TY -的A2 -杨,君非盟- Li Kezhu盟——郭,蜀盟通,双盟——太阳,羌族非盟-金,三盟——气、Bingran盟——邵,伊宁盟,徐奶奶PY - 2021 DA - 2021/12/28 TI -角化细胞的识别Differentiation-Involved基因转移性黑色素瘤的基因表达谱SP - 9652768六世- 2021 AB -
背景。黑色素瘤是最致命的一种皮肤癌。到目前为止,其病理机制,特别是转移的机制,在很大程度上仍未知。我们的研究基因的鉴定与黑色素瘤转移黑色素瘤提供了一种新颖的理解。
方法。从基因表达数据库综合(GEO),基因表达微阵列数据集GSE46517, GSE7553, GSE8401下载。我们利用R针对分析(度)之间的差异表达基因转移和nonmetastatic黑色素瘤。R还用于差异表达从GSE18509 microrna的(民主党)数据挖掘,GSE19387, GSE24996, GSE34460, GSE35579, GSE36236, GSE54492数据指的是李的研究。度和DEM数据的基础上,我们进行功能富集分析通过大卫的应用数据库。此外,我们构建蛋白质相互作用(PPI)网络,建立了功能模块利用数据库的字符串。通过利用Cytoscape, PPI结果可视化。我们预测的目标通过应用TargetScan民主党,米兰达,和皮塔饼之间的重叠基因数据库和识别度和预测目标,其次是DEM-DEG对网络的建设。这些角化细胞的表情differentiation-involved模块1的基因被确定基于TCGA的数据。
结果。239度筛选在所有3个数据集,包括21积极调控基因和218的负调控基因。基于这些239度,我们完成了构建的PPI网络由225个节点和846个边缘。我们完成建立3个功能模块。我们分析92重叠基因和26个microrna的,包括11个调节基因的目标11负监管民主党和81个表达下调基因15积极监管民主党的目标。证明微分转移相关基因的表达,11个角化细胞differentiation-involved基因,包括卤,EVPL, SPRR1A,焦距,SPRR1B, SPRR2B, TGM1, DSP, CSTA, CDSN, IVL模块1,显然是在转移性黑色素瘤组织中表达下调与原发性黑色素瘤组织相比基于TCGA的数据。
结论。239黑色素瘤转移相关基因和26个差异表达microrna被确定在我们的研究中。的角化细胞differentiation-involved基因可能参与黑色素瘤转移,这种疾病提供了一个潜在的分子机制。SN - 1748 - 670 - 2021/9652768 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2021/9652768——摩根富林明——计算和数学方法在医学PB - Hindawi KW - ER