TY -的盟Cserhati地主选手AU -肖,彭盟——开瑞,Chittibabu PY - 2019 DA - 2019/11/15 TI - K-mer-Based主题分析昆虫按蚊,果蝇,舌蝇属及其应用物种分类SP - 4259479六世- 2019 AB -短k-mer从DNA序列都是守恒的,分化在物种形成物种由于其功能意义,使其使用在许多物种分类算法。在目前的研究中,我们开发了一种方法来分析整个基因组的DNA k-mers, 5′UTR,基因内区和3′UTR区域从属于三属58种昆虫 双翅目,包括 按蚊, 果蝇, 舌蝇。我们开发了一种改进的算法来预测和分数k-mers基于方案规范化k-mer分数在不同的基因亚区。该算法利用了整个基因组的信息内容相对于其他算法或研究分析只有一小部分基因。算法使用k-mers长度7 - 9日英国石油公司对整个基因组5′和3′UTR区域以及intronic区域。分类关系基于全基因组k-mer签名显示三个属物种聚集在一起很明显。我们也改善了得分和过滤这些k-mers准确的物种鉴定。全基因组k-mer内容相关性算法表明,物种在一个属相互关联紧密相比其他属。两个的基因组 伊蚊和一个 库蚊物种也分析演示新测序物种可以使用的分类算法。此外,与几十个物种使我们分配一个全基因组k-mer签名每个58的双翅类昆虫物种通过所有成对的比较k-mer内容。这些签名是用来比较和物种之间的相似性来确定集群的物种显示类似的签名。SN - 1748 - 670 - 2019/4259479 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2019/4259479——摩根富林明——计算和数学方法在医学PB - Hindawi KW - ER