TY -的A2黄Yanxin盟——Matochko Wadim l . AU - Derda Ratmir PY - 2013 DA - 2013/12/12 TI -误差分析的深度测序噬菌体库:肽测序SP - 491612年审查六世- 2013 AB -下一代测序技术从噬菌体展示库使配体的选择,因为他们可以检测到低丰富的克隆和量化克隆拷贝数的变化没有过多的选择。识别错误的深度测序数据是在这个过程中最关键的一步,因为这些技术出错率> 1%。机制,产生错误Illumina公司和其他技术已经提出,但没有报告日期描述误差分析噬菌体库。我们的论文主要关注7-mer肽库由Illumina公司测序方法的误差分析。理论这个噬菌体库的复杂性低,相比长基因读和基因组的复杂性,使我们用方便线性向量来描述这个库和操作框架。我们描述一个噬菌体库
N
×
1
频率向量
n
=
n
我
,在那里
n
我
的拷贝数
我
th序列和N是多样性的理论,也就是说,所有可能的序列的总数。任何操纵库是操作员身体力行
n
。选择、放大或测序可以被描述为一个产品的
N
×
N
矩阵和随机抽样操作符(
年代
一个
)。后者是一个对角矩阵,描述随机抽样的图书馆。在本文中,我们关注的属性
年代
一个
并使用它们来定义排序操作符(
年代
e
问
)。测序没有任何偏见和错误
年代
e
问
=
年代
一个
我
N
,在那里
我
N
是一个
N
×
N
统一的矩阵。任何偏差序列的变化
我
N
nonunity矩阵。我们确定一个对角审查矩阵(
C
E
N
),它描述了消除或显著将采样,在测序过程中特定的读取。SN - 1748 - 670 - 2013/491612 / 10.1155 x你——https://doi.org/10.1155/2013/491612——摩根富林明——计算和数学方法在医学PB - Hindawi出版公司KW - ER