)是用于数据分析。双官能团的比较,学生的t以及使用方法。双尾 被认为是具有统计学意义。
3所示。结果
3.1。蒸机表达水平下调LUAD和LUSC病人
的蒸机表达水平在不同癌症类型阐述了使用计时器web数据库。低表达的蒸机揭示了在乳腺浸润性癌(BRCA),甲状腺癌(THCA),肾脏chromophobe (KICH), LUAD, LUSC比相应的正常组织。相反,在膀胱移行细胞癌(BLCA),胆管癌(胆固醇),食管癌(光电子能谱)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC),肾肾透明细胞癌(KIRC),肾肾乳头状细胞癌(KIRP),肝脏肝细胞癌(LIHC)和胃腺癌(STAD)与对照组相比,蒸机显示一个高表达趋势(图1(一))。在UALCAN数据库中,结果表明,蒸机在正常肺组织的表达水平显著高于LUAD和LUSC(图1 (b))。这个结果表明蒸机可以作为肺癌生物过程的重要组成部分。
(一)
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(c)
(d)
此外,的表达水平蒸机在肺癌样本和邻近组织获得GEPIA在线资源。蒸机表达显著减少LUAD和LUSC(图1 (b))。同样的结果也验证了UALCAN数据库。进一步的研究表明,的表达蒸机在肿瘤组织学、舞台、淋巴结转移和TP53突变在正常组织明显增加,这是低LUAD LUSC肿瘤组织(数字1 (c)和1 (d))。
3.2。蒸机蛋白低表达在LUAD和LUSC组织
蛋白表达水平LUAD LUSC获得和可视化与人类蛋白质图谱数据库。然后我们建立了一个评分系统,高水平的积极熟化器表达式得到3分,中等水平得到2分,低水平获得了1点,没有表达收到0分。结果表明,蒸机表现出温和的阳性表达在所有4正常组织。此外,还有0 0 8和12例高、中、低水平积极的,和未被发现的染色LUAD和0,2、9、9例LUSC(数字2(一个)和2 (b)),分别。观察到在LUAD和LUSC,蒸机的表达明显减少肿瘤组织,如图2 (c)。
(一)
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3.3。的预后价值蒸机验证了基于类型的临床病理的特点
了解更详细地蒸机和预后价值之间的关系,我们之间的关系调查蒸机使用kaplan meier数据库mRNA表达和临床病理的特性。有趣的是,低表达蒸机与贫穷有关总体生存(OS)只有在美国癌症联合委员会(与)阶段T2的肺癌患者(图3)。然后,之间的关系蒸机表达和糟糕的操作系统在与舞台N0人口(图3)。然后,低蒸机表情显然是与贫穷有关操作系统在雄性和雌性(图3)。此外,我们澄清,低表达蒸机代表更糟糕的操作系统在吸烟和不吸烟的患者(图3)。然后,低蒸机表情显然是与贫穷有关操作系统在肺癌患者-外科利润率(图3)。此外,我们注意到,在患者接受化疗或放疗,低水平的蒸机表示更糟糕的操作系统,但没有统计学意义(图3)。这些结果表明,低表达的预后价值的熟化器肺癌是有意义的。
3.4。较低的蒸机表达与肺癌患者的预后不良
我们调查了kaplan meier绘图仪和PrognoScan数据库的预后特征蒸机表达的肺癌。低表达的蒸机基因显示更糟糕的操作系统,无进展生存(PFS),并根据kaplan meier postprogression生存(PPS)数据库(图绘图机4(一)上)。另一边的盾牌,PrognoScan数据库,提出了减少的表达蒸机代表一个贫穷的OS的GSE14814 GSE14814群体和特定疾病生存(DSS)而不是复发存活率(RFS) GSE8894(图4(一)低)。这些结果表明,蒸机与肺癌患者的预后明显相关。然而,在进一步分析中,发现了这两个数据库所得出的结论并不完全一致。PrognoScan数据库中,LUAD和LUSC低表达蒸机与贫穷有关操作系统,PFS和RFS(数据吗4 (b)和4 (c))。然而,上述结论kaplan meier绘图机数据库中没有达到,特别是在LUSC相关预后指标,如操作系统,PFS, PPS(图未能支持相同的结论4 (c))。
(一)
(b)
(c)
3.5。低水平之间的相关性分析蒸机并在LUAD和LUSC浸润免疫细胞
肿瘤浸润免疫细胞可以使用独立预测肿瘤前哨淋巴结转移和预后的状态(38]。我们阐述了之间的关系蒸机表达和6类型的默认数据库中的免疫细胞,包括B细胞、CD4细胞+CD8 T细胞,+T细胞,中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞与计时器数据库。结果表明,蒸机与B细胞的渗透,CD4细胞+CD8 T细胞,+T细胞,中性粒细胞、巨噬细胞和树突细胞。此外,LUAD和LUSC得出了同样的结论(图5(一个))。
(一)
(b)
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我们调查了之间的关系蒸机表达水平和28肿瘤免疫浸润淋巴细胞亚型。这些结果表明,蒸机与21个和20个不同的淋巴细胞亚型LUAD LUSC,分别(图5 (b)和表1)。特别是它显著相关激活B细胞,巨噬细胞、自然杀伤细胞、CD8记忆效应+辅助T细胞,T滤泡细胞,在LUAD和LUSC(图5 (c))。
3.6。预后的价值蒸机表达LUAD和LUSC基于不同的免疫细胞
我们的研究表明蒸机表达式相关的免疫渗透LUAD LUSC。此外,低水平的蒸机与肺癌的预后不良。因此,我们旨在调查蒸机是否会影响预后的LUAD LUSC通过免疫渗透在某种程度上。我们报道了LUAD低蒸机水平丰富B细胞,患者CD4+记忆T细胞、嗜酸性粒细胞、巨噬细胞、间充质干细胞,自然杀伤T细胞,调节性T细胞,1型T辅助细胞预后不良(图6(一))。有趣的是,高蒸机水平LUSC-enriched嗜碱粒细胞、嗜酸性粒细胞、巨噬细胞、类型1 T辅助细胞和2型T辅助细胞群的预后更差(图6 (b))。蒸机的数据表明,不同的表达水平可能影响不同亚型的免疫渗透细胞肺癌,LUAD和LUSC等,最终影响其预后。
(一)
(b)
3.7。CNV、突变和DNA甲基化分析蒸机基因在LUAD和LUSC
我们进一步探讨表达式,CNV,基因突变,DNA甲基化水平的蒸机LUAD和LUSC通过UCSC齐娜数据库。热图分析显示之间的关联蒸机信使rna表达和CNV和基因突变和DNA甲基化在LUAD(图7(一))和LUSC(图7 (b))。同时,热图也表示蒸机DNA甲基化水平在LUAD和LUSC高于正常组织(数字7(一)和7 (b))。
(一)
(b)
3.8。蒸机DNA甲基化显然是与肿瘤免疫浸润淋巴细胞亚型有关
我们已经阐明,蒸机显示高水平的DNA甲基化在LUAD和LUSC。我们利用UCSC齐娜建立蒸机DNA甲基化之间的相关性和immune-infiltrating淋巴细胞。DNA甲基化的信号强度是各种探测器探测到群组,然后表达的形式β价值。任何β0.6或更高的价值被认为是完全甲基化β值为0.2或更低被认为是完全unmethylated。一个β值在0.2和0.6之间是部分甲基化39]。LUAD, 25的探针,观察DNA甲基化在22探针3显示部分DNA甲基化(图8(一个)上)。一致,23个探测器探测到在LUSC显示完整的DNA甲基化,而部分DNA甲基化(图2显示8(一个)低)。TISIDB是用来进一步研究蒸机和肿瘤浸润淋巴细胞之间的关系。这些结果表现出活跃的CD4细胞显著相关,CD8细胞活跃,记忆B细胞、自然杀伤T细胞,和2型辅助T细胞在LUAD和LUSC(图8 (c))。这表明可能蒸机的DNA甲基化与肿瘤浸润淋巴细胞免疫。
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4所示。讨论
近几十年来,肺癌已成为癌症相关死亡的主要原因是全球范围的。肺癌分为非小细胞肺癌和小细胞肺癌病理类型。其中,非小细胞肺癌占肺癌总数的85% (1,3,40]。因此,必须把重点放在改善非小细胞肺癌的诊断和治疗水平。尽管有前景的结果免疫抑制剂治疗肺癌,检查站功效没有匹配预期的结果(41]。因此,有必要探索免疫疗法的机理和确定承诺为肺癌预后的生物标志物。我们的研究建议的表达蒸机在LUAD显著下调,LUSC GEPIA使用生物信息学分析,计时器,和UALCAN数据库(图1(一))。同时,蛋白质含量也进一步证实。一致达成的结论基因水平蒸机有较低的表达式在LUAD和LUSC(数据吗2(一个)和2 (b))。这些结果聚合为有价值的信息,进一步表明蒸机可能肿瘤抑制的作用参与了肺癌的发生。然后,临床预后的意义蒸机患者LUAD LUSC报道。的差别,对这些蒸机明显与肿瘤组织学,舞台,淋巴结转移,TP53突变LUAD LUSC病人(数据吗1 (c)和1 (d))。此外,kaplan meier生存分析显示超表达蒸机是著名的长寿比患者低熟化器表达式(图4)。因此,蒸机有可能作为一种有价值的非小细胞肺癌患者预后的生物标志物。
越来越大量的证据表明,LUAD和LUSC展览可区分的特征在许多方面,包括基因表达谱、生物学行为、分子病理特点、临床特征、治疗反应(42]。与LUAD相比,LUSC通常是与吸烟有关,炎性疾病。一般来说,比同期LUAD LUSC越来越慢,和大规模的体积更小,但大多数病人有早期转移的趋势43]。LUAD之间也有显著差异,LUSC基因突变谱。先前的报道表明,表皮生长因子受体(EGFR)基因的突变是最常见的类型的非小细胞肺癌患者。表皮生长因子受体突变的频率在27%和9% LUAD LUSC,分别为(44]。此外,研究表明,信使rna,也有较大的差异蛋白质表达、信号转导通路,DNA甲基化模式之间LUAD和LUSC45- - - - - -47]。这些发现提供宝贵的经验和研究依据解释LUAD和LUSC的分子机制。同样,在研究,我们也发现,蒸机的差异基因,蛋白质水平和预后LUAD LUSC。在蛋白质表达水平方面,蒸机在LUSC高于LUAD(图2)。这也证明了低表达蒸机更糟糕的预后相关,与先前的研究结果一致。此外,我们只观察到低表达蒸机在LUAD与操作系统有关,而不是LUSC(图3)。这可能是与选择的不同数据集的数据库进行分析。此外,数量有限的样本也可能导致偏见的结果。这也进一步验证了异质性LUAD LUSC。
免疫细胞有不可替代的参与癌症恶化和侵略性48]。它被认为是一个重要的决定因素的预后和免疫治疗的疗效49]。在以前的有意义的研究,免疫组织化学实验表明,表达下调的熟化器可以显著上调血管生成(CD34),白细胞(CD45)和巨噬细胞(F4/80)标记的水平。进一步的研究指出,lysophosphatidic酸(LPA)诱导增殖、迁移,殖民,肿瘤微环境通过愤怒和下游蛋白激酶B (PKB)途径28]。在nontumor研究中,已经证实,蒸机与免疫细胞(50]。价值的研究指出,糖尿病小鼠模型,愤怒参与组织修复相关的炎性损伤。深入的研究表明,愤怒会使pro-repair炎症基因的表达在缺血性肌肉和降低巨噬细胞的数量51]。同样,我们报道了低表达水平的蒸机LUAD和LUSC与B细胞的渗透、CD4细胞+CD8 T细胞,+T细胞,中性粒细胞、巨噬细胞和树突细胞(图5(一个))。此外,我们披露之间的相关分析蒸机和肿瘤浸润淋巴细胞(图285 (b)和表1)。应该强调,明显激活B细胞、巨噬细胞、自然杀伤细胞、CD8记忆效应+辅助T细胞,T滤泡细胞,在LUAD和LUSC(图5 (c))。此外,蒸机有一个部分对LUAD和LUSC患者的生存时间的影响免疫细胞浸润(数字5(一个)和5 (b))。这表明蒸机可能针对几种治疗肺癌的病例。
表观遗传学调控的基因表达中发挥着关键作用[52]。表观遗传调控的基因可以使生物快速适应新环境的变化来获取特征有利于自己。应该注意的是,表观遗传紊乱会引发肿瘤抑制基因的镇压或致癌基因的刺激,最终作为一个因素肿瘤发展和进展。常见的肿瘤的表观遗传现象,DNA甲基化特征可以作为生物标记物对不同癌症的预后和诊断类型和为癌症的治疗提供更优化的策略。它越来越广泛的认可的医疗福利53]。在我们的研究中,我们发现蒸机表达与CNV表现出很强的关联,体细胞突变和DNA甲基化(数字6(一)和6 (b))。此外,我们澄清蒸机有关LUAD和LUSC病人的肿瘤浸润淋巴细胞。此外,我们随后的调查显示明显异常的DNA甲基化状态这两个类型的癌症。这让我们提出一个假说是否有相互监管肿瘤浸润淋巴细胞和DNA甲基化之间的关系。随后的研究表明,高度DNA-methylated蒸机LUAD与活跃的CD4细胞密切相关,活跃CD8细胞,记忆B细胞、自然杀伤T细胞,和2型辅助T细胞。在LUSC也可以观察到类似的现象。然而,肿瘤免疫微环境的潜在机制和熟化器DNA甲基化还需要进一步调查。至于蒸机和肺癌之间的相关性,本研究提供了一个新视野和扩大我们的理解的机制,为肺癌的发展作出贡献。然而,不可否认的是,这项研究也有一些局限性。首先,我们关注LUAD LUSC在非小细胞肺癌,虽然SCLC,肺肉瘤,和其他类型的肿瘤没有涉及。事实上,不同病理类型的肿瘤表现出显著的生物学行为和预后的差异。 Secondly, infiltrating immune cells, a major participant in the tumor microenvironment, have a variety of types and complex mechanisms. Thus, a hierarchical analysis is required to thoroughly explore their functions. Overall, the downregulation of AGER implies the critical role in the occurrence and development of lung cancer.
5。结论
蒸机的基因和蛋白质表达LUAD LUSC表达下调,这显然与预后有关。调整后肿瘤纯度,蒸机与肿瘤浸润淋巴细胞表现出显著相关性。进一步分析表明,蒸机DNA甲基化可能与肿瘤浸润淋巴细胞,尤其是CD4细胞+CD8 T细胞活跃+T细胞记忆B细胞、自然杀伤T细胞,和2型辅助T细胞。因此,我们的研究提供了洞察小说熟化器表达和DNA甲基化在肿瘤免疫中的作用渗透。蒸机可能是一个潜在的预后的生物标志物LUAD和LUSC肿瘤浸润淋巴细胞。应该注意的是,我们认识到以下限制在我们的研究中:我们的研究成果主要是通过生物信息学分析,没有进行任何额外的实验验证。获得的数据来自不同实验室、平台和设备可能会表现出一些差异。许多数据库缺乏一致的标准集成在收集数据并确保数据质量,导致偏见的存在。事实上,数据库采用严格的标准和合理的算法最大化整合相关数据时数据的可用性。此外,我们的研究结果主要是基于生物信息学分析和没有受到额外的实验验证。然而,数据库中的数据也编译和分析基于临床样本的收集和各种临床病理的特点,提供了一定的参考价值。此外,由于影响基因调控和基因相互作用等,有复杂的和复杂的分子和细胞内生物之间的相互作用。 Our results only indicate a correlation between AGER and other clinical pathological features but do not elucidate its regulatory relationship. Further exploration can be conducted through additional experiments to establish specific regulatory mechanisms. We need to recognize the limitations of bioinformatics analysis clearly, which is a prerequisite for improving the efficiency and accuracy of our research.
缩写
| 蒸机: | 高级糖化终端产品的受体 |
| 年龄: | 高级糖化终端产品 |
| 与: | 美国癌症联合委员会 |
| BRCA: | 乳腺浸润性癌 |
| BLCA: | 膀胱移行细胞癌 |
| CNV: | 拷贝数变异 |
| 胆固醇: | 胆管癌 |
| 决策支持系统: | 针对疾病的生存 |
| 光电子能谱: | 食管癌癌 |
| 表皮生长因子受体: | 表皮生长因子受体 |
| GEPIA: | 基因表达分析交互式分析 |
| GTEx: | Genotype-tissue表达式 |
| 走: | 基因本体论 |
| 人力资源: | 风险比 |
| HNSC: | 头颈部鳞状细胞癌 |
| KICH: | 肾脏chromophobe |
| KIRC: | 肾脏肾透明细胞癌 |
| KIRP: | 肾脏肾乳头状细胞癌 |
| LUAD: | 肺腺癌 |
| LUSC: | 肺鳞状细胞癌 |
| LIHC: | 肝脏肝细胞癌 |
| 摘要: | Lysophosphatidic酸 |
| 非小细胞肺癌: | 非小细胞肺癌细胞 |
| 操作系统: | 总体生存 |
| PFS: | 无进展生存 |
| pp: | Postprogression生存 |
| RFS: | 复发存活率 |
| PKB: | 蛋白激酶B |
| 愤怒: | 受体先进的糖化终端产品 |
| STAD: | 胃腺癌 |
| TP53: | 肿瘤蛋白质53 |
| 时差: | 肿瘤微环境 |
| 定时器: | 肿瘤免疫评估资源 |
| THCA: | 甲状腺癌 |
| TCGA: | 癌症基因组图谱 |
| 尖: | 肿瘤浸润淋巴细胞。 |
数据可用性
使用的数据来支持本研究的发现可以从相应的作者。
信息披露
一个预印本曾发表(54]。
的利益冲突
作者宣称没有利益冲突。
作者的贡献
小君杨设计和起草了手稿。张代表孟岩Mingqiang林和等的解释和分析数据。Hancui挚萍Wang Lin,伊琳Yu执行统计分析和收集数据。晓惠陈和吴Yahua进行验证和评审。Qunhao郑,详细介绍姚明,建成李指导研究和编辑的手稿。所有作者的文章和批准最终的手稿。
确认
作者感谢GEPIA、定时器、UALCAN人类蛋白质图谱,kaplan meier绘图仪,TISIDB, UCSC齐娜数据库免费使用。这项研究得到了国家临床重点专科建设项目(批准号2021)和福建省癌症放射治疗和免疫治疗的临床研究中心(批准号2020 y2012)。