遗传学研究

研究文章

Condition-Specific分子网络分析显示,鞭毛蛋白参与的电子转移过程Shewanella piezotoleransWP3

表3

最具代表性的KEGG途径丰富的模块从热休克条件确定。


集群	大小	密度	价值	KEGG通路	成员

1	15	0.67	2.85E−05	丙酮酸代谢	swp_1380、swp_5027 swp_4752、swp_4333 swp_3528, swp_2388, swp_2216, swp_2215, swp_2213, swp_2053, swp_1378, swp_1379, swp_4077, swp_0481 swp_0360
2	12	0.56	1.56E−04	核糖体	swp_2008、swp_2030 swp_4802、swp_3049 swp_2027, swp_2028, swp_2025, swp_2007, swp_0208, swp_1998, swp_0427 swp_1556
3	9	0.64	2.84E−04	肽聚糖生物合成	swp_2592, swp_2234、swp_3922 swp_2293、swp_2225 swp_4399, swp_2229, swp_2228 swp_2224
4	6	1.00	6.31E−04	鞭毛组装	swp_1499、swp_5085 swp_5084、swp_5083 swp_5082 swp_1519
5	7	0.62	7.64E−04	Beta-lactam阻力	swp_1046、swp_4921 swp_4710、swp_2733 swp_1301, swp_1300 swp_2423
6	6	0.73	1.28E−03	Na⁺-translocating NADH-quinone还原酶	swp_1172、swp_2888 swp_2886、swp_2884 swp_1173 swp_2883
7	7	0.62	1.94E−03	Multihaem细胞色素	swp_4806、swp_2182 swp_4116、swp_2918 swp_2183, swp_3403 swp_0613
8	8	0.64	2.70E−03	脂多糖生物合成	swp_3507、swp_3506 swp_0834、swp_3511 swp_3509, swp_3508, swp_3516 swp_3515
9	5	0.70	2.79E−03	- - - - - -	swp_3204、swp_3981 swp_0083、swp_3979 swp_1828
10	4	0.67	1.01E−02	- - - - - -	swp_2103、swp_3188 swp_3190 swp_3192
11	5	0.70	1.71E−02	Glycerophospholipid新陈代谢	swp_0081、swp_5056 swp_4820、swp_4318 swp_0775
12	5	0.60	2.91E−02	细菌分泌系统	swp_0196、swp_0739 swp_0187、swp_0189 swp_0188
13	4	0.67	3.34E−02	- - - - - -	swp_3543、swp_4396 swp_0518 swp_0110

注意:大胆的浓缩条件表明,没有KEGG浓缩和InterPro浓缩或者使用;——表明,浓缩分析没有返回结果。