TY -的A2,安东尼奥盟——Khew白菜袁AU - Harikrishna,詹妮弗·安非盟-凌晨,魏绮盟——刘,Ee领带盟——黄,Siaw圣PY - 2020 DA - 2020/04/30 TI -各种基因的转录测序和基因表达分析水果发展的三个不同的黑胡椒粉(Piper初步l .)品种SP - 1540915 VL - 2020 AB -黑胡椒( Piper初步)是一种重要的香料作物，用途广泛，从烹饪到药理学。然而，有限的遗传信息限制了对黑胡椒花和果实发育的分子调控的理解。本研究以黑胡椒品种Semengok Aman (SA)、Kuching (KC)和Semengok 1 (S1)为研究对象，通过对不同果实性状的黑胡椒品种Semengok Aman (SA)、Kuching (KC)和Semengok 1 (S1)的比较，探讨黑胡椒花和果实发育的遗传调控。利用下一代测序(NGS)技术，在Illumina HiSeq 2500平台上测序，确定花和水果转录组 新创使用SOAPdenovo-Trans组装。66,906个unigenes高质量组装，其中与GenBank数据库中一个或多个蛋白质序列相似的基因序列占64.4%(43,115)。Blast2Go的注释为一个或多个基因本体论术语分配了37377个基因。在这些基因中，有5,874个基因与KEGG数据库中记录的生物通路进一步相关。通过对3个黑胡椒品种花和果实转录组数据的比较，发现SA品种花和果实之间存在大量的DEGs。基因本体(GO)富集分析进一步支持花与果实间基因差异表达基因在碳水化合物代谢过程、胚胎发育过程和DNA代谢过程等方面的功能，而果实中基因差异表达基因涉及生物合成过程、次生代谢过程和分解代谢过程。我们还对KEGG通路中DEGs的富集进行了研究，发现大量基因属于核苷酸代谢和碳水化合物代谢范畴。开花相关基因的基因表达谱分析表明，开花相关基因除调控黑胡椒开花外，还可能参与黑胡椒果实发育过程。对黑胡椒果实中糖转运体和糖代谢基因的转录分析表明，黑胡椒果实中糖代谢是发育调控的，其中一些基因可能是未来作物品质改良的潜在基因。胡椒氨酸相关基因表达分析表明，赖氨酸衍生产物可能存在于果实发育的各个阶段，但运输仅在果实发育的早期活跃。 These results indicate several candidate genes related to the development of flower and fruit in black pepper and provide a resource for future functional analysis and potentially for future crop improvement. SN - 2314-436X UR - https://doi.org/10.1155/2020/1540915 DO - 10.1155/2020/1540915 JF - International Journal of Genomics PB - Hindawi KW - ER -