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黄气,晶晶,回族,李娜,甄杨Mingjun张, ”LncRNA牛磺酸调节基因1的潜在生物标志物Clinicopathology和多种恶性肿瘤的预后:一项荟萃分析”,疾病标记, 卷。2021年, 文章的ID8818363, 14 页面, 2021年。 https://doi.org/10.1155/2021/8818363
LncRNA牛磺酸调节基因1的潜在生物标志物Clinicopathology和多种恶性肿瘤的预后:一项荟萃分析
文摘
背景。lncRNA牛磺酸调节基因1 (TUG1)是最近发现在癌症的潜在生物标志物。然而,它在各种癌症预后的作用是在公布的数据不一致。我们进行荟萃分析,全面确认TUG1在恶性肿瘤的预后效果。方法。我们系统分析了prognostic-predictive TUG1能力通过放大样本大小和癌症类型。占据12.0应用荟萃分析。结果。共有57个合格的研究包括在我们的荟萃分析。TUG1的混合结果表明,超表达是与不利的总生存期(OS)显著相关( , ),短recurrence-free生存(RFS) ( , ),和短风平浪静生存(EFS) ( , )在癌症患者。亚组分析的癌症类型,高架TUG1表达式与贫穷有关胃肠道癌症患者的生存期,泌尿系肿瘤、妇科肿瘤、血液肿瘤、骨肉瘤。然而,高表达的TUG1呼吸道肿瘤显示更好的预后。没有高TUG1表达和操作系统之间的相关性在头颈部肿瘤患者或黑色素瘤。此外,过度TUG1被发现与低级的肿瘤分化,先进的肿瘤阶段,积极的淋巴转移,和积极的远处转移。结论。TUG1高表达与预后不良和先进的临床病理特征,验证TUG1 prognostic-predictive能力的肿瘤,尤其是胃肠道癌症,泌尿系肿瘤、妇科肿瘤、血液肿瘤、骨肉瘤。与此同时,TUG1在呼吸道肿瘤的预后作用可能与其他肿瘤。
1。介绍
长非编码rna (lncRNAs)是一个新兴的一类重要的监管机构参与各种生物功能和疾病过程不同程度(1,2]。下一代测序表明特定lncRNAs突变或表达异常的癌症,和lncRNAs在不同肿瘤的具体作用仍有待注释(3]。
lncRNA牛磺酸调节基因1 (TUG1)据报道,产生致癌癌症或肿瘤抑制功能通过改变癌症相关基因表达在转录水平。根据先前的研究,TUG1被发现调节和致癌的广谱癌症,包括结直肠癌、膀胱癌、食管鳞状细胞癌,骨肉瘤(4- - - - - -7]。同时,在某些类型的乳腺癌、非小细胞肺癌,和神经胶质瘤,TUG1表达在低水平相比,非癌变组织和作为一个肿瘤抑制(8- - - - - -10]。荟萃分析试图证明潜在的诊断或预后TUG1癌症的作用,但结论并不一致(11- - - - - -18]。近年来,研究TUG1表达式已经通过高通量全基因组测序或定量实时聚合酶链反应(存在),我们目前的荟萃分析进行评估的角色TUG1肿瘤肿瘤通过扩大样本的数量和类型。这项研究可能提供额外的证据TUG1预测肿瘤的预后。
2。材料和方法
2.1。文献检索策略
直到2021年1月15日,相关文献的表达lncRNA TUG1癌症是从数据库中提取包括PubMed、Embase,科学和网络,加上三个中文数据库:中国国家知识基础设施(CNKI) Wanfang,维普。关键条款和所有可能的组合如下:“牛磺酸调节基因1或TUG1”和“癌症或肿瘤或肿瘤或癌。所有主要研究的参考列表也检查确定额外的符合条件的研究。
2.2。研究选择
所有合格的文学包含在我们的荟萃分析符合以下标准:(1)的表达lncRNA TUG1测量在人类肿瘤,并对患者进行分组,根据TUG1的表达水平。(2)评估TUG1表达式之间的关系和总生存期(OS),无进展生存(PFS),无病生存期(DFS) recurrent-free生存(RFS),风平浪静的生存(EFS),或clinical-pathological参数如肿瘤分化、肿瘤阶段,和转移。(3)提供了足够的信息来估计风险比(人力资源)或比值比(或)及其95%置信区间(CIs)。
文章被排除在外,如果他们有以下特点:(1)字母,评论,病例报告,和会议摘要没有原始数据;(2)实验室在细胞水平上研究;(3)缺乏可用数据或生存曲线计算小时口服补液盐,独联体或相应的95%,和(4)重复多个出版物与重叠的人口,不包括小样本队列。
2.3。数据提取和评估研究质量
两个调查员(吴晶晶和回族王)独立提取数据和评估研究质量使用一个标准化的形式。任何差异被第三个审稿人仲裁(黄气)。以下特点是检索:第一作者的名字,出版年,患者的国家起源、肿瘤类型、样本大小、数量的病人TUG1水平组,肿瘤阶段,TUG1表达的检测方法,生存数据(直接获得或从kaplan meier存活曲线中提取),clinical-pathological数据,和Newcastle-Ottawa质量评估量表(NOS)得分。
合格的质量评估的研究是按照NOS。我们的质量分数是评价三个部分:选择、可比性,暴露或结果。的平均评分从6.9登记研究,我们研究7分或以上定义为高质量。
2.4。统计分析
所有数据分析使用占据软件版本12.0(美国占据公司,大学城,TX)。我们计算了汇聚小时和95%的CIs包括文章评估TUG1对病人预后的影响和clinical-pathological特征。操作系统、PFS DFS, RFS和EFS都包含在结果分析。小时,相应的95% CIs直接描述在文献中被采用。否则,他们被Engauge数字化仪从kaplan meier曲线中提取4.1版(http://digitizer.sourceforge.net/)。此外,我们计算了口服补液盐和95% CIs探索TUG1表达式和clinical-pathological参数之间的相关性的肿瘤。在我们的分析中,一个 表明高表达的TUG1是癌症的一个不利因素,和一个 暗示一个更糟糕的参数与高架TUG1表达式。Chi-square-based异质性进行了评估统计检验和希金斯 - - - - - -方统计。当 %或 ,这表明,异质性的研究,并应用随机效应模型。当 %或 ,使用固定效应模式。灵敏度分析进行评估的总体结果的鲁棒性。Begg的测试来确定潜在的发表偏倚,进行 表明一个明确的发表偏倚。值小于0.05被认为是具有统计学意义。
3所示。结果
3.1。研究特点
根据战略图中描述1,共有57个合格的研究涉及8753名患者包括评估协会TUG1与生存和临床病理的特点4,6,9,10,19- - - - - -71年]。其中,周et al。40)包含8个合格军团与不同类型的肿瘤,和Gradia et al。62年]分析了两种亚型乳腺癌。这些学生分别进行了分析。的详细特征包括研究总结在表1,这表明我们包括8753例,从2014年到2021年研究报告发表。57中研究(65组),48个军团进行了在中国,12组数据提取癌症基因组图谱(TCGA),其余三组进行在埃及,德国和捷克共和国。37的包括军团了不到100名患者和24军团招募了超过100名患者。整合癌症类型包括胶质母细胞瘤(GBM) (10,42,63年),鼻咽癌(NPC) [49)、口腔鳞状细胞癌(OSCC) [58),食管鳞状细胞癌(ESCC) [6,21,29日,67年],乳腺癌(BC) [28,40,62年],小细胞肺癌(SCLC) [53),非小细胞肺癌(NSCLC) (9,19,25,69年),肝细胞癌(HCC) (40),胃癌(GC) (23,24,40,41,65年,66年),胆管癌(CCA) [60,61年],胰脏癌(PC) [35,50,57],结直肠癌(CRC) [4,39,40,46,51,52),肾细胞癌(RCC) [54),移行细胞癌(加州大学)56),膀胱癌(基线轮廓)31日,36,40,68年,70年],前列腺癌(PCa) [22,26,37,38),宫颈癌(CC) [27,59),子宫内膜癌(EC) (32),卵巢癌(OC) [20.,30.,44),骨肉瘤(OSA) [40,45,55,71年),急性髓系白血病(AML) (33,43,47,48),非霍奇金淋巴瘤(NHL) [64年),和黑素瘤34,40]。RNA序列中存在方法被用来确定TUG1表达水平,作为截止值和中间值应用在大多数的研究。预后分析61军团评估TUG1预后影响的操作系统,和12组报道的影响TUG1 RFS, DFS, RFS和EFS。
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缩写:AML:急性髓系白血病;公元前:乳腺癌;基线轮廓:膀胱癌;答:子宫颈癌;CCA:胆管癌;CRC:结直肠癌;电子商务:子宫内膜癌;ESCC:食管鳞状细胞癌;“绿带运动”:胶质母细胞瘤;GC:胃癌; HCC: hepatocellular carcinoma; NHL: non-Hodgkin’s lymphoma; NPC: nasopharyngeal carcinoma; NSCLC: non-small-cell lung cancer; OC: ovarian cancer; OSA: osteosarcoma; OSCC: oral squamous cell carcinoma; PC: pancreatic carcinoma; PCa: prostate cancer; RCC: renal cell carcinoma; SCLC: small cell lung cancer; UC: urothelial carcinoma. |
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3.2。TUG1表达的相关性与生存
共有8405名患者为评估TUG1水平和操作系统之间的关系。采用随机效应模型由于明显的异质性( %, )。之间的显著相关性被发现高TUG1表达式和不利的操作系统,和集中人力资源为1.70(95%置信区间:1.48—-1.95, )(图2)。12组包括调查TUG1表达式之间的关系和PFS, DFS, RFS和EFS。结果表明,与PFS TUG1表达没有明显相关( )或DFS ( ),但趋势恶化RFS ( )或EFS ( )揭示了高水平的患者TUG1表达式,虽然包括研究的数量非常小(图3)。
3.3。子群分析高TUG1表达和操作系统之间的相关性癌症
为了解决操作系统数据集之间的异质性,我们进行了亚组分析根据病人的起源、癌症类型、样本大小和检测方法(表2)。结果显示显著高表达的TUG1之间的联系和来自中国的病人不宜操作系统( ,95%置信区间:1.59—-2.30, )和病人不是来自中国 ,95%置信区间:1.05—-1.54, )。同样,TUG1过度预测更糟的结果无论在子群包含病人超过100 ( ,95%置信区间:1.08—-1.60, )和子群不到100例( ,95%置信区间:1.72—-2.63, )。当分组根据TUG1检测方法,存在子群的集中小时和RNA序列群分别为1.88(95%置信区间:1.57—-2.25, )和1.29(95%置信区间:1.07—-1.57 ),分别。当按癌症类型,TUG1表达显著预测不利OS在胃肠道癌症( ,95%置信区间:1.69—-2.67, ),泌尿系统肿瘤( ,95%置信区间:1.27—-2.79, ),妇科肿瘤( ,95%置信区间:1.40—-2.89, ),血液肿瘤( ,95%置信区间:1.87—-3.18, ),和骨肉瘤( ,95%置信区间:1.16—-2.14, )。与此同时,高TUG1水平预测有利OS在呼吸道肿瘤( ,95%置信区间:0.36—-0.70, )。TUG1表达没有明显预后价值在头颈部肿瘤和黑色素瘤(数字4(一)- - - - - -4 (c))。不过,进一步分层分析表明,升高TUG1表现出良好的非小细胞肺癌的预后价值( ,95%置信区间:0.35—-0.58, )碾压混凝土和不利预后价值( ,95%置信区间:1.00—-2.61, )。然而,合并后的人力资源表示没有显著关系TUG1基线轮廓表达和操作系统( )和“绿带运动”( )(图4 (d))。显著的异质性存在的所有子组除了血液肿瘤组(表2)。
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(一)
(b)
(c)
(d)
3.4。高TUG1表情临床病理参数的影响
进行了临床病理的分析根据常见的参数,如患者的年龄、性别、肿瘤分级、肿瘤,淋巴结转移和远处转移。收集1332例十五军团评估TUG1表达与肿瘤分化之间的关系。之间的重要连接被发现高TUG1表达式和低分化肿瘤癌症病人,和池或为1.99(95%置信区间:1.10—-3.60, )用统计学异质性( %, )。二十军团有1828患者显示之间的关联TUG1过度和tumoral TNM阶段。池或为2.82(95%置信区间:1.84—-4.33, )显著的异质性( %, ),证明患者上调TUG1表达式更容易患高肿瘤阶段。随后,我们调查的预后价值TUG1淋巴结转移和远处转移。结果表明,评估患者TUG1表达进步淋巴结转移和远处转移通过比较淋巴结转移的发生率( ,95%置信区间:2.23—-3.92, )和远处转移( ,95%置信区间:1.97—-6.41, )高和低TUG1表达式组之间。然而,没有发现年龄或性别显著相关,和合用口服补液盐如表所示3。
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3.5。敏感性分析
灵敏度分析进行评估的总体结果的鲁棒性。池的小时后被重新计算扣除每个队列先后,结果表明高TUG1表情的人力资源操作系统范围从1.67(95%置信区间:1.47—-1.91)1.75(95%置信区间:1.53—-2.01)(图5(一个))和人力资源的高TUG1表情PFS / DFS / RFS / EFS范围从1.51(95%置信区间:1.06—-2.16),1.77(95%可信区间:1.31 - -2.38)(图5 (b)),这表明一个积极联系高TUG1水平和癌症患者的预后存在不管研究是移除。
(一)
(b)
3.6。发表偏倚
发表偏倚的可能性被漏斗情节和贝格的测试评估。漏斗图的形状对操作系统或PFS / DFS / RFS / EFS不对称(图6),但是Begg的价值的测试操作系统( )和DFS / RFS / EFS ( )表示,没有严重的发表偏倚在我们目前的荟萃分析。
(一)
(b)
4所示。讨论
lncRNAs参与调节tumoral生物过程的竞争力与某些小分子核糖核酸,交互改变关键蛋白质的表达基因调控系统(72年,73年]。迄今为止,许多研究证实,突变或misregulation lncRNAs可能促进肿瘤发生和转移,表明他们是小说对癌症生物标志物和治疗目标(3,74年,75年]。
7.1 kb lncRNA TUG1,第一次被确定为一个转录调节响应牛磺酸治疗,影响小鼠视网膜发展(76年]。越来越多的研究表明,TUG1肿瘤有关。在大多数恶性肿瘤,TUG1已经报道过表达,参与调节肿瘤恶化的多个进程,入侵和血管生成77年]。已经证实了免疫沉淀反应,TUG1可能招募和绑定到polycomb压制复杂2 (PRC2)来调节基因的表达参与肿瘤发生和肿瘤发展78年,79年]。此外,TUG1还可以发挥其致癌作用通过骗取tumoral抑制小分子核糖核酸或调制癌症相关像Wnt信号通路,MAPK或Notch1 [80年- - - - - -82年]。然而,TUG1被发现表达下调和作为一个肿瘤抑制基因在某些类型的乳腺癌、非小细胞肺癌、神经胶质瘤(8- - - - - -10]。例如,TUG1可以促进肿瘤细胞凋亡,抑制神经胶质瘤的生长通过激活半胱天冬酶3 -和半胱天冬酶9-mediated proapoptosis,抑制bcl - 2介导antiapoptosis [10,83年]。因此,prognostic-predictive TUG1价值在癌症仍然是不确定的,需要进一步评估。TUG1的表达水平与患者的肿瘤和TUG1的相关性生存和临床病理的特点之前评估。在这项研究中,我们收集特定数据TUG1参与肿瘤进展和不同类型的肿瘤患者的生存,我们分析和总结TUG1是否适合作为这些肿瘤的预后指标。
尽管多个荟萃分析表明,TUG1可以用作肿瘤预后标志,大多数研究进行了2017年之前(12- - - - - -18]。TUG1的预后价值在某些特定类型的肿瘤仍然是有争议的,及其临床应用相对有限。随着tumoral基因组测序技术的发展,越来越多的数据TUG1已经发表在过去的几年里。在这项研究中,总共有57个文章(65组)的角色包括全面分析TUG1在22个类型的肿瘤来自身体,结果提供更多信息TUG1作为肿瘤预后的生物标志物在临床预后风险分析应用。此外,几乎所有的整合研究数据来自中国在前面的分析。TCGA我们的研究包括多个军团增加样本容量和数据的多样性,使研究结果更令人信服。
在我们的研究中,结果表明,高TUG1表达式是糟糕的操作系统在恶性肿瘤患者显著相关,这与先前的研究得出的结论是一致的(13,14,16- - - - - -18]。此外,TUG1表达之间的相关性和PFS / DFS / RFS / EFS首次对肿瘤患者进行了分析。无显著关联TUG1表达式和PFS / DFS被发现。与此同时,由于只有一个包括RFS和两篇文章报道EFS报导,TUG1 PFS / EFS的预后价值是不确定的,即使我们观察到的一个重要生存分析价值。
亚组分析中,我们发现TUG1与贫穷有关操作系统的高表达患者的胃肠道癌症(ESCC、GC、CRC、PC、肝癌和CCA),妇科肿瘤(公元前OC、CC和EC),血液肿瘤(AML和NHL),泌尿系统肿瘤(RCC,基线轮廓、加州大学和PCa),和阻塞性睡眠呼吸暂停综合症。这个结果没有在之前的报道分析,这可能是由于有限数量的合格的研究对于每个肿瘤类型。在泌尿系肿瘤中,只有一个在加州大学的研究表明,高表达的TUG1更好的预后显著相关( ,95%置信区间:0.39—-0.97, )。基线轮廓包括五名符合条件的研究。一项研究招收406名患者从TCGA数据库建议患者的高表达TUG1往往有更好的预后,但没有发现统计学差异(40]。另一个4研究包括256名膀胱癌患者,3研究来自中国和1来自捷克共和国,结果表明患者TUG1表达较低存活率更高。虽然泌尿系统肿瘤的整体分析证实,高表达的TUG1为患者预后价值,它仍然需要扩大样本量来评估是否TUG1在加州大学过程中发挥作用,可以区别于其他泌尿系肿瘤,并在基线轮廓TUG1的预后价值还需要进一步验证。在呼吸道肿瘤4非小细胞肺癌的研究表明患者调节TUG1水平有更好的预后( ,95%置信区间:0.27—-0.80, ),与其他类型的肿瘤。虽然只有一个SCLC的文章显示,患者调节TUG1表达往往预后差,没有发现统计学意义。的差异TUG1 NSCLS和SCLC的角色必须澄清通过扩大包括研究在未来,和特定的肺组织病理类型可能确定的TUG1肺癌预后的作用。在头部和颈部肿瘤和恶性黑色素瘤,TUG1没有明显的表达与肿瘤患者的生存。头部和颈部肿瘤分析包括3 GBM 1人大,1 OSCC的研究。3“绿带运动”的文章,2是来自中国,这表明患者高TUG1水平有更好的预后。TCGA数据分析是与前面的两个研究,表明患者低TUG1表达式更长的存活时间。两个黑色素瘤研究显示一个调节TUG1和不良预后之间的联系,没有统计学意义。所有这些肿瘤需要进一步研究阐明TUG1是否具有预后价值。亚组分析基于病人的起源、样本大小和TUG1检测方法建议的预后价值TUG1并不受这些因素的影响。
此外,我们分析了TUG1相关临床病理参数。不同于之前的分析,TUG1的高表达与肿瘤TNM分期呈正相关,肿瘤分化、淋巴结转移和远处转移,这进一步证实了有意义的预后TUG1在各种肿瘤的价值。
有一些限制在当前的研究中,进行解释时应特别谨慎。首先,生存分析数据没有直接提供一些研究和需要提取kaplan meier曲线。然而,一些相对困难的kaplan - meier曲线提取由于低像素计数[69]或大样本大小(40,63年),获得的数据可能包含错误。例如,值显示在周et al。的工作建议TUG1之间没有发现统计学差异表达与胃癌患者的生存或乳腺癌,而统计的差异出现在这两个肿瘤通过重复提取和计算(40]。因此,我们利用实际提取获得的数据统计分析。第二,TUG1的预后作用在头颈部肿瘤和恶性黑色素瘤尚未得到证实。这可能是由于研究样本的局限性,以及未来需要更多的样本分析。第三,有统计学异质性的研究包括在这项研究中。这可能是由于不同的肿瘤类型,数量的情况下,病人来源、检测方法和TUG1的截止值。值得注意的是,TUG1截止值和单位的差异可能会影响应用程序的TUG1诊所。
5。结论
尽管上述局限性,我们荟萃分析还表明,升高TUG1有利预后显著相关的呼吸系统肿瘤和不良预后的胃肠道癌症,妇科肿瘤、血液肿瘤、泌尿系统肿瘤、骨肉瘤。没有明确的结论达到对头部和颈部肿瘤和恶性黑色素瘤,并与一个更大的样本量进一步分析是必要的。此外,TUG1明显的高表达与肿瘤晚期阶段,分化差,更多的淋巴结转移和远处转移的肿瘤。
数据可用性
所有生成的数据或分析在本研究中包括这篇文章。
的利益冲突
所有作者声明不存在利益冲突。
作者的贡献
气黄了文献研究、数据分析和手稿准备。晶晶做了文献研究,数据分析,和手稿准备。回族王做了数据提取。李娜的手稿编辑。甄杨做了手稿编辑。Mingjun张做了研究设计。黄气和吴晶晶了同样的工作。
确认
这项研究是由来自中国安徽省自然科学基金资助(1908085 mh262号、2008085 qh379和2008085 qh413)和孵化项目的国家自然科学基金从安徽医科大学第二医院(gqfy09 2019号、2019号gqfy12)。
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