回顾性观察研究来确定PCR的灵敏度和限制测试的检测
结核分枝杆菌和
m . avium复杂。我们获得了呼吸道的临床标本收集,讲究的
结核分枝杆菌或
m . avium复杂,进行PCR分析。共299个样本(
结核分枝杆菌,177;
m . avium,35岁;
m . intracellulare,87)分析COBAS TaqMan PCR从2007年4月到2011年3月。PCR积极性利率50 - 55%,70年100%,88年98%,和100%涂阴,涂片1 + 2 + 3 +组,分别。PCR阳性的肺结核涂片1 + 80.6%,有统计学显著(
P
<
0.001)低于涂片2 + (97.3%)。从2005年1月至2007年3月,我们收集额外的138个样本(
结核分枝杆菌,74;
m . avium21岁;m . intracellulare 43)分析COBAS Amplicor PCR。PCR积极性利率获得使用COBAS TaqMan PCR和COBAS Amplicor PCR没有显著不同。PCR检测分枝杆菌的敏感性是不够的涂片1 +。必须仔细考虑- PCR检测结果的解释在涂片1 +,因为痰检阳性肺结核是隔离的标准。
1。介绍
聚合酶链反应(PCR),这是吴雨霏银行发明的温床,(
1,
2),广泛应用于基础研究和临床医学。特别是在临床医学领域,PCR中扮演一个重要的角色在传染病的早期诊断
3),因为PCR可以检测只有一个副本从致病生物的DNA片段。PCR的效用也被报道的诊断mycobacteriosis [
4,
5],PCR检测的广泛应用
结核分枝杆菌和
m . avium在日本复杂(MAC)。另一方面,与积极的分枝杆菌涂片标本和消极的
结核分枝杆菌PCR测试有时可能会表现出一个积极的
结核分枝杆菌文化的结果。这样的假阴性结果是非常危险的,因为它们可能导致患者造成感染控制的释放风险。我们评估的可靠性和限制PCR检测的检测
结核分枝杆菌,
m . avium,
m . intracellulare与临床情况。我们发现PCR结果有时是不可靠的涂片1 +。
2。方法2.1。研究对象
临床标本收集的呼吸道(痰或获得的样本使用bronchofiberscope (BF))从2005年1月至2011年3月进行了分析。
结核分枝杆菌,
m . avium,或
m . intracellulare从这些标本,培养和PCR的孤立的细菌样本集合的时候执行。
2.2。数据收集
共299个样本(
结核分枝杆菌,177;
m . avium,35岁;和
m . intracellulare,87)从2007年4月至2011年3月,和138个样本(
结核分枝杆菌,74;
m . avium21岁;和
m . intracellulare从2005年1月至2007年3月,43)。每个样本被auramine-rhodamine量化的分枝杆菌染色(
6)和分类根据声明的美国胸科学会
7]。
假阳性结果的评估,我们收集了2061个样本(COBAS TaqMan PCR
结核分枝杆菌,1568;
m . intracellulare,1593;
m . avium1594;COBAS Amplicor PCR为
结核分枝杆菌,505;
m . intracellulare,512;
m . avium508),细菌培养显示没有分枝杆菌生长和PCR检查。样本的已知的分枝杆菌疾病患者消除分析。短暂,假阳性被定义为两个负面文化和积极的PCR结果导致没有已知的分枝杆菌疾病。
m . intracellularePCR积极性利率根据荧光染色法从2007年4月到2011年3月。
荧光染色法
痰
男朋友
总
PCR +
没有
%
PCR +
没有
%
PCR +
没有
%
- - - - - -
10
16
62.5
1
6
16.7
11
22
50.0
1 +
14
14
One hundred.
3
3
One hundred.
17
11
One hundred.
2 +
26
30.
86.7
6
6
One hundred.
32
36
88.9
3 +
12
12
One hundred.
0
0
12
12
One hundred.
总
62年
72年
86.1
10
15
66.7
72年
87年
82.8
旅客:gaffky规模。
男朋友:bronchofiberscopy。
3.4。PCR积极性与COBAS Amplicor方法
表
4显示的结果COBAS Amplicor PCR。PCR的积极性
结核分枝杆菌,
m . avium,
m . intracellulare根据分枝杆菌的数量,几乎是一样获得COBAS TaqMan PCR,表明两者之间没有显著差异PCR测试。
结核分枝杆菌,
m . avium,
m . intracellularePCR积极性利率根据荧光染色法从2005年1月到2007年3月。
荧光染色法
结核分枝杆菌
m . avium
m . intracellulare
PCR +
没有
%
P
*
PCR +
没有
%
P
*
PCR +
没有
%
P
*
- - - - - -
12
18
66.7
0.61
4
7
57.1
0.84
10
12
83.3
0.12
1 +
10
12
83.3
0.83
4
4
One hundred.
1.00
7
9
77.8
0.21
2 +
22
23
95.7
0.36
7
7
One hundred.
0.78
14
15
93.3
0.98
3 +
21
21
One hundred.
1.00
3
3
One hundred.
1.00
7
7
One hundred.
1.00
总
65年
74年
87.8
18
21
85.7
38
43
88.4
旅客:gaffky规模。
*PCR积极性与表中相应的列
1- - - - - -
3。
3.5。假阳性的结果COBAS TaqMan PCR和COBAS Amplicor PCR
表
5显示了结果的假阳性结果COBAS TaqMan PCR和COBAS Amplicor PCR。假阳性的COBAS TaqMan PCR是6/1568(0.38%),3/1593(0.19%)和10/1594(0.63%),在肺结核,
m . avium,
m . intracellulare,分别。假阳性的COBAS AMPLICOR PCR是11/505(2.18%),2/512(0.39%)和1/508(0.20%),在肺结核,
m . avium,
m . intracellulare,分别。
假阳性的结果COBAS TaqMan PCR和COBAS AMPLICOR PCR。
肺结核
m . avium
m . intracellulare
COBAS TaqMan PCR
6/1568
3/1593
10/1594
FP /总数
(0.38%)
(0.19%)
(0.63%)
COBAS AMPLICOR PCR
11/505
2/512
1/508
FP /总数
(2.18%)
(0.39%)
(0.20%)
FP:假阳性。
4所示。讨论
在这项研究中,一种新型PCR方法的灵敏度(COBAS TaqMan测试)是研究通过分析结合分枝杆菌定量PCR阳性的临床样本的荧光染色。详细的数据在PCR的积极性得到COBAS TaqMan测试。关于文化积极的肺结核、PCR积极性在涂片1 + 80.6%,这在统计学上显著低于涂片2 +的积极性(97.3%,
P
<
0.001)和涂片3 + (100%,
P
=
0.006)。没有统计上的显著差异之间的积极性涂片1 +和结核病整体(分别为80.6%和86.4%,
P
=
0.36通过卡方检验)。这表明我们应该更注意消极的解释在涂片1 + PCR测试的结果。
PCR阳性结果COBAS TaqMan PCR给出表
1- - - - - -
3。的
结核分枝杆菌PCR积极性涂片1 +组为80.6%,显著低于在涂片2 +组(97.3%)(
P
<
0.001通过卡方检验)。我们的研究结果表明,PCR的结果并不总是准确涂阴和1 +案例。
m . avium和
m . intracellularePCR积极性利率与分枝杆菌的数量增加,被荧光染色法(表
2和
3)。然而,PCR积极性涂片1 +和涂片2 +组在统计学上没有显著不同。样本大小可能不是足够大来检测微小的差异。
有四个
m . intracellularePCR-negative涂片2 +组样品,
m . intracellularePCR积极性涂片2 +组为88.9%,略低于
结核分枝杆菌和
m . avium。然而,差异无统计学意义(
P
=
0.07相比,通过卡方检验)
结核分枝杆菌PCR积极性。此外,
m . intracellularePCR涂片1 +组的积极性是一样的
结核分枝杆菌和
m . avium。因此,我们得出结论,PCR的检测的灵敏度
m . intracellulare不是劣质的吗
结核分枝杆菌和
m . avium。
样本的数量获得使用一个男朋友(4、5、15的样本
结核分枝杆菌,
m . avium,
m . intracellulare、职责)是不够的进行分析。男朋友似乎的敏感性低于痰总体的结果,但PCR痰检阳性组的积极性似乎不错。