TY -非盟的福克斯,扎卡里·r . AU - Neuert格雷戈尔盟——Munsky布莱恩PY - 2020 DA - 2020/06/13 TI -优化设计中的单细胞实验暂时波动环境SP - 8536365六世- 2020 AB -现代生物实验正变得越来越复杂,这些实验和设计产生最大可能量化的洞察力是一个开放的挑战。越来越复杂的生物系统随机计算模型被用于理解和预测生物行为或推断生物参数。这种定量分析也可以帮助提高实验设计为特定的目标,如更多地了解特定模型机制或在某些情况下减少预测错误。一个经典的实验设计方法是使用费舍尔信息矩阵(鱼类),量化预期的信息特定实验揭示了模型参数。有限状态projection-based鱼翅(FSP-FIM)是最近开发的计算离散随机的鱼类基因调控系统,其复杂的响应分布不满足标准的高斯假设的变化。在这项工作中,我们发展FSP-FIM分析应激反应基因的随机模型
酿酒酵母在时变MAPK归纳。我们验证这FSP-FIM分析和用它来优化细胞的数量应量化在特定时间尽可能多地了解该模型参数。然后扩展FSP-FIM方法探讨不同测量时间或基因修改有助于减少不确定性在细胞外环境的感知,我们实验验证FSP-FIM排名单细胞实验最小化的能力估计的不确定性的氯化钠浓度在酵母渗透冲击。这项工作表明潜在的定量模型不仅理解现代生物数据集,关闭循环之间的定量建模和实验数据收集。SN - 1076 - 2787你——https://doi.org/10.1155/2020/8536365——10.1155 / 2020/8536365 JF - PB - Hindawi KW - ER -复杂性