生物无机化学与应用
研究文章

建模铜(II)结合使用可扩展系统的力场肽

表3

(一)Ligand-copper距离(在)对不同几何形状的铜离子。
距离: C 离子 C 离子 Cu024 Cu025 Cu026
Cu-His16 (N 2) 3.51 2.36 2.39 2.91 2.90
Cu-Wtr366 (O1群) 2.44 3.75 2.13 2.7 2.63
Cu-Gln13 (O 1) 2.54 3.74 2.19 2.71 2.68
Cu-His9 (N 2) 2.85 2.34 2.41 2.94 3.08
Cu-His23 (N 1) 3.86 4.69 2.45 3.05 2.94
Cu-Ser22 (O) 2.49 2.17 2.20 2.69 2.72
His16 (N 2)-Wtr366 (O) 4.89 3.93 3.16 5.6 4.88
His9 (N 2)-His16 (N 2) 6.11 4.46 4.67 5.73 5.85
Gln13 (O 1)-Ser22 (O1) 4.83 5.09 4.27 5.20 5.32
His9 (N 1)gln 13 (O 1) 4.44 4.89 3.97 4.53 4.44
His23 (N 1)-Ser22 (O1) 3.07 7.04 3.13 2.96 3.14
Ser22 (O1) -Wtr366 (O) 4.36 4.45 3.06 4.27 4.18
His23 (N 1)-Wtr366 (O1) 6.08 7.86 4.44 5.58 5.54
His23 (N 1)-Gln13 (O 1) 5.69 6.37 3.10 4.41 4.34
His16 (N 2)-Ser22 (O) 4.16 2.94 3.07 3.36 3.8
His9 (N 1)-Wtr366 (O) 3.98 5.32 3.14 4.15 3.61
His9 (N 1)-Ser22 (O) 3.93 3.70 3.19 4.45 4.39
His9 (N 2)-His23 (N 1) 3.26 4.11 4.29 4.81 4.83
His23 (N 1)-His16 (N 2) 5.72 4.92 2.30 2.53 2.62
Gln13 (O 1)-Wtr366 (O) 3.09 7.26 3.01 3.50 3.68
His16 (N 2)-Gln13 (O1) 3.17 5.13 2.73 3.33 3.41
(b)Ligand-copper角度对不同几何形状的铜离子1。
角度(在 : C 离子 C 离子 Cu024 Cu025 Cu026
N16-Cu-O366 109.29 76.32 84.36 108.41 124.13
N16-Cu-N9 147.48 143.12 154.01 156.76 156.46
N9-Cu-O13 65.25 111.3 118.96 106.37 100.33
O13-Cu-O366 76.52 41.17 88.33 80.71 87.64
N23-Cu-N9 55.67 63.04 95.74 107.51 106.28
N23-Cu-N16 101.63 83.38 71.96 50.44 53.45
N23-Cu-O13 51.21 99.28 54.11 100.31 66.69
N23-Cu-O366 148.79 140.31 148.08 156.41 169.19
O22-Cu-O366 124.45 122.43 90.12 105.02 102.62
O22-Cu-N16 85.89 80.87 84.36 90.97 85.04
O22-Cu-O13 97.62 136.03 153.41 148.27 160.31
O22-Cu-N9 94.59 111.10 87.45 104.26 98.24
N23-Cu-O22 52.65 86.66 131.33 62.16 67.21
N9-Cu-O366 97.21 119.77 87.35 94.59 78.11
N16-Cu-O13 82.45 74.71 74.16 73.57 75.31
1参考表3(一)的配位原子第一列。