TY -的A2 -艾哈迈德,哈菲兹Ishfaq AU -,分盟,赞金陵PY - 2021 DA - 2021/07/28 TI -儿童哮喘的鉴别Progression-Related lncRNAs使用加权和mrna适合作为生物标记基因Coexpression网络分析SP - 5511507六世- 2021 AB -
背景。儿童哮喘是一种常见的慢性呼吸道疾病,严重影响孩子的健康和成长。生物信息学研究旨在识别潜在的RNA在当前候选人与儿童哮喘的发展密切相关的基因数据库。
方法。GSE65204 GSE19187数据集筛选和从NCBI GEO数据库下载。差异表达长非编码rna (DE-lncRNAs)和mrna (DE-mRNAs)被确定使用Bioconductor limma包R,这些DE-mRNAs被用于执行生物过程(BP)和京都基因和基因组的百科全书(KEGG)分析。此后,加权基因coexpression网络分析(WGCNA)是利用筛选模块直接关系到儿童哮喘,和coexpression网络DE-lncRNAs DE-mRNAs建成。最后,主成分分析(PCA)。
结果。总共7 DE-lncRNAs和1060 DE-mRNAs,以及7 DE-lncRNAs 1027 DE-mRNAs,分别确定GSE65204 GSE19187,。336年比较,之后重叠基因表达有相同的趋势,其中包括2重叠DE-lncRNAs和334 DE-mRNAs重叠。这些重叠DE-mRNAs浓缩在28日英国石油公司和12 KEGG通路。11模块得到GSE65204,发现紫色,黑色,黄色模块与哮喘发展显著正相关。随后,coexpression网络包括63 DE-mRNAs和2 DE-lncRNAs建成,和五个KEGG途径,包含8个基因,被认为是与儿童哮喘直接相关。主成分分析进一步验证这些结果。
结论。LncRNAs
LINC01559和
SNHG8和mrna
VWF,
LAMB3,
LAMA4,
CAV1,
ALDH1A3,
SMOX,
GNG4,
PPARG被确定为生物标志物与儿童哮喘的发展有关。SN -空你的https://doi.org/10.1155/2021/5511507做- 10.1155 / 2021/5511507 JF - PB - Hindawi KW - ER -遗传学研究