TY -的A2 Abdulhay Enas盟——太阳,恒盟——隋,鲍文AU -李,Yu盟——严,小君非盟-曹,明明盟——张,礼嘉盟——刘,松江PY - 2021 DA - 2021/09/22 TI -免疫细胞渗透的意义和预后分析非小细胞肺癌的生物信息学SP - 3284186六世- 2021 AB -
客观的.基于生物信息学对非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer, NSCLC)表达谱芯片数据进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis, GSEA)和免疫细胞浸润分析,构建TICS评分模型,区分预后时间,筛选NSCLC治疗的关键基因和肿瘤相关途径。探索非小细胞肺癌患者的差异基因,预测非小细胞肺癌的潜在治疗靶点,为非小细胞肺癌的治疗提供新的方向。
方法.使用81例NSCLC患者的转录组数据和GEO数据库下载匹配的临床数据(访问号:GSE120622)。形成非小细胞肺癌(NSCLC)的表达。根据TICS值计算并分组,利用mRNA表达谱数据对非小细胞肺癌患者进行GSEA。生物过程分析(GO), DAVID和KOBAS对差异基因进行通路富集(KEGG)分析。利用蛋白质相互作用(PPI)对数据库STRING进行分析,构建目标相互作用的PPI网络模型。
结果。通过以上分析,我们得到6个明显相关的免疫细胞,包括活化的B细胞(图)
1(b),
p
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0.001
).根据显著相关免疫细胞的TICS值,获得41个高危样本和40个低风险样本。对TICS值与免疫评分值进行Pearson相关系数计算,发现TICS值与IMS值显著相关(Cor = 0.7952)。基于非小细胞肺癌mRNA表达谱数据,在高TICS组和低TICS组之间的mRNA表达均有显著变化(FDR 0.01, FC > 2)。研究人员发现,在高TICS组中有730种mrna显著上调,在低TICS组中有121种mrna显著下调。使用STRING数据选取高置信度边(组合评分>0.7);然后,将191个mrna匹配到反向边缘;最后,构建了包含164个点和777条边的无向网络。细胞趋化因子介导的信号通路的重要成员,如CCL19,影响患者的生存时间。
结论.(1)非小细胞肺癌患者的寿命与未成熟B细胞、活化B细胞、MDSC、效应记忆CD4 T细胞、嗜酸性粒细胞和调节性T细胞的存在密切相关。(2)与NSCLC生存相关的免疫相关基因CX3CR1、CXCR4、CXCR5、CCR7通过调节免疫过程影响NSCLC患者的预后。SN - 2040-2295 UR - https://doi.org/10.1155/2021/3284186 DO - 10.1155/2021/3284186 JF - Journal of Healthcare Engineering PB - Hindawi KW - ER -