TY - Jour Au - Zhu,Hujijing Au - 朱,刘li,刘刘,玉宏奥江,Fusong Au - Chen,Miao Au - Cheng,Lin Au - Cheng,Xingbo Py - 2020 da - 2020/10/23Bioinformatics分析SP-9602016 VL - 2020 AB的2型糖尿病型糖尿病患者的基因表达分析
客观的。本研究的目的是鉴定2型糖尿病(T2DM)中的候选基因,并探索其潜在机制。
方法。从基因表达omnibus(Geo)数据库下载基因表达谱GSE26168。在线工具Geo2R用于获得差异表达的基因(DEGS)。基因本体学(GO)术语富集分析和基因和基因组(KEGG)途径分析的京都常规途径通过使用ForeScape进行注释,可视化和全面发现进行。通过使用Cytoscape软件来找到候选基因和关键途径的蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI)网络。
结果。在T2DM中发现总共981次,包括301个上调基因和680个下调基因。从ForeScape进行分析显示,在细胞分化,细胞粘附,细胞内信号转导和蛋白激酶活性调节中显着富集。Kegg途径分析显示,DEG主要富集在营地信号通路,RAP1信号通路,脂肪细胞中脂解的调节,PI3K-AKT信号通路,MAPK信号通路等。基于DEG的PPI网络,鉴定了以下6个候选基因:PIK3R1,RAC1,GNG3,GNAI1,CDC42和ITGB1。
结论。我们的数据提供了基因,功能和途径的综合生物信息学分析,这可能与T2DM的发病机制有关。SN - 1748-670X UR - HTTPS://Doi.org/10.1155/2020/9602016 Do - 10.1155/2020/9602016 JF - 医学中的计算和数学方法PB - Hindawi KW - ER -