TY -的A2 Cantara西尔维亚盟——秦达盟——魏,瑞盟——刘,如果非盟-朱,开明盟——张Shutian AU - Min,李PY - 2019 Da - 2019/12/01 TI -一个循环miRNA-Based由WGCNA建立评分系统预测结肠癌SP - 1571045六世- 2019 AB -
介绍。循环小分子核糖核酸(microrna)执行多种癌症的潜在诊断生物标记。本研究的目的是确定循环microrna在结肠癌诊断的生物标志物。
方法。我们进行了加权基因coexpression网络分析(WGCNA) microrna的表达模式中循环microrna通过使用一个“WGCNA”包r .相关性分析发现癌症相关的模块。差异表达microrna在结肠癌(DEmiRs)由“limma”包r .中心进行基因分析这些DEmiRs癌症相关模块的“亲密”方法cytoscape软件。然后,逻辑回归进行识别的独立危险因素,和一个评分系统构建了基于这些独立的危险因素。然后,我们使用地理数据库的数据来证实这个评分系统的可靠性。
结果。总共有9个独立coexpression模块构建基于WGCNA 848种microrna的表达水平。相关分析后,绿色(
天哪
=
0.77
,
p
=
3
×
10
量
25
),黄色(
天哪
=
0.65
,
p
=
6
×
10
量
16
)模块有紧密的关联与癌症发展。20个枢纽中心后基因被发现在这些DEmiRs cytoscape基因分析。在所有这些中心基因,hsa-miR-23a-3p (
或
=
2.6391
,
p
=
6.23
×
10
量
5
)和hsa - mir - 663 a (
或
=
1.4220
,
p
=
0.0069
)被确定为一个独立的危险因素多元回归的结肠癌。此外,评分系统是建立预测结肠癌的概率是基于这两种microrna,曲线下的面积(AUC)为0.828。数据从GSE106817 GSE112264是用来证实这个评分系统。和他们的AUC是0.980和0.917,分别。
结论。我们建立了一个评分系统基于流通枢纽microrna发现WGCNA预测结肠癌的发展。SN - 2210 - 7177 UR - https://doi.org/10.1155/2019/1571045 - 10.1155 / 2019/1571045摩根富林明分析细胞病理学PB - Hindawi KW - ER