TY - JOUR A2 - 陈,邢AU - 洛,加味AU - 黄聪盟 - 丁,平建PY - 2016 DA - 2016年9月15日TI - 一种基于元路径预测人类miRNA-目标协会SP方法- 7460740 VL - 2016 AB - 微小RNA(miRNA)是在调节基因表达中发挥重要作用的短非编码RNA,和扰动的miRNA通常与发展和肿瘤发生有关,因为他们有自己的目标mRNA的作用。从多种类型的基因组数据的预测潜在的miRNA靶协会是在生物信息学研究的一个相当大的问题。然而,大多数现有的方法没有充分利用实验验证的miRNA-mRNA的相互作用。在这里,我们开发RMLM和RMLMSe预测miRNA及其目标之间的关系。RMLM和RMLMSe,因为它们可以同时重建所有的miRNA靶失踪协会全球的方法和RMLMSe证明的序列信息的集成可以提高RMLM的性能。在RMLM,我们用RM措施来评估基于不同的元路径miRNA和其目标之间的关联性不同;逻辑回归和最大似然估计方法被用于估计不同的元路径的权重。在RMLMSe,序列信息被用来改善RMLM的性能。在这里,我们进行了五倍交叉验证和途径富集分析来证明我们的方法的性能。 The fivefold experiments show that our methods have higher AUC scores compared with other methods and the integration of sequence information can improve the performance of miRNA-target association prediction. SN - 2314-6133 UR - https://doi.org/10.1155/2016/7460740 DO - 10.1155/2016/7460740 JF - BioMed Research International PB - Hindawi Publishing Corporation KW - ER -