研究文章

识别和全基因组功能注释ER-Regulated基因在乳腺癌基于ChIP-Seq数据

表2

不同的特点概述Chip-Seq峰值检测算法。

算法 配置文件 背景模型 控制样品 使用控制计算罗斯福

F-Seq 核密度估计(KDE)
FindPeaks 聚合重叠的标签 蒙特卡罗
SISSRs 窗口扫描 泊松
追求 核密度估计(KDE)
苹果电脑 标记转移然后窗口扫描 动态泊松
CisGenome Strand-specific窗口扫描 负二项