医学中的计算和数学方法

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医学中的计算和数学方法/2006/文章

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体积 7 |文章的ID 515794 | https://doi.org/10.1080/10273660600906416

t·a·休斯,j·n·麦克韦恩 RNA二级结构的数学和生物学模型及其对基因表达的影响",医学中的计算和数学方法 卷。7 文章的ID515794 7 页面 2006 https://doi.org/10.1080/10273660600906416

RNA二级结构的数学和生物学模型及其对基因表达的影响

收到了 2006年5月26日
修改后的 2006年6月12日
接受 2006年6月23日

摘要

信使rna 5 '非翻译区域内的二级结构可能对其信息的翻译效率产生深远的影响,从而影响基因表达。因此,它们可以作为重要的调节基序在生理和病理设置。目前预测这些RNA序列二级结构的方法都是寻找具有全局最小自由能的结构。然而,由于RNA在合成或从翻译机制中释放时从5 '端逐渐折叠,这可能不是最可能的结构。我们讨论了二级结构的预测,基于局部最小化的自由能和热力学波动,核苷酸添加到3 '端,并表明这些可以导致不同的二级结构。我们还讨论了研究5 '非翻译区域内结构所指定的翻译抑制程度的方法。

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