研究文章
评估Andrographolide作为一个强有力的NS3-4A蛋白酶抑制剂及其耐药突变体使用在网上方法
表4
Ligand-protein互动对接的分数。
|
| 蛋白质 |
复合名称 |
导致它(对接) |
| 导致它的分数 |
H-bond |
氨基酸 |
氨基酸原子 |
配位原子 |
H-bond长度(Å) |
|
| 野生型丙肝病毒蛋白酶 |
Andrographolide |
−15.0862 |
3 |
SER138 |
接下来的 |
O5 |
1.99421 |
| SER139 |
接下来的 |
O3 |
2.17439 |
| HIS57 |
NE2 |
H55 |
1.719 |
| Asunaprevir |
−3.7159 |
5 |
GLY41 |
HE21 |
O8 |
1.6653 |
| HIS57 |
HD2 |
O6 |
2.12614 |
| GLY58 |
HA1 |
O6 |
3.07324 |
| GLY137 |
HA1 |
O7 |
2.76771 |
| ARG155 |
O |
H92 |
2.73609 |
|
| R155K |
Andrographolide |
−15.2322 |
6 |
SER138 |
接下来的 |
O5 |
2.44552 |
| SER139 |
接下来的 |
O3 |
2.29348 |
| ALA157 |
O |
H53 |
1.79921 |
| HIS57 |
NE2 |
H55 |
2.17054 |
| LYS136 |
哈 |
O5 |
2.5112 |
| GLY137 |
HA1 |
O3 |
3.09817 |
| Asunaprevir |
−2.6431 |
6 |
TYR105 |
HH |
O10 |
2.87824 |
| LEU106 |
接下来的 |
O3 |
1.83884 |
| SER125 |
接下来的 |
O11 |
2.00467 |
| LEU104 |
O |
H95 |
1.59587 |
| SER101 |
HB2 |
CL1 |
2.96175 |
| SER125 |
O |
H80 |
2.7483 |
|
| D168A |
Andrographolide |
−13.9072 |
6 |
SER138 |
接下来的 |
O5 |
2.27611 |
| SER139 |
接下来的 |
O3 |
2.20946 |
| ALA157 |
O |
H53 |
2.59575 |
| HIS57 |
NE2 |
H55 |
1.6014 |
| LYS136 |
哈 |
O5 |
2.20148 |
| SER139 |
HB2 |
O3 |
3.02411 |
| Asunaprevir |
−5.4149 |
8 |
GLN41 |
HE21 |
O8 |
1.65812 |
| HYS57 |
O |
H97 |
1.55407 |
| HYS57 |
HD2 |
O6 |
2.06801 |
| LYS136 |
HE21 |
O10 |
2.77644 |
| GLY137 |
HA1 |
O7 |
2.87646 |
| ARG155 |
O |
H80 |
3.0789 |
| ARG155 |
O |
H92 |
2.76844 |
| GLY137 |
接下来的 |
06 |
2.64645 |
|
|
