计算和数学方法在医学
研究文章

patGPCR: Multitemplate方法改进的3 d结构的预测跨膜螺旋的G-Protein-Coupled受体

表1

八个决定GPCR的目标和他们的模板。
目标名称 全名 不。的太 模板 链 Avg圣 Avg太 Avg圣国防部f Avg太
1 gzm 一个 24% 6.34 ✓
趋化因子受体CXCR4 趋化因子受体CXCR4 932年 2 ks9 一个 30% 4.33 4.26±1.40 ✓ 7.69 11.4±0.16
2 rh1 一个 31% 5.77 ×
KOR1 κ阿片受体 1218年 4 amj 一个 27% 3.23 2.98±0.22 ✓ 3.37 7.11±0.20
4公式 一个 56% 3.40 ✓
2 y03 一个 36% 1.56 ✓
HH1R 组胺H1受体 1533年 3 sn6 R 47% 20.64 12.17±10.65 ✓ 3.87 17.32±0.24
4 amj 一个 33% 11.17 ✓
2 rh1 一个 44% 2.64 ✓
D3 多巴胺D3受体 1776年 2 y00 一个 34% 3.40 1.69±0.81 ✓ 1.75 2.61±0.16
2 vt4 一个 36% 3.20 ✓
1日19 一个 31% 4.35 ✓
负责
 腺苷受体负责 2076年 2 rh1 一个 44% 26.58 3.53±21.52 ✓ 3.85 7.88±0.30
2 vt4 一个 35% 4.16 ✓
2 z73 一个 23% 5.80 ✓
2 rh1 一个 27% 4.39 ✓
S1P1 鞘氨醇1-phosphate受体1 1031年 4公式 一个 54% 5.43 6.67±2.69 ✓ 10.83 23.71±0.77
4 amj 一个 29% 5.52 ✓
2 rh1 一个 29% 5.00 ✓
KOR3 nociceptin阿片受体 1409年 3 sn6 R 35% 7.73 3.41±1.67 × 8.71 16.82±0.43
4 amj 一个 37% 4.29 ✓
Beta2 beta-2-adrener gic受体 895年 3 eml 一个 33% 5.60 3.82±2.60 × 1.36 1.54±0.28
4 amj 一个 64% 2.19 ✓
Avg 1358.75 36% 6.38 4.81±5.20 5.11 11.05±0.32
产生的构象数太patGPCR (multiple-template)。
序列相似性。
平均产生的构象TM RMSD圣patGPCR(单模板)。
平均产生的构象TM RMSD太patGPCR (multiple-template)。
瑞士的输出。
平均产生的构象TM RMSD圣(单模板)分析员。
平均产生的构象TM RMSD MT (multiple-template)分析员。