研究文章

与肺腺癌的生存相关的潜在基因被甲基化识别

表4

最重要的是丰富信号通路。

基因 MSigDB集合 基因集名称 新经济学院 瓦尔 罗斯福

需要4 c2.cp.kegg.v7.1.symbols.gmt KEGG_FOCAL_ADHESION 2.666 0.002 0.008
KEGG_REGULATION_OF_ACTIN_CYTOSKELETON 2.523 0.002 0.008
KEGG_ECM_RECEPTOR_INTERACTION 2.511 0.002 0.008
c5.bp.v7.1.symbols.gmt GO_GRANULOCYTE_MIGRATION 2.562 0.002 0.011
GO_DEFENSE_RESPONSE_TO_VIRUS 2.511 0.002 0.011
GO_SUBSTRATE_ADHESION_DEPENDENT_CELL_SPREADING 2.462 0.002 0.011

ASB16 c2.cp.kegg.v7.1.symbols.gmt KEGG_TASTE_TRANSDUCTION 1.701 0.002 0.088
KEGG_ABC_TRANSPORTERS 1.605 0.006 0.088
KEGG_LINOLEIC_ACID_METABOLISM 1.518 0.031 0.139
c5.bp.v7.1.symbols.gmt GO_MRNA_SPLICE_SITE_SELECTION 1.935 0.001 0.133
GO_HISTONE_H3_K27_METHYLATION 1.893 0.001 0.133
GO_EXTRACELLULAR_TRANSPORT 1.871 0.001 0.133

NES:规范化浓缩分数;罗斯福:错误发现率。