). The frequency of the rs312457 risk allele (G) was 4.8%, higher than that of the wild-type allele (A) in patients of type 2 diabetes, indicating that allele (G)’s presence seemed to make the risk of type 2 diabetes go up. Compared to the GA and AA genotypes, the GG genotype of rs312457 significantly increased the risk of contracting diabetes mellitus (). Moreover, the rs312457 genotype was associated with HOMA-%B. Subjects harbored the GG genotype of rs312457, whose HOMA-%B level went down in comparison with that in subjects harboring the AA genotype (). Conclusion. Our results revealed that the rs312457 genotype of the SLC16a13 gene was correlated with the development of diabetes mellitus in the Chinese population."> 之间的关联rs312457 SLC16a13基因的基因型和糖尿病在中国人口 - raybet雷竞app,雷竞技官网下载,雷电竞下载苹果

计算和数学方法在医学

PDF
计算和数学方法在医学/2021年/文章
特殊的问题

机器学习和网络生物学和医学的方法2021

把这个特殊的问题

研究文章|开放获取

体积 2021年 |文章的ID 9918055 | https://doi.org/10.1155/2021/9918055

她Pu,回族郑余张,Yujuan粉丝,佳林杨, 之间的关联rs312457 SLC16a13基因的基因型和糖尿病在中国人口”,计算和数学方法在医学, 卷。2021年, 文章的ID9918055, 5 页面, 2021年 https://doi.org/10.1155/2021/9918055

之间的关联rs312457 SLC16a13基因的基因型和糖尿病在中国人口

学术编辑器:Lei陈
收到了 2021年3月22日
接受 02年6月2021年
发表 2021年6月28日

文摘

客观的。SLC16a基因编码H +耦合monocarboxylate转运蛋白(mct)。mct参与维护间隙液的pH值和调节胰岛素受体的亲和力,这是一个潜在的糖尿病的发病机制。在这个研究中,我们探索的之间的关联rs312457 SLC16a13基因的基因型和糖尿病在中国人口。方法。它包括384名2型糖尿病患者和1468名健康对照组。我们测量了人体测量参数,血糖指数,assessment-B细胞内稳态模型(HOMA - % B),血脂和内稳态模型assessment-insulin阻力(HOMA-IR)。rs312457基因型和2型糖尿病之间的关联进行了分析。结果。rs312457基因型是明显与2型糖尿病( )。rs312457风险等位基因的频率(G)为4.8%,高于野生型等位基因(A)在2型糖尿病患者,表明等位基因(G)的存在似乎使2型糖尿病的风险上升。GA和AA基因型相比,GG基因型的rs312457显著增加感染风险的糖尿病( )。此外,rs312457基因型与HOMA - % B。学科存在的GG基因型rs312457的HOMA - % B水平下降相比,在受试者窝藏AA基因型( )。结论。我们的结果显示rs312457 SLC16a13基因的基因型与糖尿病在中国人口的发展。

1。介绍

作为一个复杂的代谢性疾病,糖尿病血糖升高的一个特征是由于胰岛素分泌和/或缺乏。长期血糖控制不佳的糖尿病患者可伴有各种并发症和器官功能障碍或衰竭,特别是眼睛,心脏,血管,肾脏和神经系统。糖尿病已逐渐成为全球关注的公共卫生,和中国在全球糖尿病患者的数量居第一位。2013年,据报道,宁等。1),至于中国成年人,糖尿病的整体发病率约为11.6%,利率为12.1%,男性为11%,女性。最近,糖尿病的发病率约为8.1%。糖尿病是一种严重的健康问题,在中国一个沉重的负担。

迫切需要策略来预防和治疗糖尿病的控制疾病的传播。2型糖尿病(T2D)的结果β细胞功能障碍和/或胰岛素抵抗,这是方便多因子的遗传因素(2]。在研究糖尿病的遗传机制,候选基因的方法,联系分析,全基因组关联研究(GWAS),和大规模的关联研究已经认识到许多位点有助于T2D易感性(3- - - - - -6]。基因多态性的研究变得越来越受欢迎,这有助于发现新的基因与2型糖尿病易感性(7]。相关报告显示,rs4430796 HNF1的单核苷酸多态性(SNP)β基因与2型糖尿病在老年人中(8]。在妊娠期糖尿病,年级B和D之间的显著差异被发现糖尿病的CC和TC基因型rs2975760和年级B和D TT基因型的糖尿病。与GG基因型相比,B和D AA和AG基因型的糖尿病rs3792267明显不同,和等位基因比等位基因g . 2014年,显著增加Hara等人发现了三个小说T2D的位点,其中一个是SLC16a13 rs312457位点的基因(9]。SLC16a基因编码H +耦合元羧酸酸转运蛋白(mct) [10]。mct参与维护间质液的pH值、调节胰岛素与其受体的亲和力11),这是一个潜在的糖尿病的发病机制。然而,SLC16a13 rs312457位点的基因的作用在糖尿病的发病机理尚未报道。确定SLC16a13与T2D相关联的基因变异在中国患者中,我们也选择rs312457作为一个单核苷酸多态性(SNP)标签SLC16a13基因和分析其T2D的关系。

2。方法和材料

2.1。研究对象

1852例,包括384年共有1468名非糖尿病的控制和患者T2D,是从闵行招募医院、上海复旦大学。入选标准是用于控制如下:(1)空腹血浆 更易与L和(2)餐后血浆 更易与L。自1999年以来,2型糖尿病诊断了世界卫生组织(世卫组织)有以下特点: 更易与餐后血浆L和/或2小时 更易与L。在这组、糖尿病诊断不超过6个月前,和受试者没有接受胰岛素治疗。所有的参与者都是中国人汉族个人住在上海。复旦大学闵行医院的伦理委员会批准了这项研究,实现符合伦理准则。我们获得了书面知情同意接受采访和每个参与者的血液样本捐赠。

2.2。人体测量和临床测量

我们收集anthropometrical测量体重、血压、身高、腰臀比(WHR)。我们计算BMI体重(公斤)除以身高(米2)。我们收集血浆样品后迅速一整夜。我们测量了台塑,低密度脂蛋白胆固醇(低密度脂蛋白),高密度脂蛋白胆固醇(hdl - c)、总胆固醇(TC)和甘油三酯(TG)水平利用标准化的酶促过程(日立7600 - 110自动生化分析仪;日立有限公司、日本东京)。我们发现C肽和血浆胰岛素(INS)利用放射免疫检定法。糖化血红蛋白(HbA1C)检测利用hlc - 723的七国集团(g7) TOSOH分析仪(日本东京TOSOH有限公司)。

2.3。单核苷酸多态性(SNP)的选择和基因分型

从日本rs312457选择是基于先前的报道。检测rs312457是由上海OEbiotech公司使用Sequenom MassARRAY SNP技术(12]。基因分型的成功率是99.74%。基因型的频率符合哈迪温伯格平衡(HWE) ( )。

2.4。脱氧核糖核酸提取

从全血中提取基因组DNA进行了分析,利用1%的琼脂糖凝胶电泳,随后,我们估计浓度和DNA降解程度。我们应用质量检验针对获得DNA A260 / A280比率(OD)是在1.8至2.0的范围,与DNA的浓度超过50 ng /μL和质量好的凝胶电泳带。DNA然后转移到96孔板和储存在-20°C进行进一步分析。

2.5。统计分析

1.9叮铃声被用来探索rs312457和T2D之间的关系。结果表达的形式 (SD)或作为一个比例。比较T2D的等位基因和基因型分布和控制进行使用 测试。我们比较不同基因型之间的定量特征利用方差分析(方差分析)。分析了对照组的HWE叮铃声1.9。我们利用Quanto v1.2.4权力执行计算。我们执行的其他统计分析利用SPSS(19.0版本;SPSS研究所Inc .)。我们认为是 值小于0.05重大从统计的角度。

3所示。结果

3.1。研究人口的特点

我们展示了人体测量和生化特性的研究对象表1。SNP基因分型(RBMS1-RS 7593730和BCAR1-RS 7593730)是在970年991名2型糖尿病患者和非糖尿病患者控制执行,及其与2型糖尿病的相关性进行了分析。性别分布( )和低密度分布( )例和对照组之间在统计学上没有不同。两组对糖化血红蛋白明显不同,光纤光栅,HOMA - % B, HOMA-IR值( )。在其他特征组没有明显差异。


控制 2型糖尿病

年龄(年) 0.397
性别(男/女) 824/644 219/165 0.751
BMI(公斤/米2) 0.109
WHR 0.060
收缩压(毫米汞柱) 0.493
舒张压(毫米汞柱) 0.871
光纤光栅(更易/ L) 0.001
糖化血红蛋白(%) 0.001
TC(更易/ L) 0.086
TG(更易/ L) 0.495
HLD-C(更易/ L) 0.670
低密度(更易/ L) 0.228
HOMA - % B 0.001
HOMA-IR 0.001

给出的数据 或比率。 值< 0.05。
3.2。rs312457的特点

我们提出rs312457的特点(包括它的基因型频率、位置和次要的等位基因频率,并于表2。rs312457是位于chr17: 7037074,内含子SLC16A13变体。rs312457的等位基因G / A。与对照组相比,T2D的乘加组显著增加。所有的基因型分布在符合HWE。


单核苷酸多态性 染色体 位置 等位基因(风险/其他)
控制 2型糖尿病

rs312457 17岁:7037074 基因内区 G / 0.12 0.17 0.002

值< 0.05。
3.3。rs312457等位基因频率和基因型分布

我们提出的rs312457等位基因频率表3。rs312457风险等位基因携带者的(G)的风险增加了4.8% T2D相比与运营商的野生型等位基因(a) ( ,或1.25,95% CI 1.06 - -1.48);因此,G等位基因的存在似乎让T2D的风险上升。基因型分布见表4。rs312457的GG基因型与糖尿病风险增加( )。


单核苷酸多态性 控制(%) 2型糖尿病(%) 价值 或(95%置信区间)
G 一个 G 一个

rs312457 343 (12.3) 2457 (87.8) 131 (17.1) 637 (82.9) 0.001 1.25 (1.06 - -1.48)

值< 0.05。

单核苷酸多态性 控制(%) 2型糖尿病(%)
GG 遗传算法 AA GG 遗传算法 AA

rs312457 16 (9.8) 99 (43.4) 269 (46.8) 16 (23.1) 311 (27.1) 1073 (49.8) 0.001

值< 0.05。
3.4。rs312457和定量特征之间的关系

HOMA - % B的受试者携带GG基因型相比明显跌落的主题与AA基因型( ),和GG运营商增加糖化血红蛋白水平( )。没有一个多态性与体重指数表现出显著的相关性,WHR、糖尿病患者血脂水平(表5)。


rs312457
GG 遗传算法 AA

BMI(公斤/米2) 0.507 0.603
WHR 1.658 0.192
糖化血红蛋白(%) 3.353 0.036
HOMA - % B 3.799 0.023
HOMA-IR 0.497 0.609
TC(更易/ L) 0.186 0.830
TG(更易/ L) 0.278 0.757
高密度脂蛋白胆固醇(更易/ L) 0.098 0.907
低密度(更易/ L) 0.345 0.708

值< 0.05。

4所示。讨论

十四SLC16a基因编码monocarboxylate转运蛋白(mct),包括MCT1-MCT14,已确定(13,14]。所有特定的结构包括一个大胞内循环,细胞内N - C -末端,12个跨膜域(tmd) [15]。家庭成员之间,最大的变化是通过利用表现出N - c终端和大型tmd 6和7之间的循环,而tmd是高度保留。MCT1-4传输单羧酸分子,如乳酸、丙酮酸和酮(16]。MCT8主要传输甲状腺激素,包括T3和T4 (17,18]。MCT10参与iodothyronines和芳香族氨基酸的双向传输19,20.]。MCT10倾向于运输MCT8更有效地比T3 (21]。SLC16a基因的单核苷酸多态性可以改变其特定的蛋白质序列,这可能会导致不同的组织分布和功能。然而,监管机制的蛋白质序列的变化引起的mct SLC16a基因在糖尿病仍不清楚。

未经中华人民共和国交通部H +耦合(22),参与维护间隙液的pH值(11]。间质液体允许细胞外信号分子,如神经递质和激素,达到调节细胞的功能。间质液的pH值变化影响效率的胞内信号转导到细胞外信号分子,包括胰岛素。在骨骼肌,减少细胞外间隙液的pH值降低胰岛素受体的亲和力,这是相对于减少胰岛素受体磷酸化(激活),而胰岛素受体的表达骨骼肌的质膜(没有变化23]。因此,未经中华人民共和国交通部参与胰岛素抵抗通过减少胰岛素受体的亲和力。

在我们的研究中,在SLC16a13 rs312457遗传变异增加患糖尿病的风险。受试者携带rs312457 GG基因型的糖尿病的风险最高。对受试者进行rs312457 GG基因型的基础胰岛素分泌,评估HOMA - % B,是减少。这表明rs312457 SLC16a13的遗传变异可能与胰腺胰岛素分泌。我们没有确定一个rs312457和HOAM-IR糖尿病患者之间的关系。这个结果可能表明,糖尿病患者的胰腺分泌下降速度与胰岛素抵抗的个体进行rs312457的纯合子GG基因型。鉴于其特定表现出组织特异性分布,各组织不同的特定的功能。因此,未经中华人民共和国交通部也可能参与调节胰腺β在糖尿病患者的胰腺细胞功能。

我们需要将进一步努力为识别SLC16a13机制在糖尿病的发病机制和促进早期诊断和预防的策略旨在减少这种疾病负担增加。作为一种新兴学科,药物基因组学强调了继承和获得的遗传变异函数,在药物反应以及促进适当的抗糖尿病的药物选择。

我们所知,本研究首次证实,rs312457 SLC16a13基因的基因型在中国人口与糖尿病有关。这项研究提供了新的和有用信息的潜在机制研究糖尿病患者,帮助抗糖尿病的药物的合适的选择。

然而,本研究有一定的局限性。自控制从医院招募的时候,一定程度的选择性偏差的可能性不能排除。然而,在当前的样本,人口相对比较均匀。受试者都生活在同一地区,有相同的饮食偏好的脂肪碳水化合物的比例。在当前条件下,潜在的选择性偏差被认为是最小的。

数据可用性

和/或使用的数据集分析在当前研究可从相应的作者以合理的要求。

的利益冲突

作者声明没有竞争的经济利益。

作者的贡献

回族郑和佳林杨导致了概念和设计。回族郑Yujuan扇了方法论的发展。回族郑和Yu张样本收集。回族郑和她Pu导致了数据的分析和解释。回族郑、她Pu和佳林杨导致了写作,评论,和/或修改的手稿。回族郑、她Pu和余张同样贡献了这个工作。

确认

这项工作是由中国国家自然科学基金(批准号82070889),申请人:佳林杨。

引用

  1. y, l . Wang j . et al。”中国成人糖尿病患病率和控制”,《美国医学会杂志》,卷310,不。9日,第959 - 948页,2013年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  2. x太阳,w . Yu和c·胡“2型糖尿病的遗传学:洞察的发病机理及其临床应用,”生物医学研究的国际926713卷,2014篇文章ID, 15页,2014年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  3. j·b·乔·他还l·m·沙利文et al .,“基因型分数除了常见的预测2型糖尿病的风险因素,”《新英格兰医学杂志》上,卷359,不。21日,第2219 - 2208页,2008年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  4. m . van Hoek a . Dehghan j . c . m . Witteman et al .,“基于多态性预测2型糖尿病从全基因组关联研究:以人群为基础的研究中,“糖尿病卷,57号11日,第3128 - 3122页,2008年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  5. m . c . Cornelis l .气c . Zhang et al。”联合共同遗传变异的影响2型糖尿病的风险在美国男性和女性的欧洲血统,”内科医学年鉴,卷150,不。8,541 - 550年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  6. 诉Lyssenko, a·琼森,p . Almgren et al .,“临床危险因素、DNA变异,和2型糖尿病的发展,“《新英格兰医学杂志》上,卷359,不。21日,第2232 - 2220页,2008年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  7. y Horikawa: Oda: j·考克斯et al .,“遗传变异的基因编码calpain-10与2型糖尿病有关,”自然遗传学,26卷,不。2、163 - 175年,2000页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  8. c . c . Wang, r . Zhang et al .,“常见变异的肝细胞的核因子β1与2型糖尿病有关中国人口,”糖尿病,卷。58岁的没有。4、1023 - 1027年,2009页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  9. k Hara h Fujita, t·a·约翰逊et al .,“全基因组关联研究识别三个小说位点为2型糖尿病,”人类分子遗传学,23卷,不。1,第246 - 239页,2014。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  10. j . Adijanto和n . j . Philp”SLC16A monocarboxylate转运蛋白家族(mct)——生理和功能在细胞新陈代谢,pH稳态,和流体运输,”当前膜的话题卷,70年,第311 - 275页,2012年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  11. y Marunaka”,角色间质液pH值在糖尿病:糖酵解和线粒体功能,“世界糖尿病杂志》》第六卷,没有。1,第135 - 125页,2015。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  12. 加布里埃尔,l . Ziaugra, d . Tabbaa”SNP基因分型使用Sequenom MassARRAY iPLEX平台”当前人类遗传学的协议,60卷,不。1,2009。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  13. m·e·莫里斯和m . a . Felmlee proton-coupled中华人民共和国交通部负责的概述(SLC16A)转运蛋白家族:特征、功能和作用的运输毒品滥用gamma-hydroxybutyric酸,”aap日报,10卷,不。2、311 - 321年,2008页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  14. a . p . Halestrap d .梅雷迪思,“SLC16基因家族monocarboxylate转运蛋白(mct)芳香族氨基酸转运蛋白,”弗鲁格档案,卷447,不。5,619 - 628年,2004页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  15. a . p . Halestrap和n . t .价格”proton-linked monocarboxylate运输车(MCT)家庭:结构、功能和监管,”生物化学杂志,卷343,不。2、281 - 299年,1999页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  16. a . Bonen m . Heynen、净化和h”分布monocarboxylate运输车MCT1-MCT8在老鼠和人类骨骼肌组织,”应用生理学、营养和新陈代谢没有,卷。31日。1 - 39,2006页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  17. e . c . Friesema Ganguly, a·阿布达拉j·e·m·福克斯,a . p . Halestrap t·j·维瑟,“识别monocarboxylate运输车8作为特定的甲状腺激素,”《生物化学》杂志上,卷278,不。41岁,40128 - 40135年,2003页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  18. e . c . Friesema g·g·j·m·柯伊伯j .詹森t·j·维瑟·m·h·a·科斯特,“甲状腺激素人类monocarboxylate运输车运输8在细胞内代谢及其病原反应的作用,“分子内分泌学,20卷,不。11日,第2772 - 2761页,2006年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  19. d . k . Kim y Kanai, a . Chairoungdua h .松尾和h . Endou, s·h·查Na表达克隆+独立的芳香族氨基酸转运体与结构相似性H+/ monocarboxylate转运蛋白”,《生物化学》杂志上,卷276,不。20日,第17228 - 17221页,2001年。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  20. 斋月t, s·m·r·Camargo诉总结et al .,“管基底芳香族氨基酸转运TAT1 (Slc16a10)函数作为一个流出途径,”细胞生理学杂志,卷206,不。3、771 - 779年,2006页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  21. w·e·维瑟·e·c·h·Friesema j .詹森和t·j·维瑟,“甲状腺激素monocarboxylate运输车运输。”最佳实践与研究。临床内分泌学与代谢,21卷,不。2、223 - 236年,2007页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  22. t . Iwanaga和a .岸本”monocarboxylate转运蛋白的细胞分布:审查”,生物医学研究,36卷,不。5,279 - 301年,2015页。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索
  23. h . Hayata h .宫崎骏:Niisato: Yokoyama和y Marunaka“pH值降低了细胞外参与骨骼肌胰岛素抵抗的发病机制,“生物化学和生物物理研究通信,卷445,不。1,第174 - 170页,2014。视图:出版商的网站|谷歌学术搜索

版权©2021回族郑等。这是一个开放分布式下文章知识共享归属许可,它允许无限制的使用、分配和复制在任何媒介,提供最初的工作是正确引用。


更多相关文章

PDF 下载引用 引用
下载其他格式更多的
订单打印副本订单
的观点116年
下载215年
引用

相关文章

文章奖:2020年杰出的研究贡献,选择由我们的首席编辑。获奖的文章阅读