TY - JOUR A2 - 海沃德,加里·AU - Ayginin,安德烈A. AU - Pimkina,叶卡捷琳娜V. AU - Matsvay,阿丽娜D. AU - Speranskaya,安娜S. AU - 萨福诺娃,码头五AU - Blinova,叶卡捷琳娜A. AU - Artyushin,伊利亚V. AU - Dedkov,弗拉基米尔G. AU - Shipulin,德国A. AU - Khafizov,卡米尔PY - 2018 DA - 2018年8月12日TI - 病毒RNA多样性研究中的鸟样中从头设计的多重属特异性引物板SP - 3248285 VL - 2018 AB - 进展在下一代测序(NGS)技术已经显著增加了我们的发现新的病毒以及系统确定各种生物样品中的病毒流行的频谱能力。此外,这种方法还有助于在与许多疾病建立viromes的关联。然而,与宏基因组研究使用
16SrRNA基因的细菌检测,就不可能建立普遍的寡核苷酸针对所有已知的和新的病毒,因为它们的基因组多样性和可变性。在另一方面,测序整个基因组仍是昂贵的,并且具有用于这样的应用中相对低的灵敏度。寡核苷酸靶向富集的设计现有的方法通常涉及的特定病毒种类或属的基于PCR的检测引物的发展,但不适合家庭或更高分类订单。在这项研究中,我们已经开发设计能够覆盖各种分类的订单中已知的病毒,以及他们的新变体显著数量的寡核苷酸计算管线。随后,我们设计的生物材料的病毒核酸靶向富集属特异性寡核苷酸面板和证明鸟样品中其病毒检测应用的可能性。我们已经使用许多收集的样品的测试我们的面板和已经观察到在检测优异的效率和病毒病原体鉴定。由于用于序列的快速鉴定一种可靠的,基于生物信息学分析方法是至关重要的,基于NGS-数据分析模块在该研究中被开发,并且其在检测的新颖的病毒和病毒组多样性的分析功能被证明。SN - 1687-8639 UR - https://doi.org/10.1155/2018/3248285 DO - 10.1155 /三百二十四万八千二百八十五分之二千○一十八JF - Hindawi出版KW - - 在病毒学PB进展ER -