TY -的A2 -李,Sainan AU -潘,齐非盟- Cheng应非盟- Cheng东华PY - 2021 DA - 2021/06/03 TI - CD8 + T闲暇的基因的识别:相关性肝癌的免疫表型,结果SP - 9960905六世- 2021 AB - 目的。晚期肝癌的治疗效果不佳。免疫疗法是一种治疗策略,已被广泛用于治疗其他癌症。研究表明,CD8 + T淋巴细胞免疫治疗的疗效影响因素至关重要。我们使用计算生物学方法来确定coexpressed基因网络,促进CD8 + T淋巴细胞浸润。 方法。我们获得了肝癌基因矩阵和临床随访信息数据,TCGA肝脏肝细胞癌FPKM。我们获得的单核苷酸多态性(SNP)的数据来评估肿瘤突变的负担。“估计”包和CIBERSORT算法被用来评估肿瘤纯洁和CD8 + T淋巴细胞的比例在肝癌组。我们使用了肝癌基因表达矩阵和相对比例的CD8 + T淋巴细胞作为输入文件和执行WGCNA在此基础上分析。加权coexpression网络识别最CD8 + T lymphocyte-related coexpression模块在肝癌。然后,我们分析了生物过程参与的模块。我们确定coexpression模块与CD8 + T淋巴细胞浸润的数据和功能。然后我们筛选因素coexpression模块与CD8 + T淋巴细胞含量大于0.4。最后,这些因子的表达水平在蛋白质水平验证使用免疫组织化学和单细胞测序。 结果。我们确定的CD8 + T淋巴细胞比例与coexpression网络。四个coexpressed基因(C1QC CD3D GZMA,和PSMB9)被确定为CD8 + T细胞coexpression基因促进了CD8 + T细胞的渗透。因为因素coexpression网络经常参与类似的生物过程,我们发现这些因素最相关抗原肽抗原的处理和显示功能的浓缩。在临床表型分析,我们发现,18个因素可以作为独立的预后保护性因素。我们发现这些因素显著负相关,肿瘤与M2巨噬细胞纯度和负相关immunophenotyping分析。用免疫组织化学和单细胞测序分析,我们发现CD3D抗体染色较弱的比正常组织和肿瘤组织与CD8 + T细胞。 结论。这些coexpressed基因呈正相关的高渗透比例CD8 + T淋巴细胞抗原表达过程。生物过程可能为患者提供新的方向对免疫疗法。SN - 2314 - 8861 UR - https://doi.org/10.1155/2021/9960905 - 10.1155 / 2021/9960905摩根富林明免疫学研究期刊》的研究PB - Hindawi KW - ER