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进步对可预见的设计在生物工程和计算工具

箱1

基因部分和基因表达系统的体系结构。
369681. fig.001
最简单的表达系统(面板)包括一个启动子(弯曲的箭头),
一个核糖体结合位点(苏格兰皇家银行、椭圆形),一个基因(直箭头)和转录终止子
(六角)。更复杂的体系结构有一个操纵子(面板B)结构,在多个基因,
用自己的苏格兰皇家银行,由一个启动子表达;一个二基因操纵子。
个人或复合基因表达系统可以放置在一个质粒向量(面板C),
由主持人应变保持在一个特定的拷贝数每个细胞,根据
细菌染色体特定复制起源,或(D),虚线表示
基因组DNA的宿主。
启动子控制下游基因的转录。他们的顺序决定了
信息转录强度和监管的其他因素。不同的启动子
类存在于大肠杆菌,根据特定的σ因子决定了他们
监管。其他因素,如激活/抑制因子蛋白,广泛用于合成
电路,可以提供额外的程度的控制。
苏格兰皇家银行是放置小序列上游的基因。他们是转录成信使rna
但不翻译,因为蛋白质合成从8月开始编码序列的密码子。
苏格兰皇家银行(RBS)序列决定核糖体和mRNA之间的亲和力,从而影响
翻译起始速度。特别是,信使rna结合核糖体的发生
Shine-Dalgarno地区的苏格兰皇家银行的核糖体rna 30 s核糖体亚基的大肠杆菌。
转录终止剂rho-independent类的利用停止RNA发夹结构
聚合酶在转录活动。这类终端是常用的
合成电路,而不是调节转录停止通过rho-dependent结束符
一个ATP-dependent过程,没有被完全理解。
基因编码的蛋白质,可以促使不同的特定的监管或
代谢功能。基因序列可以影响信使rna折叠,这可能会导致不同的
翻译起始速率和不同的衰变率的记录。此外,密码子使用的偏见
确定特定的密码子偏好对他人对于一个给定的有机体。由于这些原因,两个
相同的由两个不同的基因编码的蛋白质(设计利用遗传代码冗余),
可以有多样的合成率。