医学中的计算和数学方法/2015/文章/选项卡5

研究文章

基于一致序列和分段PSSM的低相似度序列蛋白质结构分类预测

表5

不同方法在三个数据集上的性能比较。

数据集 方法 预测精度(%)
所有- - - 所有- - - OA (%)

1189 PSSM-S [36 93.3 85.1 77.6 65.6 80.2
LCC-PSSM [25 89.2 88.8 85.6 58.5 81.2
MBMGAC-PSSM [40 79.8 85.0 84.7 50.6 76.3
RPSSM [34 67.7 75.2 74.6 17.4 60.2
AADP-PSSM [15 69.1 83.7 85.6 35.7 70.7
AATP [33 72.7 85.4 82.9 42.7 72.6
MEDP [35 85.2 84.0 84.3 45.2 75.8
PsePSSM [41 82.0 82.3 84.1 44.0 74.4
AAC-PSSM-AC [17 80.7 86.4 81.4 45.2 74.6
这篇论文 84.8 85.4 85.0 55.2 78.5

25个pdb PSSM-S [36 93.8 92.8 92.6 81.7 90.1
LCC-PSSM [25 91.7 80.8 79.8 64.0 79.0
MBMGAC-PSSM [40 86.7 81.5 79.5 61.7 77.2
RPSSM [34 75.6 70.2 52.0 43.3 60.8
AADP-PSSM [15 83.3 78.1 76.3 54.4 72.9
AATP [33 81.9 74.7 75.1 55.8 71.7
MEDP [35 87.8 78.3 76.0 57.4 74.8
AAC-PSSM-AC [17 85.3 81.7 73.7 55.3 74.1
PsePSSM [41 86.2 78.8 75.7 57.6 75.5
夏等[42 92.6 72.5 71.7 71.0 77.2
这篇论文 94.4 91.9 71.1 92.5 88.4

640 LCC-PSSM [25 92.8 88.3 85.9 66.1 82.7
MBMGAC-PSSM [40 86.2 83.1 85.3 63.2 79.1
MEDP [35 84.8 75.3 86.4 53.8 74.7
PsePSSM [41 73.9 76.6 85.3 51.5 71.7
这篇论文 83.3 83.1 83.0 60.2 77.0

年度文章奖:由主编评选的2020年杰出研究贡献。阅读获奖文章