TY -的A2 -李,逸盟——Shrestha Prasansah盟——Karmacharya Jayram AU -汉,所以ra AU - Lee Jun Hyuck盟——公园、Hyun AU -哦,Tae-Jin PY - 2022 DA - 2022/11/09 TI -完整的基因组序列和比较基因组分析Variovoraxsp,菌株PAMC28711 PAMC26660, PAMC28562和海藻糖代谢途径在南极洲隔离sp - 5067074六世- 2022 AB -的完整基因组 Variovorax菌株的基因组进行了分析和比较 Variovorax菌株PAMC28711, PAMC28562 PAMC26660,南极隔离。基因组信息收集从NCBI数据库和CAZyme数据库,和Prokka注释被用来发现海藻糖代谢途径的基因编码。同样,CAZyme注释(dbCAN2元服务器)进行预测CAZyme家族负责海藻糖生物合成和降解酶。海藻糖已经找到应对渗透压力和极端温度。因此,海藻糖代谢途径的研究是在严酷的环境下如南极,那里的细菌 Variovoraxsp.菌株PAMC28711、PAMC28562 PAMC26660可以在极端环境中生存下来,如低温。通过生物信息学工具分析了海藻糖代谢途径,如dbCAN2元服务器,Prokka注释,多重序列比对,ANI计算器,帕特里克数据库,帮助预测海藻糖生物合成和降解基因的参与的完整基因组 Variovorax菌株。同样,大型 X被用于进化和守恒的基因。完整的基因组 Variovorax菌株PAMC28711、PAMC26660 PAMC28562环状染色体的长度(4320000、7390000和4690000年)英国石油(bp)分别与GC含量(66.00,66.00,和63.70)%,分别。这三个的GC含量 Variovorax压力比其他的低 Variovorax菌株与完整的基因组。菌株PAMC28711 PAMC28562展览三个完整的海藻糖生物合成途径(OtsA / OtsB、TS和特雷/特雷),但应变PAMC26660只拥有一个(OtsA / OtsB)。尽管这三个菌株含有海藻糖,只有根据CAZyme应变PAMC28711有两个海藻糖酶家庭(GH37和GH15)。此外,在三个南极洲隔离,只有应变PAMC28711展品辅助活动(AAs)、一个CAZyme家庭。到目前为止,虽然 Variovorax不同的目的菌株进行了研究,海藻糖代谢途径 Variovorax菌株没有被报道。进一步说,这项研究提供了额外的信息关于海藻糖生物合成和降解基因(海藻糖酶)基因的一个因素促进细菌在极端环境下生存,而这种酶显示在生物技术领域的应用前景。SN - 1687 - 918 - 2022/5067074 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2022/5067074——摩根富林明——国际微生物学杂志》上PB - Hindawi KW - ER