表示为时间的函数trajectory1 (10 ns)。黑色曲线:表示之间首先配置和连续的。蓝色曲线:对于一个给定的配置,表示每个其他配置相同的轨迹计算,平均收益率。这个值的的然后采用最大作为参考吗整个情节RMSD值轨迹。红色曲线:蓝色曲线,但最少。注意RMSD之间的参考配置和本身被定义为零。