TY - JOUR A2 - Zhang, Fuquan AU - Liu, Fulin AU - Rouault, Christine AU - Guesnon, Mickael AU - Zhu, Wencan AU - Clément, Karine AU - Degrelle, Séverine A. AU - Fournier, Thierry PY - 2020 DA - 2020/04/01 TI - PPAR的比较研究γ人绒毛外细胞滋养层细胞SP - 9210748 VL - 2020 AB -滋养层细胞作为胎盘的主要组成部分,经历细胞分化过程,如侵袭、迁移和融合。这些过程的异常可导致一系列潜在机制尚不清楚的妊娠疾病。过氧化物酶体增殖物激活受体是胎盘形成过程中被证明必不可少的一种蛋白质
γ(PPAR
γ),它在妊娠早期表达于绒毛外细胞滋养细胞(evct)的细胞核中,在妊娠期间表达于绒毛状细胞滋养细胞(vct)的细胞核中。在这里,我们的目的是探索PPAR的全基因组效应
γ通过PPAR治疗的evct和vct
γ受体激动剂罗格列酮。evct和vct从人绒毛膜绒毛中纯化,培养
在体外,用罗格列酮治疗。两种细胞的转录组然后用微阵列分析来定量。筛选差异表达基因(DEGs),用ClueGO进行基因本体(GO)注释和通路分析。使用在线工具STRING预测PPAR
γ和DEG蛋白的相互作用,而iRegulon用于预测PPAR的结合位点
γ和度推动者。比较evct和使用clusterProfiler的vct的GO和路径项。在Cytoscape中进行可视化处理。从我们的微阵列数据来看,罗格列酮治疗的evct (rt - evct)中检测到139个deg,罗格列酮治疗的evct (rt - vct)中检测到197个deg。下游注释分析揭示了rt - evct与rt - vct在治疗影响的生物学过程、分子功能、细胞组分、KEGG通路等方面的异同。以及蛋白质-蛋白质相互作用和转录因子-靶基因相互作用的预测结合位点。这些结果为PPAR的研究提供了广阔的前景
γ-滋养细胞激活过程;进一步分析rt - evct和rt - vct的转录组特征应该为未来的研究开辟新的途径,并有助于发现人类胎盘中可能的药物靶向基因或途径。SN - 1687-4757 UR - https://doi.org/10.1155/2020/9210748 DO - 10.1155/2020/9210748 JF - PPAR Research PB - Hindawi KW - ER -