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自然语言处理技术在生物信息学的调查

表2

Web服务器和网站预测蛋白质间交互作用。

问题 的名字 网站 输入格式

蛋白质交互网站预测 PPISP http://pipe.scs.fsu.edu/ppisp.html PDB文件
http://pipe.scs.fsu.edu/meta-ppisp.html
Protemot http://protemot.csbb.ntu.edu.tw/index.html PDB标识
SPPIDER http://sppider.cchmc.org PDB文件或PDB ID
Whiscy http://nmr.chem.uu.nl/Software/whiscy/index.html PDB文件

蛋白质相互作用预测 解释 http://www.russell.embl.de/cgi-bin/tools/interprets.pl Fasta 40序列
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Wilbur/IRET/PIE/ 基因ID或名称
PPI http://121.192.180.204:8080 / PPI / Home.jsp Fasta
PredHS http://www.predhs.org/ PDB文件、10个文件
Pred-PPI http://cic.scu.edu.cn/bioinformatics/predict_ppi/default.html 两个fasta序列
棱镜 http://cosbi.ku.edu.tr/prism/ 两个PDB id或PDB文件
Struct2Net http://groups.csail.mit.edu/cb/struct2net/webserver/ 基因名称或关键字